MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Morganella morganii subsp. morganii KT

Total Repeats: 142

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020418	TAAATT	2	12	38528	38539	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020418	GTCCCG	2	12	55753	55764	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
3	NC_020418	TTTCTT	2	12	56520	56531	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_020418	ATTTAA	2	12	94144	94155	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020418	CTTTAA	2	12	137245	137256	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_020418	TTGTCT	2	12	157596	157607	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_020418	CGCGCA	2	12	196157	196168	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
8	NC_020418	GCAACC	2	12	226525	226536	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
9	NC_020418	ACCGGG	2	12	287821	287832	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_020418	TGCAAA	2	12	341859	341870	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_020418	ATTTTC	2	12	351984	351995	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_020418	TGAAAA	2	12	359571	359582	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020418	CCTTGT	2	12	419649	419660	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_020418	TATTTT	2	12	444190	444201	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020418	GAATTT	2	12	531886	531897	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020418	ATGAAA	2	12	534836	534847	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020418	GATAAC	2	12	543133	543144	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_020418	TTTTCT	2	12	583560	583571	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_020418	AGGCAT	2	12	584709	584720	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_020418	AATCAG	2	12	585566	585577	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_020418	ATGCTG	2	12	670251	670262	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_020418	GAACCG	2	12	691884	691895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_020418	GTTTTT	2	12	694403	694414	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020418	AAATAA	2	12	700049	700060	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020418	AATGAC	2	12	716562	716573	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_020418	ATATTT	2	12	727372	727383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020418	TCAGAA	2	12	823219	823230	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_020418	CAGAAA	2	12	858261	858272	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_020418	TTATTT	2	12	871044	871055	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020418	CCCTTT	2	12	892739	892750	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_020418	AAAATA	2	12	925960	925971	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020418	GAAACT	2	12	944141	944152	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_020418	GGCAAC	2	12	948712	948723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_020418	GACCGG	2	12	1062117	1062128	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_020418	TAAAAA	2	12	1075574	1075585	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020418	TGCTGA	2	12	1105512	1105523	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_020418	CCCGGT	2	12	1145068	1145079	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
38	NC_020418	CAGAAA	2	12	1152876	1152887	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_020418	GCAGAA	2	12	1224267	1224278	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_020418	ATTTTT	2	12	1230420	1230431	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020418	ACATTT	2	12	1230501	1230512	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_020418	GTTAAC	2	12	1232105	1232116	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_020418	TACGGA	2	12	1235968	1235979	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_020418	TATCAT	2	12	1325318	1325329	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_020418	TTTTCT	2	12	1367165	1367176	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_020418	ACGGAA	2	12	1472279	1472290	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_020418	TTTTTC	2	12	1472921	1472932	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_020418	AATAAA	2	12	1485909	1485920	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020418	TGATTA	2	12	1510242	1510253	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020418	TAAAAA	2	12	1510440	1510451	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020418	AATAAA	2	12	1510688	1510699	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020418	GAGCGG	2	12	1517142	1517153	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_020418	AAACAG	2	12	1536198	1536209	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_020418	AGCCGG	2	12	1587400	1587411	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_020418	AAAAAT	2	12	1640201	1640212	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020418	TAAAAA	2	12	1656549	1656560	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020418	AATACG	2	12	1712656	1712667	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_020418	CTGCCA	2	12	1767164	1767175	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
59	NC_020418	ACGATA	2	12	1828406	1828417	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_020418	AAAAGG	2	12	1840990	1841001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020418	AAAAAT	2	12	1843683	1843694	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020418	GCGGGA	2	12	1890410	1890421	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_020418	GCTTTT	2	12	1941333	1941344	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_020418	ATTTAC	2	12	1941892	1941903	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_020418	AATAAA	2	12	1963159	1963170	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020418	CTTTTG	2	12	1968256	1968267	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_020418	ATATTT	2	12	1986008	1986019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020418	TTTTCC	2	12	2011081	2011092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_020418	TAAAAA	2	12	2091007	2091018	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020418	TTTTTG	2	12	2092515	2092526	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020418	GGGGGA	2	12	2100390	2100401	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020418	CCGGTT	2	12	2118294	2118305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_020418	TATTTT	2	12	2160852	2160863	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020418	AAATAT	2	12	2161313	2161324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020418	TAACAA	2	12	2229335	2229346	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_020418	TCATTT	2	12	2331375	2331386	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_020418	AAAACA	2	12	2337642	2337653	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_020418	GTTTAT	2	12	2337855	2337866	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020418	ACCCGG	2	12	2374374	2374385	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
