MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium smegmatis JS623

Total Repeats: 522

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019966	CTGTC	2	10	446	455	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
2	NC_019966	CACGG	2	10	13623	13632	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3	NC_019966	CGACG	2	10	27961	27970	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4	NC_019966	GAATC	2	10	29589	29598	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_019966	GTGCC	2	10	65190	65199	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
6	NC_019966	CGATG	2	10	67097	67106	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
7	NC_019966	CCAAC	2	10	68663	68672	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
8	NC_019966	GAGGC	2	10	68759	68768	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
9	NC_019966	CGATC	2	10	72907	72916	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
10	NC_019966	CGGTC	2	10	72930	72939	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
11	NC_019966	CTGGG	2	10	118984	118993	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
12	NC_019966	GCAAG	2	10	128470	128479	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
13	NC_019966	TCGCT	2	10	135036	135045	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
14	NC_019966	CGATG	2	10	145577	145586	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
15	NC_019966	GCGGT	2	10	197593	197602	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
16	NC_019966	TCGCA	2	10	202702	202711	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
17	NC_019966	CGGAG	2	10	227148	227157	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
18	NC_019966	CGGCG	2	10	268112	268121	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
19	NC_019966	TGAGT	2	10	302018	302027	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019966	CGATG	2	10	312424	312433	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
21	NC_019966	CTGTC	2	10	346082	346091	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
22	NC_019966	GGCAG	2	10	353186	353195	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
23	NC_019966	GGGGA	2	10	354740	354749	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019966	CGTTG	2	10	357510	357519	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
25	NC_019966	GGGTC	2	10	400915	400924	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
26	NC_019966	GTCGA	2	10	539258	539267	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
27	NC_019966	CACGG	2	10	541665	541674	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
28	NC_019966	ACGTG	2	10	542526	542535	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
29	NC_019966	CTCTG	2	10	554760	554769	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
30	NC_019966	GCGAC	2	10	575582	575591	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
31	NC_019966	TGAGT	2	10	579422	579431	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019966	AGCGA	2	10	613770	613779	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
33	NC_019966	AGCGA	2	10	613841	613850	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
34	NC_019966	AGCGA	2	10	613912	613921	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
35	NC_019966	GCCCG	2	10	631103	631112	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
36	NC_019966	CTTCG	2	10	631281	631290	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
37	NC_019966	CGGCG	2	10	643674	643683	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
38	NC_019966	TCGCT	2	10	643689	643698	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
39	NC_019966	CGCGA	2	10	654297	654306	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
40	NC_019966	CTCTG	2	10	680414	680423	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
41	NC_019966	TCGGC	2	10	704701	704710	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
42	NC_019966	GGTCG	2	10	721002	721011	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
43	NC_019966	GCGTC	2	10	722732	722741	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
44	NC_019966	CATCT	2	10	723571	723580	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
45	NC_019966	CAACT	2	10	725377	725386	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
46	NC_019966	GTTGG	2	10	727318	727327	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019966	TTTGC	2	10	747853	747862	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
48	NC_019966	TGCCA	2	10	761924	761933	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
49	NC_019966	AGCGT	2	10	764501	764510	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
50	NC_019966	TTCCG	2	10	790094	790103	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
51	NC_019966	AGTGG	2	10	813679	813688	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019966	GACCG	2	10	819350	819359	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
53	NC_019966	CGAGT	2	10	824804	824813	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
54	NC_019966	CGCGA	2	10	828423	828432	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
55	NC_019966	GCGAC	2	10	832234	832243	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
56	NC_019966	CCGGT	2	10	833126	833135	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
57	NC_019966	CGCAG	2	10	839540	839549	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
58	NC_019966	AGCGA	2	10	847903	847912	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
59	NC_019966	TGCGC	2	10	850540	850549	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
60	NC_019966	GCAAC	2	10	856547	856556	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
61	NC_019966	AGCGA	2	10	860152	860161	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
62	NC_019966	GTTCC	2	10	878985	878994	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
63	NC_019966	GTCGT	2	10	878995	879004	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
64	NC_019966	CCGCC	2	10	879028	879037	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
65	NC_019966	GCGGG	2	10	888100	888109	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
66	NC_019966	CCACG	2	10	924054	924063	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
67	NC_019966	CTCTT	2	10	928878	928887	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
68	NC_019966	GCCGA	2	10	929098	929107	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
69	NC_019966	CCAGC	2	10	944799	944808	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
70	NC_019966	GCAAC	2	10	949959	949968	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
71	NC_019966	CTTTT	2	10	955438	955447	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_019966	CGGTA	2	10	958143	958152	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
73	NC_019966	GCAGG	2	10	972649	972658	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
74	NC_019966	CGTGC	2	10	981924	981933	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
75	NC_019966	CTGCC	2	10	1001994	1002003	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
76	NC_019966	GGTGT	2	10	1006831	1006840	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019966	CCTCG	2	10	1017295	1017304	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
