MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Methanomethylovorans hollandica DSM 15978

Total Repeats: 340

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019977	AGGTG	2	10	8355	8364	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019977	AAGTA	2	10	13365	13374	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019977	CTTTT	2	10	31075	31084	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_019977	TGTGC	2	10	41765	41774	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5	NC_019977	TTTCC	2	10	41780	41789	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
6	NC_019977	GTATG	2	10	47091	47100	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019977	TAATA	2	10	48407	48416	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019977	TTATA	2	10	72383	72392	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019977	ATCTC	2	10	78746	78755	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
10	NC_019977	TTTAC	2	10	80397	80406	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_019977	TTATG	2	10	83517	83526	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019977	TTGAT	2	10	85902	85911	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019977	TAGAA	2	10	89328	89337	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019977	TATTT	2	10	89478	89487	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019977	TAGTG	2	10	100736	100745	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019977	GAGGG	2	10	101409	101418	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019977	TAAAA	2	10	101931	101940	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019977	TACCA	2	10	104513	104522	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
19	NC_019977	ATAAA	2	10	110313	110322	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019977	ACAGT	2	10	114469	114478	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_019977	TAAAA	2	10	134989	134998	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019977	AAGAA	2	10	135043	135052	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019977	CAAAG	2	10	145395	145404	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_019977	AGACA	2	10	156202	156211	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NC_019977	GTATG	2	10	167953	167962	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019977	TTCCT	2	10	187163	187172	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
27	NC_019977	TTATA	2	10	192380	192389	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019977	GCCTC	2	10	203354	203363	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
29	NC_019977	GATAT	2	10	204415	204424	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019977	ATGAT	2	10	204698	204707	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019977	ATTAT	2	10	210537	210546	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019977	ATCGA	2	10	229212	229221	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NC_019977	GGCTC	2	10	229309	229318	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
34	NC_019977	GACGA	2	10	231685	231694	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
35	NC_019977	AACTA	2	10	245112	245121	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_019977	AAGTT	2	10	253831	253840	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019977	CTACC	2	10	266634	266643	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
38	NC_019977	AATAT	2	10	273080	273089	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019977	ATATC	2	10	277693	277702	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_019977	AATTA	2	10	280797	280806	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019977	AAGAT	2	10	296098	296107	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019977	TATCA	2	10	296265	296274	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_019977	TTCTT	2	10	298621	298630	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_019977	AAAGG	2	10	300415	300424	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019977	CTTTT	2	10	302015	302024	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_019977	GTACA	2	10	308096	308105	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
47	NC_019977	TAGAA	2	10	328635	328644	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019977	AATTT	2	10	332850	332859	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019977	CCTTT	2	10	340861	340870	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
50	NC_019977	TGGTG	2	10	363035	363044	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019977	AAATC	2	10	364780	364789	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_019977	AAGAA	2	10	385531	385540	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019977	AATTT	2	10	385803	385812	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019977	GCTTT	2	10	392242	392251	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
55	NC_019977	ATATA	2	10	394126	394135	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019977	AAACA	2	10	405875	405884	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_019977	ATATG	2	10	419320	419329	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019977	TATTT	2	10	422650	422659	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019977	TATAT	2	10	461422	461431	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019977	AACAA	2	10	461463	461472	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_019977	TAAAA	2	10	479358	479367	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019977	AAAAT	2	10	480794	480803	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019977	AGAGA	2	10	496603	496612	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019977	TGCAA	2	10	498260	498269	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
65	NC_019977	AATTT	2	10	498885	498894	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019977	TATGT	2	10	500138	500147	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019977	TCTTT	2	10	512375	512384	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_019977	GTCTT	2	10	512688	512697	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
69	NC_019977	ACTTT	2	10	518248	518257	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_019977	TACAG	2	10	528004	528013	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
71	NC_019977	TGTTT	2	10	533083	533092	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019977	AGTAC	2	10	534737	534746	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
73	NC_019977	CAATG	2	10	537275	537284	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
