MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Methanosarcina mazei Tuc01

Total Repeats: 989

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020389	AATAA	2	10	10401	10410	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020389	CATGG	2	10	11299	11308	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_020389	TTTCT	2	10	16828	16837	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_020389	TAATT	2	10	17550	17559	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020389	TCTTT	2	10	17580	17589	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_020389	TTTCA	2	10	18527	18536	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_020389	TCAAT	2	10	22976	22985	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_020389	CCGAT	2	10	26907	26916	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
9	NC_020389	TAAAC	2	10	28768	28777	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_020389	ATTTG	2	10	32494	32503	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020389	CTTTC	2	10	32932	32941	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
12	NC_020389	CCGCC	2	10	34644	34653	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
13	NC_020389	CTTTA	2	10	34753	34762	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_020389	ATTTT	2	10	39368	39377	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020389	CAATT	2	10	43038	43047	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_020389	TATAA	2	10	45942	45951	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020389	AATAG	2	10	53029	53038	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020389	CTCTT	2	10	55980	55989	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
19	NC_020389	TATAA	2	10	61831	61840	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020389	TAAAT	2	10	63299	63308	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020389	CTTAA	2	10	65855	65864	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_020389	AAAGA	2	10	70710	70719	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020389	TTATT	2	10	74439	74448	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020389	TAAAA	2	10	74677	74686	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020389	AGAAA	2	10	85982	85991	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020389	AGGTC	2	10	89196	89205	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
27	NC_020389	TTATT	2	10	89464	89473	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020389	TGAAA	2	10	92172	92181	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020389	TGAAA	2	10	92206	92215	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020389	AGATG	2	10	92237	92246	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020389	AGATA	2	10	98222	98231	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020389	CTGAA	2	10	100199	100208	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NC_020389	CTATC	2	10	105665	105674	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
34	NC_020389	AATTT	2	10	110553	110562	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020389	TAAAA	2	10	113692	113701	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020389	AAATA	2	10	113790	113799	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020389	GAAAA	2	10	113877	113886	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020389	CATTT	2	10	114565	114574	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_020389	TGTTT	2	10	130057	130066	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020389	GAAAG	2	10	134962	134971	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020389	ACCTG	2	10	140867	140876	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
42	NC_020389	CTGCC	2	10	142035	142044	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
43	NC_020389	AGCGA	2	10	143033	143042	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
44	NC_020389	AGAAA	2	10	143495	143504	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020389	AAAGG	2	10	151193	151202	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020389	AAAGA	2	10	151280	151289	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020389	AAACA	2	10	158566	158575	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_020389	TCTCT	2	10	160191	160200	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
49	NC_020389	AATTA	2	10	160318	160327	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020389	GTAAT	2	10	174380	174389	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020389	GTGAT	2	10	180139	180148	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020389	ATAAA	2	10	182268	182277	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020389	AGATT	2	10	182561	182570	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020389	AACTG	2	10	183852	183861	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
55	NC_020389	ATTAT	2	10	193394	193403	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020389	TATAT	2	10	193406	193415	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020389	GCATC	2	10	193826	193835	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
58	NC_020389	TAAAA	2	10	193942	193951	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020389	AAAAG	2	10	194068	194077	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020389	TCAAC	2	10	194122	194131	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
61	NC_020389	TTTCT	2	10	194302	194311	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_020389	CAAAA	2	10	195502	195511	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_020389	TCGCT	2	10	195709	195718	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
64	NC_020389	AGATA	2	10	195766	195775	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020389	CAGTA	2	10	195931	195940	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
66	NC_020389	TCGTC	2	10	196602	196611	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
67	NC_020389	GAGCC	2	10	198959	198968	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
68	NC_020389	AACCG	2	10	200865	200874	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
69	NC_020389	AATTA	2	10	201762	201771	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020389	AGGAT	2	10	204690	204699	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020389	AAATT	2	10	206545	206554	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020389	AGGAA	2	10	208473	208482	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020389	GGAAA	2	10	209471	209480	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020389	ACCTG	2	10	211173	211182	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
75	NC_020389	TTCAG	2	10	211252	211261	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
76	NC_020389	ATTAA	2	10	211735	211744	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020389	GTCCA	2	10	212110	212119	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
78	NC_020389	TGGGA	2	10	223540	223549	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020389	TCTCC	2	10	230687	230696	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
80	NC_020389	AAAAT	2	10	240918	240927	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020389	AGTAC	2	10	245961	245970	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
82	NC_020389	ATTAA	2	10	247406	247415	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020389	CTACC	2	10	247560	247569	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
84	NC_020389	AGTGA	2	10	252505	252514	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020389	TTTCC	2	10	255164	255173	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
86	NC_020389	TTCAT	2	10	257255	257264	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_020389	ATAAA	2	10	260769	260778	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020389	GAAGG	2	10	265030	265039	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020389	TTTAA	2	10	270662	270671	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020389	AACTC	2	10	272673	272682	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