78	NC_019966	CGGTC	2	10	1100513	1100522	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
79	NC_019966	CTTGG	2	10	1101558	1101567	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
80	NC_019966	GAGAA	2	10	1106734	1106743	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019966	CGTGC	2	10	1119367	1119376	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
82	NC_019966	AACCT	2	10	1119445	1119454	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
83	NC_019966	AGCGA	2	10	1127813	1127822	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
84	NC_019966	AATTG	2	10	1159590	1159599	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019966	CTGCC	2	10	1165715	1165724	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
86	NC_019966	CCGAC	2	10	1184125	1184134	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
87	NC_019966	GCGCA	2	10	1184203	1184212	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
88	NC_019966	CACGG	2	10	1190250	1190259	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
89	NC_019966	GCCGA	2	10	1196230	1196239	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
90	NC_019966	CGACG	2	10	1196752	1196761	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
91	NC_019966	CGGCT	2	10	1220779	1220788	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
92	NC_019966	GTAAC	2	10	1221983	1221992	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
93	NC_019966	GGTGG	2	10	1224443	1224452	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019966	ACACG	2	10	1289332	1289341	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
95	NC_019966	GGGCC	2	10	1290908	1290917	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
96	NC_019966	CTAGC	2	10	1297090	1297099	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
97	NC_019966	GCCCC	2	10	1323164	1323173	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
98	NC_019966	AAATT	2	10	1328079	1328088	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019966	CGCGG	2	10	1330600	1330609	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
100	NC_019966	GGCCG	2	10	1331244	1331253	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
101	NC_019966	GCGCC	2	10	1331371	1331380	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
102	NC_019966	CTCGG	2	10	1341470	1341479	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
103	NC_019966	ATGTG	2	10	1348768	1348777	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019966	CGGCC	2	10	1351756	1351765	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
105	NC_019966	CCGGC	2	10	1429532	1429541	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
106	NC_019966	CGCTC	2	10	1433525	1433534	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
107	NC_019966	TCGGT	2	10	1434421	1434430	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
108	NC_019966	AACCC	2	10	1460564	1460573	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
109	NC_019966	CCACT	2	10	1460721	1460730	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
110	NC_019966	AGCGA	2	10	1488487	1488496	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
111	NC_019966	AGATC	2	10	1497874	1497883	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
112	NC_019966	GTGCG	2	10	1510290	1510299	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
113	NC_019966	ACGAT	2	10	1513683	1513692	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
114	NC_019966	CTCGT	2	10	1518430	1518439	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
115	NC_019966	GCGGT	2	10	1536468	1536477	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
116	NC_019966	CACCG	2	10	1593210	1593219	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
117	NC_019966	ACTTC	2	10	1594288	1594297	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
118	NC_019966	CGTCA	2	10	1599871	1599880	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
119	NC_019966	CTCCG	2	10	1606062	1606071	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
120	NC_019966	CCGCG	2	10	1617114	1617123	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
121	NC_019966	GCTGC	2	10	1624398	1624407	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
122	NC_019966	CGCCC	2	10	1625685	1625694	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
123	NC_019966	CCGGC	2	10	1629101	1629110	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
124	NC_019966	CAAAC	2	10	1637277	1637286	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
125	NC_019966	TTCTA	2	10	1641104	1641113	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_019966	CGGCG	2	10	1642981	1642990	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
127	NC_019966	AACCA	2	10	1646807	1646816	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
128	NC_019966	GCCCC	2	10	1647455	1647464	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
129	NC_019966	GGTAG	2	10	1673172	1673181	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
130	NC_019966	GCCCG	2	10	1679285	1679294	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
131	NC_019966	TCAGG	2	10	1680649	1680658	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
132	NC_019966	TCGCC	2	10	1704386	1704395	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
133	NC_019966	CCGTT	2	10	1704408	1704417	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
134	NC_019966	GGCGT	2	10	1719704	1719713	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
135	NC_019966	TTGCG	2	10	1733262	1733271	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
136	NC_019966	CCTGG	2	10	1739754	1739763	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
137	NC_019966	TTTCG	2	10	1741063	1741072	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
138	NC_019966	GCTCG	2	10	1742782	1742791	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
139	NC_019966	GGATT	2	10	1744650	1744659	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
140	NC_019966	TTTGG	2	10	1744709	1744718	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
141	NC_019966	CGGCC	2	10	1752636	1752645	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
142	NC_019966	AGGTC	2	10	1759239	1759248	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
143	NC_019966	GTCAA	2	10	1767057	1767066	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
144	NC_019966	TACAT	2	10	1770026	1770035	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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419	NC_019966	GCCGA	2	10	5022049	5022058	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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453	NC_019966	CAGCG	2	10	5439075	5439084	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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463	NC_019966	CGGCG	2	10	5550295	5550304	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
464	NC_019966	CAGCC	2	10	5558865	5558874	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
465	NC_019966	CGGCG	2	10	5569964	5569973	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
466	NC_019966	CAGCT	2	10	5579820	5579829	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
467	NC_019966	GCACC	2	10	5604948	5604957	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
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