MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis 7199-99 complete genome

Total Repeats: 5962

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020089	TTC	2	6	1534	1539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_020089	CGG	2	6	1643	1648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_020089	TCG	2	6	1801	1806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_020089	ACC	2	6	1848	1853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_020089	TCG	2	6	1866	1871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_020089	ATG	2	6	1889	1894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020089	GTT	3	9	1925	1933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020089	CTG	2	6	1937	1942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_020089	CGT	2	6	1950	1955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_020089	TCG	2	6	1979	1984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_020089	GAA	2	6	5091	5096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020089	AGA	2	6	5141	5146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020089	GTG	2	6	5174	5179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020089	GCG	2	6	5191	5196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_020089	GAG	2	6	5222	5227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020089	CGA	3	9	9830	9838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_020089	GAG	2	6	9859	9864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020089	TCG	2	6	10862	10867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_020089	TCC	2	6	10947	10952	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_020089	ACG	2	6	10977	10982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_020089	GGC	2	6	11022	11027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_020089	TCG	2	6	11030	11035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_020089	CCT	2	6	11083	11088	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_020089	CGG	2	6	11320	11325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_020089	ACG	2	6	11382	11387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_020089	ACC	2	6	11425	11430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_020089	ACC	3	9	11495	11503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_020089	GCC	2	6	11532	11537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_020089	CCG	2	6	11637	11642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_020089	CGA	2	6	11694	11699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_020089	ACT	2	6	11741	11746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_020089	CAT	2	6	11802	11807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_020089	GAC	2	6	11863	11868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_020089	GCC	2	6	12315	12320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_020089	CGG	2	6	12395	12400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_020089	TCG	2	6	13034	13039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_020089	CAC	2	6	13577	13582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_020089	CGG	2	6	13702	13707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_020089	GAC	2	6	14032	14037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_020089	TCG	2	6	23254	23259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_020089	GGT	2	6	23816	23821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020089	TCG	2	6	25458	25463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_020089	CCG	2	6	25559	25564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_020089	CTA	2	6	25594	25599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_020089	TCC	2	6	25611	25616	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_020089	GTT	2	6	25618	25623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020089	TCG	3	9	25738	25746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_020089	GCC	2	6	25752	25757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_020089	AAC	2	6	26864	26869	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_020089	CGT	2	6	26882	26887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_020089	CTT	2	6	26933	26938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_020089	CCT	2	6	27432	27437	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_020089	GTA	2	6	27547	27552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020089	GTC	2	6	29502	29507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_020089	GCC	3	9	29508	29516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_020089	GCG	2	6	31064	31069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_020089	CGG	2	6	31116	31121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_020089	CAA	2	6	31151	31156	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_020089	GAG	2	6	31157	31162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020089	GGC	2	6	31854	31859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_020089	TCG	2	6	31914	31919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_020089	TGC	3	9	31923	31931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_020089	CAC	2	6	31986	31991	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_020089	GAT	2	6	32015	32020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020089	TGG	2	6	33180	33185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020089	CGG	2	6	33895	33900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_020089	GCG	2	6	33916	33921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_020089	TGG	2	6	33977	33982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020089	CGG	2	6	34048	34053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_020089	GGT	2	6	34110	34115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020089	CCA	2	6	34132	34137	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_020089	ACC	2	6	36505	36510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_020089	TCA	2	6	38943	38948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_020089	CAC	2	6	39810	39815	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_020089	TCG	2	6	39832	39837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_020089	GCC	2	6	41206	41211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_020089	GGT	2	6	41267	41272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020089	GAT	2	6	41275	41280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020089	CCG	3	9	41899	41907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_020089	AGC	2	6	41918	41923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_020089	GCC	2	6	42348	42353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_020089	CGT	2	6	43383	43388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_020089	GTG	2	6	43460	43465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020089	CGG	2	6	46459	46464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_020089	CGC	2	6	46514	46519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_020089	CGG	2	6	46526	46531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_020089	GCT	2	6	47316	47321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_020089	GTG	2	6	49980	49985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020089	CCT	2	6	51715	51720	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_020089	ACG	2	6	51746	51751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_020089	ACA	2	6	51794	51799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_020089	TAG	2	6	52686	52691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020089	CCG	2	6	52720	52725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_020089	CAA	2	6	52734	52739	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_020089	GGT	2	6	52758	52763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020089	CGT	2	6	52772	52777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_020089	GTC	2	6	53243	53248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_020089	GCG	2	6	53251	53256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_020089	CGA	2	6	53303	53308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_020089	TCC	2	6	53323	53328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_020089	CGC	2	6	53416	53421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_020089	GAG	2	6	53433	53438	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020089	GCC	2	6	53454	53459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_020089	CCG	2	6	53472	53477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_020089	TGG	2	6	53492	53497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020089	GCC	2	6	53516	53521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_020089	TGC	2	6	57379	57384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_020089	CGC	2	6	58006	58011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_020089	TCG	2	6	58015	58020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_020089	GGT	2	6	58043	58048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020089	CCT	2	6	58115	58120	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_020089	AGG	2	6	58153	58158	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020089	TGA	2	6	58159	58164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020089	GAA	3	9	58516	58524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020089	GCC	2	6	58533	58538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_020089	AGG	2	6	58555	58560	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020089	ATG	2	6	63046	63051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020089	CGG	2	6	63084	63089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_020089	CGT	2	6	63113	63118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_020089	AGG	3	9	63876	63884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020089	TCG	2	6	64959	64964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_020089	CGG	2	6	65360	65365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_020089	GCC	2	6	65513	65518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_020089	GGT	2	6	66801	66806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020089	TGC	2	6	66839	66844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_020089	CTG	2	6	68446	68451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_020089	CTG	2	6	68465	68470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_020089	GCC	3	9	68489	68497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_020089	GCC	2	6	68512	68517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_020089	TCG	2	6	68565	68570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_020089	CGT	2	6	72267	72272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_020089	GCG	2	6	74581	74586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_020089	CGA	3	9	74637	74645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_020089	GAG	2	6	75307	75312	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_020089	CGG	2	6	78999	79004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_020089	CGA	2	6	79081	79086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_020089	GCG	2	6	79146	79151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_020089	CAT	2	6	79155	79160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_020089	CGG	2	6	79225	79230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_020089	GAG	2	6	79261	79266	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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