74	NC_019977	TAGAA	2	10	552280	552289	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019977	CTGTC	2	10	554376	554385	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
76	NC_019977	TAAAT	2	10	567481	567490	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019977	CGATA	2	10	573404	573413	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
78	NC_019977	TTTCT	2	10	581291	581300	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_019977	AATCA	2	10	594710	594719	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_019977	GAATT	2	10	594742	594751	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019977	TTTTC	2	10	606497	606506	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_019977	TTTAG	2	10	608935	608944	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019977	AATTC	2	10	619010	619019	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_019977	TGCTT	2	10	619407	619416	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
85	NC_019977	GCGAA	2	10	622386	622395	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
86	NC_019977	CATGG	2	10	622456	622465	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
87	NC_019977	ATAAA	2	10	622747	622756	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019977	AAGGT	2	10	656177	656186	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019977	AATAT	2	10	661796	661805	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019977	AAATC	2	10	683152	683161	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_019977	TCTCG	2	10	691006	691015	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
92	NC_019977	GAGAT	2	10	691023	691032	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
93	NC_019977	GAAGG	2	10	696782	696791	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019977	GAACT	2	10	707606	707615	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
95	NC_019977	CAGTC	2	10	708070	708079	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
96	NC_019977	TATAT	3	15	716663	716677	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019977	GGGTA	2	10	717140	717149	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019977	CAATG	2	10	719360	719369	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
99	NC_019977	TTATT	2	10	728894	728903	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_019977	AGATG	2	10	729767	729776	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
101	NC_019977	CAGAA	2	10	731748	731757	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
102	NC_019977	GTTAA	2	10	742671	742680	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_019977	CATAT	2	10	748224	748233	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_019977	AAAAC	2	10	750402	750411	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_019977	AAGGT	2	10	759740	759749	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019977	AAATA	2	10	769169	769178	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_019977	TTCTT	2	10	770383	770392	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_019977	TAGAA	2	10	773889	773898	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019977	GATGT	2	10	781762	781771	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
110	NC_019977	ATGAT	2	10	821662	821671	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019977	ATGGA	2	10	826218	826227	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019977	TTTTG	2	10	828166	828175	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_019977	ATAAA	2	10	830154	830163	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019977	TTGTT	2	10	856062	856071	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019977	CTTTT	2	10	858475	858484	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_019977	TATAT	2	10	859126	859135	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_019977	AAAAT	2	10	860972	860981	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_019977	CATGG	2	10	861749	861758	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
119	NC_019977	CAAAG	2	10	873246	873255	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
120	NC_019977	CTTTT	2	10	892541	892550	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_019977	TTTAT	2	10	900135	900144	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019977	AAATG	2	10	900319	900328	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019977	GAAAT	2	10	902815	902824	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_019977	TCAGT	2	10	907365	907374	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
125	NC_019977	TTATT	2	10	908938	908947	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_019977	GAAAG	2	10	920853	920862	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019977	ATAGT	2	10	945059	945068	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_019977	TAATA	2	10	955722	955731	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_019977	ATAAA	2	10	962469	962478	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_019977	TATAA	2	10	993849	993858	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_019977	AAAGC	2	10	1014766	1014775	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
132	NC_019977	TTAAC	2	10	1019832	1019841	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_019977	CATCT	2	10	1047024	1047033	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
134	NC_019977	CTAAT	2	10	1048350	1048359	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_019977	TTCCT	2	10	1051000	1051009	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
136	NC_019977	TATTT	2	10	1054382	1054391	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_019977	ATTAT	2	10	1057862	1057871	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_019977	CATTT	2	10	1058238	1058247	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_019977	TAACT	2	10	1062019	1062028	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_019977	CAATA	2	10	1062748	1062757	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_019977	ATATG	2	10	1069395	1069404	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_019977	TTCAT	2	10	1079836	1079845	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_019977	GAATA	2	10	1087095	1087104	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_019977	GATAT	2	10	1105868	1105877	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_019977	TACTT	2	10	1121108	1121117	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_019977	CATCT	2	10	1121256	1121265	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
147	NC_019977	TTTAA	2	10	1121325	1121334	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.