80	NC_020418	ATAAAA	2	12	2405399	2405410	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020418	GTTATT	2	12	2467297	2467308	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020418	TAAATT	2	12	2527152	2527163	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020418	ACAATA	2	12	2562380	2562391	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_020418	AATTAA	2	12	2562546	2562557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020418	TCTTTG	2	12	2567244	2567255	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_020418	AAAAGC	2	12	2624291	2624302	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_020418	TTTGTT	2	12	2632714	2632725	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020418	TGCGAA	2	12	2656477	2656488	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_020418	ATCATT	2	12	2691136	2691147	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_020418	ATGATT	2	12	2712583	2712594	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020418	CAGTGA	2	12	2748253	2748264	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_020418	CTGTTT	2	12	2822148	2822159	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_020418	GAAAAC	2	12	2826029	2826040	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_020418	CAGTAT	2	12	2835075	2835086	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_020418	CCGGTC	2	12	2855622	2855633	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
96	NC_020418	CGATGG	2	12	2885003	2885014	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_020418	CCTCCC	2	12	2905301	2905312	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
98	NC_020418	AATAAC	2	12	2906469	2906480	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_020418	AGTTTA	2	12	2908328	2908339	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020418	TCACAG	2	12	2919710	2919721	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_020418	ATATTA	2	12	3004977	3004988	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020418	TGCTTT	2	12	3007009	3007020	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_020418	ATTTTC	2	12	3033252	3033263	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_020418	AACAGA	2	12	3070383	3070394	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_020418	AAATGA	2	12	3073751	3073762	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020418	TTACTA	2	12	3096885	3096896	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_020418	TAACAA	2	12	3107843	3107854	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_020418	ATTTTT	2	12	3148671	3148682	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020418	TGAATT	2	12	3149249	3149260	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020418	TCCTTT	2	12	3186988	3186999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_020418	CAGTAT	2	12	3187226	3187237	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_020418	ATAAAA	2	12	3191933	3191944	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020418	GACACA	2	12	3204601	3204612	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_020418	ACAGCG	2	12	3225197	3225208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_020418	CTGATT	2	12	3279817	3279828	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_020418	CAAAAT	2	12	3307310	3307321	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_020418	ACTATT	2	12	3311904	3311915	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_020418	GACAGA	2	12	3327144	3327155	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_020418	GATATC	2	12	3345279	3345290	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_020418	CCATTT	2	12	3353030	3353041	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_020418	AAACAA	2	12	3357256	3357267	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_020418	CAATTT	2	12	3368106	3368117	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_020418	CTTATT	2	12	3376811	3376822	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_020418	TAAGTG	2	12	3429655	3429666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020418	ATTCTT	2	12	3441876	3441887	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_020418	ATAAAA	2	12	3463124	3463135	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020418	ACAGCC	2	12	3472544	3472555	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
128	NC_020418	CTGTTA	2	12	3510728	3510739	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_020418	ATTGTT	2	12	3534159	3534170	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020418	TCATTA	2	12	3601257	3601268	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_020418	CTCCGG	2	12	3617477	3617488	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
132	NC_020418	CGGGGA	2	12	3631397	3631408	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_020418	AAATAT	2	12	3631861	3631872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_020418	CCGCTA	2	12	3662408	3662419	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
135	NC_020418	AGACGA	2	12	3690233	3690244	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
136	NC_020418	ATTACT	2	12	3697106	3697117	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
137	NC_020418	CACACT	2	12	3729966	3729977	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
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139	NC_020418	AATAAA	2	12	3742137	3742148	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_020418	TAAATT	2	12	3742168	3742179	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_020418	TTTAAA	2	12	3750709	3750720	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_020418	CGTTAT	2	12	3758860	3758871	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.