MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis str. Erdman = ATCC 35801 DNA

Total Repeats: 141

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020559	ACCGCG	2	12	31070	31081	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
2	NC_020559	ACTTCA	2	12	65318	65329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_020559	CGTCGG	2	12	66716	66727	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_020559	CAACGG	2	12	75334	75345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_020559	TCACCT	2	12	79527	79538	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_020559	GGGTCA	2	12	147775	147786	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_020559	ACAGCC	2	12	217793	217804	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
8	NC_020559	GGTCGC	2	12	342441	342452	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_020559	CCGATA	2	12	476835	476846	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_020559	ATAGTC	2	12	544701	544712	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_020559	ACCAGT	2	12	592593	592604	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_020559	CGCCGT	2	12	720890	720901	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
13	NC_020559	CTAGTC	2	12	761336	761347	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_020559	GATACC	2	12	796351	796362	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_020559	AACACA	2	12	811622	811633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_020559	CCGGCG	2	12	863059	863070	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_020559	ACCGGG	2	12	869780	869791	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_020559	GCGGCC	2	12	907094	907105	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_020559	ACAGCA	2	12	908462	908473	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_020559	CTGGGT	2	12	923301	923312	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_020559	CAGTCG	2	12	929512	929523	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_020559	TCGGGT	2	12	963066	963077	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_020559	GTCGAT	2	12	990899	990910	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_020559	GAGCGG	2	12	1021713	1021724	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_020559	CAACGG	2	12	1026853	1026864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_020559	GATCGA	2	12	1026904	1026915	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_020559	GACTGC	2	12	1031308	1031319	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_020559	GGCGCA	2	12	1093077	1093088	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_020559	GGCGCA	2	12	1095611	1095622	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_020559	CCCCGC	2	12	1098285	1098296	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
31	NC_020559	CAATGC	2	12	1122702	1122713	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_020559	TTCCGT	2	12	1161532	1161543	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_020559	GTTGGC	2	12	1168095	1168106	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_020559	CGGCCG	2	12	1190524	1190535	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_020559	AGGCCA	2	12	1339811	1339822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_020559	TCGACA	2	12	1367262	1367273	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_020559	CGGGGA	2	12	1393550	1393561	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_020559	CCGAGT	2	12	1418340	1418351	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_020559	TCGGGG	2	12	1443665	1443676	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_020559	TCCGTT	2	12	1494642	1494653	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_020559	CACGCG	2	12	1520501	1520512	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
42	NC_020559	ATATTC	2	12	1555528	1555539	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_020559	CGTCGA	2	12	1605320	1605331	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_020559	GCCCCT	2	12	1627434	1627445	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_020559	GCCCCT	2	12	1631023	1631034	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_020559	CTGGGC	2	12	1739764	1739775	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_020559	CGAGTG	2	12	1773691	1773702	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_020559	TCGTGG	2	12	1802847	1802858	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_020559	GGCGCC	2	12	1819916	1819927	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_020559	TCCCAC	2	12	1835671	1835682	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_020559	CCGCGG	2	12	1883584	1883595	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_020559	TAGCGG	2	12	1910689	1910700	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_020559	ACCGCA	2	12	1912626	1912637	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
54	NC_020559	GTTCAT	2	12	1972769	1972780	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_020559	GGTGAT	2	12	2032947	2032958	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020559	TTCGGC	2	12	2046855	2046866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_020559	AGAGGG	2	12	2066652	2066663	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020559	ACCGTG	2	12	2133120	2133131	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_020559	GCTGGG	2	12	2135751	2135762	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_020559	CCGCCC	2	12	2148782	2148793	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
61	NC_020559	CGCGAG	2	12	2167624	2167635	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_020559	CGGTTG	2	12	2222018	2222029	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_020559	CGGCTC	2	12	2254236	2254247	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
64	NC_020559	CCAACA	2	12	2335464	2335475	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_020559	CCAACA	2	12	2335542	2335553	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_020559	CCCACC	2	12	2335586	2335597	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
67	NC_020559	GTTGGT	2	12	2335638	2335649	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020559	ATAGAA	2	12	2359894	2359905	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020559	GATTCG	2	12	2390168	2390179	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_020559	CTCAAC	2	12	2402586	2402597	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_020559	CAGCTG	2	12	2415111	2415122	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_020559	CGACTG	2	12	2419827	2419838	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_020559	CCGCTG	2	12	2422964	2422975	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
