MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycobacterium smegmatis JS623

Total Repeats: 12562

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_019966	TG	3	6	641530	641535	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_019966	CTG	2	6	643349	643354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_019966	GTC	2	6	643415	643420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_019966	GGC	2	6	643433	643438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_019966	ACCA	2	8	643457	643464	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1006	NC_019966	CGC	2	6	643465	643470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1007	NC_019966	GGT	2	6	643471	643476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_019966	TGGCGT	2	12	643527	643538	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
1009	NC_019966	GCG	2	6	643593	643598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_019966	CGT	2	6	643644	643649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_019966	CGGCG	2	10	643674	643683	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1012	NC_019966	TCGCT	2	10	643689	643698	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1013	NC_019966	ACC	2	6	645299	645304	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1014	NC_019966	TG	3	6	645667	645672	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_019966	GCC	2	6	645725	645730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1016	NC_019966	ATCG	2	8	645801	645808	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1017	NC_019966	CG	3	6	646605	646610	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1018	NC_019966	GGC	2	6	646702	646707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_019966	GCG	2	6	646734	646739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_019966	CCT	2	6	646764	646769	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1021	NC_019966	AAC	2	6	651559	651564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_019966	CA	3	6	651597	651602	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1023	NC_019966	GGCC	2	8	651610	651617	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1024	NC_019966	GCA	2	6	651861	651866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_019966	CGG	2	6	651896	651901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_019966	ACCG	2	8	651905	651912	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1027	NC_019966	GCC	2	6	651921	651926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1028	NC_019966	GC	4	8	651929	651936	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1029	NC_019966	CCCG	2	8	652780	652787	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1030	NC_019966	GCCA	2	8	652891	652898	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1031	NC_019966	GCG	2	6	653484	653489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_019966	TTC	2	6	653502	653507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_019966	AGG	2	6	653520	653525	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_019966	TAT	2	6	653552	653557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_019966	CGACGC	2	12	653612	653623	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
1036	NC_019966	TTC	2	6	654148	654153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_019966	GTT	2	6	654179	654184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_019966	CAC	2	6	654249	654254	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1039	NC_019966	TGC	2	6	654271	654276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_019966	CGCGA	2	10	654297	654306	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1041	NC_019966	GCC	2	6	654386	654391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1042	NC_019966	CCT	2	6	655919	655924	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1043	NC_019966	TCCG	2	8	655930	655937	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1044	NC_019966	TAT	2	6	657797	657802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_019966	ATA	2	6	657809	657814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_019966	GCA	2	6	660435	660440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_019966	AGG	2	6	660494	660499	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_019966	CGA	2	6	660529	660534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_019966	CGT	2	6	661767	661772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_019966	AGA	2	6	661784	661789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_019966	GCG	2	6	661813	661818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_019966	GGC	2	6	661856	661861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_019966	GC	3	6	661891	661896	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1054	NC_019966	CGCGAG	2	12	664882	664893	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_019966	CG	3	6	664916	664921	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1056	NC_019966	ACA	2	6	664999	665004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_019966	TGG	2	6	665023	665028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_019966	CCT	2	6	666569	666574	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1059	NC_019966	ACG	2	6	667076	667081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_019966	ATA	2	6	667082	667087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_019966	TCG	2	6	668850	668855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_019966	TCT	2	6	672830	672835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_019966	GT	3	6	672844	672849	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_019966	CGCT	2	8	672879	672886	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1065	NC_019966	CAC	2	6	672911	672916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1066	NC_019966	ACC	2	6	672918	672923	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1067	NC_019966	ATGGCC	2	12	672937	672948	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1068	NC_019966	TGG	2	6	672955	672960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_019966	GCG	3	9	675227	675235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1070	NC_019966	GC	3	6	675271	675276	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1071	NC_019966	TG	3	6	675984	675989	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_019966	TCA	2	6	676615	676620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_019966	TCC	2	6	676621	676626	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1074	NC_019966	CGGT	2	8	676641	676648	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1075	NC_019966	CCG	2	6	676664	676669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1076	NC_019966	CGT	2	6	676678	676683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1077	NC_019966	CGTCAC	2	12	676737	676748	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
1078	NC_019966	CGA	2	6	676858	676863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1079	NC_019966	TAG	2	6	678466	678471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_019966	AGC	2	6	678512	678517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1081	NC_019966	ACG	2	6	679777	679782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1082	NC_019966	TC	3	6	680396	680401	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1083	NC_019966	CTCTG	2	10	680414	680423	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1084	NC_019966	G	6	6	680430	680435	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_019966	CGC	2	6	680827	680832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1086	NC_019966	C	6	6	683301	683306	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1087	NC_019966	GCG	2	6	683307	683312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1088	NC_019966	GCG	2	6	685274	685279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1089	NC_019966	AGT	2	6	688649	688654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_019966	CCG	2	6	688904	688909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1091	NC_019966	GCCC	2	8	688919	688926	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1092	NC_019966	CGC	2	6	688940	688945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1093	NC_019966	TGC	2	6	689002	689007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_019966	CAG	2	6	690646	690651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1095	NC_019966	CCG	2	6	690652	690657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1096	NC_019966	TG	3	6	691196	691201	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_019966	TTC	2	6	691292	691297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1098	NC_019966	G	6	6	695506	695511	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_019966	CGCC	2	8	699422	699429	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1100	NC_019966	CGT	2	6	699467	699472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_019966	CGG	2	6	700264	700269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_019966	GAT	2	6	700276	700281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_019966	TCGGC	2	10	704701	704710	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1104	NC_019966	ATC	2	6	704721	704726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_019966	CCG	2	6	705933	705938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1106	NC_019966	TCGC	2	8	705989	705996	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1107	NC_019966	GCC	2	6	706849	706854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1108	NC_019966	CGT	2	6	712968	712973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_019966	TCG	2	6	712978	712983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_019966	CGC	2	6	712995	713000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1111	NC_019966	CGC	2	6	713048	713053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1112	NC_019966	CCG	3	9	713116	713124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1113	NC_019966	TGC	2	6	714097	714102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_019966	GGC	2	6	714139	714144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_019966	CGT	2	6	714166	714171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_019966	GAC	2	6	714181	714186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_019966	GGA	2	6	717463	717468	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_019966	CTG	2	6	718372	718377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_019966	GTC	2	6	718378	718383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_019966	GCG	2	6	718384	718389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_019966	TTC	2	6	718950	718955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1122	NC_019966	AGG	2	6	718992	718997	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_019966	CTG	2	6	720211	720216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_019966	TCC	2	6	720720	720725	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1125	NC_019966	GGT	2	6	720728	720733	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_019966	GCA	2	6	720806	720811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_019966	CAGG	2	8	720814	720821	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1128	NC_019966	GGC	2	6	720965	720970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1129	NC_019966	CGC	2	6	720980	720985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1130	NC_019966	TGGT	2	8	720987	720994	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_019966	GGTCG	2	10	721002	721011	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1132	NC_019966	GGC	2	6	721041	721046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1133	NC_019966	TGA	2	6	721049	721054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_019966	TGC	2	6	721154	721159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1136	NC_019966	GGT	2	6	721190	721195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1138	NC_019966	GGT	2	6	721286	721291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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