MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mannheimia haemolytica USDA-ARS-SAM-185

Total Repeats: 6502

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_020834	AG	3	6	605976	605981	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_020834	T	7	7	607470	607476	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_020834	T	7	7	607502	607508	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_020834	TG	4	8	607544	607551	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_020834	TAA	2	6	607569	607574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_020834	TAA	2	6	608476	608481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_020834	ATA	2	6	609156	609161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_020834	T	7	7	609209	609215	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_020834	T	6	6	609218	609223	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_020834	A	6	6	611401	611406	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_020834	ATTT	2	8	614978	614985	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_020834	GTGTT	2	10	614994	615003	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_020834	A	6	6	615014	615019	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_020834	ATCA	2	8	615039	615046	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1515	NC_020834	AAATGA	2	12	615047	615058	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_020834	TAT	2	6	615072	615077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_020834	AT	3	6	615092	615097	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_020834	TAT	2	6	615101	615106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_020834	ATAA	2	8	615154	615161	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_020834	A	6	6	615160	615165	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_020834	TAA	2	6	615217	615222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_020834	A	6	6	615221	615226	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_020834	TAT	2	6	616653	616658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_020834	A	6	6	616675	616680	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_020834	GGTT	2	8	620445	620452	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_020834	TC	3	6	620477	620482	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1527	NC_020834	ATC	2	6	620500	620505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1528	NC_020834	CAAC	2	8	625471	625478	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1529	NC_020834	TC	3	6	625482	625487	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1530	NC_020834	TGT	2	6	625529	625534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_020834	A	6	6	625566	625571	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_020834	TCT	2	6	625572	625577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1533	NC_020834	A	6	6	625623	625628	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_020834	TC	3	6	627354	627359	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1535	NC_020834	ATC	3	9	627418	627426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1536	NC_020834	CCT	2	6	630911	630916	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1537	NC_020834	AGA	2	6	632100	632105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_020834	TTG	2	6	633199	633204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_020834	GAA	2	6	634917	634922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_020834	GTG	2	6	635474	635479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_020834	AAT	2	6	636238	636243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_020834	A	6	6	636247	636252	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_020834	AAC	2	6	638173	638178	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1544	NC_020834	A	6	6	638675	638680	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_020834	TTG	2	6	638706	638711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_020834	ACGG	2	8	638717	638724	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1547	NC_020834	CAGG	2	8	638752	638759	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1548	NC_020834	ATA	2	6	638801	638806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_020834	AAG	2	6	643286	643291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_020834	ATT	2	6	643299	643304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_020834	TGT	2	6	644003	644008	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_020834	AT	3	6	644016	644021	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_020834	G	6	6	644035	644040	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_020834	GATA	2	8	647051	647058	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_020834	A	6	6	647066	647071	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_020834	T	6	6	647100	647105	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_020834	ACT	2	6	651293	651298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1558	NC_020834	T	6	6	651309	651314	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_020834	AAT	2	6	651315	651320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_020834	AT	3	6	651349	651354	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_020834	TA	3	6	651372	651377	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_020834	AATA	2	8	651414	651421	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_020834	T	6	6	651428	651433	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_020834	TAT	2	6	651444	651449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_020834	T	6	6	651515	651520	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_020834	A	6	6	651527	651532	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1568	NC_020834	GGA	2	6	651671	651676	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_020834	AATA	2	8	652416	652423	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_020834	T	6	6	652441	652446	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_020834	T	6	6	654525	654530	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_020834	AAG	2	6	654580	654585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_020834	ATG	2	6	654613	654618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_020834	A	7	7	654621	654627	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_020834	TTTAA	2	10	654628	654637	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_020834	TAT	2	6	654656	654661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_020834	TTA	2	6	654682	654687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_020834	CTGTG	2	10	654693	654702	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1579	NC_020834	T	6	6	654704	654709	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_020834	ATTT	2	8	654754	654761	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_020834	TAT	2	6	654770	654775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_020834	ATTT	2	8	654788	654795	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_020834	A	8	8	654835	654842	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_020834	AAT	2	6	654876	654881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_020834	TTTATT	2	12	654882	654893	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_020834	T	8	8	654901	654908	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_020834	T	7	7	654910	654916	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_020834	GTA	2	6	654957	654962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_020834	TAG	2	6	654963	654968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1591	NC_020834	TTG	2	6	657559	657564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_020834	T	6	6	657579	657584	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_020834	T	6	6	657615	657620	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1596	NC_020834	TAGAAA	2	12	659081	659092	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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1598	NC_020834	TTTA	2	8	659122	659129	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_020834	TA	3	6	661653	661658	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_020834	A	7	7	661691	661697	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_020834	GGT	2	6	661736	661741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_020834	A	7	7	661848	661854	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_020834	ATGT	2	8	661880	661887	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1605	NC_020834	TTG	2	6	661916	661921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_020834	GTT	2	6	661922	661927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_020834	TCA	2	6	661954	661959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1608	NC_020834	T	6	6	662363	662368	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_020834	GAA	2	6	663548	663553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_020834	ATA	2	6	664684	664689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_020834	T	6	6	664740	664745	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_020834	AAAAT	2	10	664748	664757	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_020834	T	7	7	668915	668921	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_020834	T	6	6	668926	668931	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_020834	C	6	6	668969	668974	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1616	NC_020834	AAAG	2	8	671374	671381	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_020834	TTG	2	6	671393	671398	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_020834	TTCGC	2	10	671446	671455	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1619	NC_020834	CTG	2	6	672792	672797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1620	NC_020834	T	7	7	672822	672828	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_020834	A	7	7	674892	674898	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_020834	CT	3	6	677993	677998	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1623	NC_020834	GA	4	8	678009	678016	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_020834	AG	4	8	678048	678055	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_020834	TCT	2	6	678096	678101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1626	NC_020834	GAA	2	6	678106	678111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_020834	AAT	2	6	680745	680750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_020834	CTAT	2	8	680759	680766	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1629	NC_020834	CCT	2	6	680797	680802	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1630	NC_020834	TAAA	2	8	680885	680892	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_020834	TAAT	2	8	682224	682231	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_020834	AATT	2	8	682245	682252	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_020834	TA	3	6	682265	682270	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_020834	T	7	7	682272	682278	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_020834	A	6	6	683769	683774	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1636	NC_020834	A	7	7	683839	683845	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1637	NC_020834	TGA	2	6	683860	683865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1639	NC_020834	T	9	9	683873	683881	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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