74	NC_020559	CACCGC	2	12	2431421	2431432	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_020559	TCATCG	2	12	2447952	2447963	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_020559	GCGTCG	2	12	2483735	2483746	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_020559	CACGAC	2	12	2501905	2501916	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
78	NC_020559	CGACGC	2	12	2526275	2526286	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
79	NC_020559	ACGGCG	2	12	2695331	2695342	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_020559	CACGTG	2	12	2704309	2704320	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_020559	GAGGTC	2	12	2707921	2707932	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_020559	CCGGCA	2	12	2721972	2721983	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
83	NC_020559	TCAAAC	2	12	2781911	2781922	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_020559	GCACCC	2	12	2809981	2809992	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_020559	CGACGG	2	12	2858918	2858929	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_020559	GCCCGA	2	12	2866013	2866024	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
87	NC_020559	GTATTG	2	12	2904448	2904459	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020559	CCGTTG	2	12	2914384	2914395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_020559	GGCGCC	2	12	2934072	2934083	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
90	NC_020559	CGGAAG	2	12	2941541	2941552	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_020559	GGTGTG	2	12	2950870	2950881	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020559	CGACTC	2	12	2968527	2968538	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
93	NC_020559	CATATT	2	12	3002120	3002131	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_020559	CCGGCA	2	12	3065849	3065860	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
95	NC_020559	CGTTGC	2	12	3086863	3086874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_020559	GACATC	2	12	3108401	3108412	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_020559	CCCCGC	2	12	3231915	3231926	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
98	NC_020559	CGCGCC	2	12	3278579	3278590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_020559	TCGCCG	2	12	3280195	3280206	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
100	NC_020559	TCGCCG	2	12	3280252	3280263	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
101	NC_020559	CGCCAC	2	12	3296273	3296284	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_020559	GGCCGG	2	12	3301972	3301983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_020559	TCCGAA	2	12	3314821	3314832	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_020559	CGGCGT	2	12	3340566	3340577	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_020559	CGTAGG	2	12	3367362	3367373	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_020559	CGATGC	2	12	3401300	3401311	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_020559	TGTACA	2	12	3416613	3416624	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_020559	ACCAAC	2	12	3421962	3421973	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_020559	CCGTTG	2	12	3443660	3443671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_020559	GCTCCT	2	12	3474043	3474054	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
111	NC_020559	GTTGCC	2	12	3516443	3516454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_020559	GTGCCG	2	12	3586136	3586147	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_020559	GCCTCC	2	12	3625628	3625639	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_020559	CCGGAT	2	12	3698730	3698741	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_020559	TGCCGC	2	12	3721234	3721245	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
116	NC_020559	CGTTGC	2	12	3721357	3721368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_020559	CGCCAC	2	12	3721435	3721446	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_020559	ACCGGG	2	12	3743972	3743983	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_020559	GCGCAG	2	12	3761578	3761589	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_020559	TGTACA	2	12	3780925	3780936	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_020559	TCCTCT	2	12	3864311	3864322	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_020559	CGCTGC	2	12	3877712	3877723	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
123	NC_020559	TCGGAG	2	12	3897838	3897849	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_020559	CCGCTC	2	12	3901867	3901878	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_020559	CGTTGG	2	12	3914507	3914518	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_020559	CGGCCG	2	12	3918647	3918658	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NC_020559	GCGCCG	2	12	3924896	3924907	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_020559	GCGCCG	2	12	3925499	3925510	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_020559	CGACGG	2	12	3925913	3925924	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_020559	CGCCGG	2	12	3926135	3926146	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_020559	GTCGCG	2	12	3941872	3941883	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_020559	CGGCGA	2	12	3989693	3989704	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_020559	GGCGAG	2	12	4091524	4091535	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_020559	TGGCGG	2	12	4180036	4180047	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
135	NC_020559	CTCATC	2	12	4247577	4247588	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_020559	TTCGCC	2	12	4266648	4266659	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
137	NC_020559	CATGGC	2	12	4287711	4287722	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_020559	GGGTTG	2	12	4304842	4304853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_020559	CACCCC	2	12	4334118	4334129	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
140	NC_020559	CCTCCG	2	12	4334132	4334143	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_020559	CGCGGC	2	12	4351031	4351042	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.