MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Methanomethylovorans hollandica DSM 15978

Total Repeats: 3945

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019977	AGT	2	6	52	57	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019977	TAT	2	6	79	84	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019977	TAA	2	6	413	418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019977	GAA	2	6	443	448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019977	TAG	2	6	478	483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019977	AGA	2	6	513	518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019977	CTT	2	6	530	535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_019977	TAC	2	6	4240	4245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_019977	CTT	2	6	4325	4330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_019977	ATG	2	6	8332	8337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019977	TTA	2	6	8369	8374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019977	CAG	2	6	8956	8961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_019977	TCC	2	6	10911	10916	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_019977	TCC	2	6	13172	13177	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_019977	ATG	2	6	13284	13289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019977	GCT	2	6	13319	13324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_019977	CTT	2	6	13350	13355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_019977	AGA	2	6	13422	13427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019977	CCA	2	6	20366	20371	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_019977	CAT	2	6	22820	22825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_019977	ACT	2	6	28000	28005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_019977	TTC	2	6	28014	28019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_019977	GCT	2	6	28069	28074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_019977	ATA	2	6	28242	28247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019977	CTA	2	6	30933	30938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_019977	GAA	2	6	30989	30994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019977	AAT	2	6	31118	31123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019977	TAG	2	6	31130	31135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019977	AGG	2	6	31403	31408	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019977	GGA	2	6	32925	32930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019977	GGT	2	6	33657	33662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019977	GAA	2	6	33678	33683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019977	TCA	2	6	33711	33716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_019977	ATG	2	6	33747	33752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019977	AGG	2	6	33811	33816	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019977	AGC	2	6	35438	35443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_019977	AGG	2	6	37844	37849	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019977	ATT	2	6	41423	41428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019977	ATA	2	6	41482	41487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019977	TAT	2	6	41621	41626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019977	ATT	2	6	42973	42978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019977	GGT	2	6	45349	45354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019977	TAA	2	6	47144	47149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019977	ATT	2	6	47194	47199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019977	CAG	2	6	47215	47220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_019977	ATC	2	6	47356	47361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_019977	CTG	2	6	47383	47388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_019977	AAT	2	6	48315	48320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019977	TAG	2	6	48357	48362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019977	TTC	2	6	48366	48371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_019977	ATT	2	6	48391	48396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019977	TAT	2	6	48421	48426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019977	TAA	2	6	53116	53121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019977	TGC	2	6	53554	53559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_019977	CAT	2	6	54231	54236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_019977	GCA	2	6	54314	54319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_019977	AAT	2	6	56450	56455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019977	ATC	2	6	59262	59267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_019977	TTA	2	6	59276	59281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019977	TAA	2	6	62805	62810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019977	ATT	2	6	63498	63503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019977	AAT	2	6	63508	63513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019977	TAA	2	6	63524	63529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019977	AGT	2	6	63573	63578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019977	ATC	2	6	63699	63704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_019977	AAG	2	6	63754	63759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019977	ATC	2	6	63778	63783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_019977	ACA	2	6	63796	63801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_019977	TTC	2	6	63807	63812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_019977	TAG	2	6	63835	63840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019977	ATA	3	9	63951	63959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019977	CAC	2	6	67747	67752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_019977	GCT	2	6	67788	67793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_019977	TAA	2	6	67800	67805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019977	TTC	2	6	67850	67855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_019977	GAT	2	6	67866	67871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019977	TCT	2	6	68040	68045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_019977	ACA	2	6	68046	68051	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_019977	ATT	2	6	68198	68203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019977	GCA	2	6	80496	80501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_019977	ATA	2	6	80536	80541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019977	CTT	2	6	81956	81961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_019977	TGC	2	6	82043	82048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_019977	TGT	2	6	82767	82772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019977	TGG	2	6	82818	82823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019977	TCA	3	9	82906	82914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_019977	CAG	2	6	82929	82934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_019977	ATC	2	6	83013	83018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_019977	TGA	2	6	83143	83148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019977	ACA	2	6	83845	83850	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_019977	GTG	2	6	83879	83884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019977	TTA	2	6	85293	85298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_019977	TAA	2	6	85412	85417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019977	AAG	2	6	85887	85892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019977	TTA	2	6	86059	86064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019977	ATT	2	6	86077	86082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019977	CAA	2	6	86090	86095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_019977	CTT	2	6	88195	88200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_019977	GAG	2	6	88227	88232	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_019977	TTC	2	6	88293	88298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_019977	AGA	2	6	88312	88317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_019977	CAA	2	6	88351	88356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_019977	AGA	3	9	88456	88464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019977	TAT	2	6	88468	88473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019977	CAT	2	6	88529	88534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_019977	TAA	3	9	88576	88584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_019977	TGC	2	6	88841	88846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_019977	ATC	2	6	88891	88896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_019977	ATT	2	6	88911	88916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_019977	AAG	2	6	88945	88950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019977	TGG	2	6	88997	89002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019977	ATT	2	6	89105	89110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_019977	AGA	2	6	89187	89192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019977	CCT	2	6	89360	89365	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_019977	ATA	2	6	91834	91839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_019977	ATC	2	6	92491	92496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_019977	GAT	2	6	98029	98034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_019977	TAT	2	6	99014	99019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019977	TTA	2	6	99139	99144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_019977	GAA	2	6	100421	100426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_019977	CTT	2	6	100439	100444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_019977	AGT	2	6	100492	100497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019977	ATG	2	6	100498	100503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_019977	GTA	2	6	100587	100592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_019977	ACA	2	6	100892	100897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_019977	AAT	2	6	101057	101062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019977	CAA	2	6	101088	101093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_019977	TAT	2	6	101241	101246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_019977	TGG	2	6	101305	101310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_019977	AAT	2	6	101332	101337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_019977	TTC	2	6	101371	101376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_019977	GCT	2	6	101388	101393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_019977	CAA	2	6	101459	101464	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_019977	ATC	2	6	101584	101589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_019977	ATA	2	6	101635	101640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_019977	TAT	2	6	101644	101649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_019977	CTT	2	6	101656	101661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_019977	AGC	2	6	101699	101704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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140	NC_019977	TTA	2	6	101763	101768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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