MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Mannheimia haemolytica USDA-ARS-SAM-185

Total Repeats: 6502

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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502	NC_020834	GTAC	2	8	184432	184439	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
503	NC_020834	GAA	2	6	184446	184451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
504	NC_020834	TTA	2	6	184808	184813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_020834	GGT	2	6	186185	186190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
506	NC_020834	A	7	7	186218	186224	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_020834	CTG	2	6	186226	186231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_020834	GGA	2	6	186258	186263	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
509	NC_020834	TCC	2	6	186338	186343	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
510	NC_020834	TG	3	6	186365	186370	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
511	NC_020834	CTG	2	6	186390	186395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_020834	AT	4	8	186396	186403	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_020834	CAG	2	6	186404	186409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_020834	GGA	2	6	186426	186431	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
515	NC_020834	TCC	2	6	186506	186511	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
516	NC_020834	AAT	2	6	186526	186531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_020834	ATT	2	6	186536	186541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_020834	TAA	2	6	186557	186562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_020834	GCT	2	6	186572	186577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_020834	T	7	7	186587	186593	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_020834	A	6	6	187717	187722	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_020834	A	6	6	188176	188181	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_020834	T	6	6	188200	188205	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_020834	A	6	6	188208	188213	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_020834	T	6	6	188269	188274	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_020834	CAG	2	6	188986	188991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_020834	ATT	2	6	189034	189039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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529	NC_020834	TCT	2	6	189099	189104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_020834	TA	3	6	189119	189124	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_020834	AGA	2	6	189135	189140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
532	NC_020834	T	6	6	190908	190913	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_020834	ATCA	2	8	194806	194813	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
534	NC_020834	A	6	6	194836	194841	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_020834	TAAA	2	8	194862	194869	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_020834	A	6	6	194867	194872	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_020834	ATT	2	6	194929	194934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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540	NC_020834	A	6	6	196017	196022	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_020834	T	7	7	196058	196064	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_020834	T	7	7	196069	196075	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_020834	A	6	6	196076	196081	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_020834	GTAG	2	8	196155	196162	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
545	NC_020834	CCA	2	6	196330	196335	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
546	NC_020834	ATG	2	6	196421	196426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
547	NC_020834	CGG	2	6	196504	196509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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549	NC_020834	TAAA	2	8	197860	197867	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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551	NC_020834	CATTT	2	10	197938	197947	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
552	NC_020834	A	6	6	197950	197955	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_020834	TCA	2	6	197977	197982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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555	NC_020834	TC	4	8	199175	199182	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
556	NC_020834	GA	3	6	199192	199197	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
557	NC_020834	AG	3	6	201271	201276	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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563	NC_020834	ATTA	2	8	202553	202560	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_020834	ATT	2	6	202567	202572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_020834	A	6	6	202778	202783	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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567	NC_020834	CTTT	2	8	202880	202887	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
568	NC_020834	TTAAAC	2	12	203711	203722	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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570	NC_020834	CTTA	2	8	205659	205666	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
571	NC_020834	GTA	2	6	205714	205719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
572	NC_020834	T	7	7	205771	205777	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_020834	TAC	2	6	206526	206531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_020834	AGT	2	6	206540	206545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
575	NC_020834	ACT	2	6	206569	206574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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581	NC_020834	AG	3	6	212882	212887	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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583	NC_020834	AAG	2	6	213904	213909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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587	NC_020834	ATT	2	6	215622	215627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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589	NC_020834	T	6	6	215661	215666	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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592	NC_020834	ATC	2	6	217312	217317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_020834	TAAAA	2	10	217354	217363	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_020834	TCT	2	6	218811	218816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_020834	TTA	2	6	218856	218861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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598	NC_020834	CTAT	2	8	219880	219887	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
599	NC_020834	T	6	6	219904	219909	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_020834	T	6	6	219937	219942	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_020834	TTGT	2	8	219950	219957	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
602	NC_020834	TAAAT	2	10	219972	219981	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_020834	AAT	2	6	222055	222060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_020834	AGA	2	6	222076	222081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
605	NC_020834	TAT	2	6	222101	222106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_020834	A	6	6	223696	223701	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_020834	TGG	2	6	223703	223708	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
608	NC_020834	T	6	6	224669	224674	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_020834	TAT	2	6	224677	224682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_020834	T	6	6	226295	226300	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_020834	AT	3	6	226481	226486	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_020834	ATTT	2	8	226500	226507	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_020834	TAT	2	6	226518	226523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_020834	T	7	7	227582	227588	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_020834	T	7	7	231494	231500	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_020834	AATATC	2	12	231948	231959	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
617	NC_020834	T	6	6	231966	231971	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_020834	TAT	2	6	231975	231980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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620	NC_020834	ATT	2	6	231991	231996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_020834	AT	3	6	232056	232061	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_020834	ACCG	2	8	232294	232301	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
623	NC_020834	CCT	2	6	236293	236298	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
624	NC_020834	ATG	2	6	236510	236515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
625	NC_020834	GT	3	6	236520	236525	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
626	NC_020834	TTG	2	6	236538	236543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
627	NC_020834	GTTTT	2	10	238522	238531	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
628	NC_020834	A	6	6	238534	238539	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_020834	A	6	6	238589	238594	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_020834	TGA	2	6	238639	238644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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632	NC_020834	C	8	8	238666	238673	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
633	NC_020834	TTTTAT	2	12	238693	238704	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_020834	A	6	6	241502	241507	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_020834	A	6	6	241555	241560	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_020834	TCC	2	6	242696	242701	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
637	NC_020834	TATTTA	2	12	242707	242718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_020834	TTA	2	6	242725	242730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_020834	TTA	2	6	242768	242773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
640	NC_020834	A	7	7	242785	242791	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
641	NC_020834	TCTT	2	8	242803	242810	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
642	NC_020834	A	6	6	242850	242855	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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678	NC_020834	TA	3	6	266859	266864	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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