91	NC_020389	GTTAA	2	10	277006	277015	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020389	ACAGC	2	10	277814	277823	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
93	NC_020389	AGGGG	2	10	280577	280586	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020389	TGGCA	2	10	283406	283415	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
95	NC_020389	TTAAA	2	10	297987	297996	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020389	ACAGA	2	10	298468	298477	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
97	NC_020389	TAAAT	2	10	301456	301465	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020389	CATTT	2	10	310147	310156	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_020389	GATAA	2	10	311453	311462	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020389	AATAA	2	10	313832	313841	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020389	TTTCC	2	10	315958	315967	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
102	NC_020389	ATATT	2	10	316285	316294	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020389	GTTTT	2	10	316389	316398	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020389	GTTTT	2	10	316408	316417	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020389	ATACA	2	10	328295	328304	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_020389	TGATG	2	10	331726	331735	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020389	ATATA	2	10	331897	331906	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020389	TTAAG	2	10	336659	336668	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020389	ATCAA	2	10	338911	338920	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_020389	CACTG	2	10	342771	342780	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
111	NC_020389	TCTTT	2	10	345271	345280	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_020389	ATTAA	2	10	351285	351294	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020389	AAGAA	2	10	351380	351389	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020389	ATAAA	2	10	351439	351448	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020389	AAGCA	2	10	351543	351552	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
116	NC_020389	AATTA	2	10	361221	361230	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020389	TAAAT	2	10	361886	361895	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020389	AGTCC	2	10	361935	361944	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
119	NC_020389	GTACT	2	10	363643	363652	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
120	NC_020389	ATAAG	2	10	364170	364179	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020389	GGTCT	2	10	373126	373135	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
122	NC_020389	TGATC	2	10	375997	376006	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
123	NC_020389	GTTTC	2	10	377573	377582	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
124	NC_020389	AGAGT	2	10	377786	377795	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020389	AGGAA	2	10	378535	378544	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020389	AGGAG	2	10	380206	380215	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020389	TTTCC	2	10	380298	380307	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
128	NC_020389	CTGTG	2	10	380308	380317	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
129	NC_020389	GATAG	2	10	385636	385645	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020389	ATTTG	2	10	387709	387718	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020389	TTAAC	2	10	404348	404357	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_020389	TAGGG	2	10	409967	409976	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020389	ATGGA	2	10	411009	411018	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
134	NC_020389	TATCT	2	10	411665	411674	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_020389	GAATT	2	10	416084	416093	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_020389	GGAGT	2	10	420855	420864	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
137	NC_020389	GGAGT	2	10	420917	420926	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
138	NC_020389	TATAA	2	10	421048	421057	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_020389	ATCCA	2	10	421451	421460	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
140	NC_020389	CAAGC	2	10	421497	421506	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
141	NC_020389	TTTCC	2	10	432440	432449	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
142	NC_020389	GTCTT	2	10	432568	432577	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
143	NC_020389	TTGAT	2	10	432629	432638	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_020389	GATTT	2	10	441948	441957	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_020389	GCAGG	2	10	450376	450385	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
146	NC_020389	GCTCG	2	10	453110	453119	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
147	NC_020389	TTCCC	2	10	454160	454169	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
148	NC_020389	TCCTG	2	10	454254	454263	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
149	NC_020389	TCCTG	2	10	454452	454461	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
150	NC_020389	CAGTT	2	10	458065	458074	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
151	NC_020389	TGGTG	2	10	459216	459225	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
152	NC_020389	TGCCC	2	10	459614	459623	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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162	NC_020389	AGAAA	2	10	491898	491907	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
163	NC_020389	TAAAA	2	10	498424	498433	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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172	NC_020389	AAAGG	2	10	520845	520854	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
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182	NC_020389	TTCCT	2	10	540092	540101	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
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185	NC_020389	TAATA	2	10	540296	540305	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NC_020389	GGGGA	2	10	545536	545545	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
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193	NC_020389	TAAAA	2	10	564323	564332	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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196	NC_020389	TTCTT	2	10	577163	577172	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
197	NC_020389	ATATA	2	10	596387	596396	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
198	NC_020389	AGCTC	2	10	621917	621926	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
199	NC_020389	CTGCC	2	10	632681	632690	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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287	NC_020389	TTATT	2	10	985828	985837	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
288	NC_020389	TGAAA	2	10	993126	993135	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
289	NC_020389	TTGAA	2	10	1007900	1007909	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
290	NC_020389	AGATG	2	10	1011461	1011470	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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472	NC_020389	ATTTA	2	10	1626213	1626222	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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475	NC_020389	TCAGG	2	10	1639263	1639272	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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477	NC_020389	TATTT	2	10	1642081	1642090	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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