MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium canettii CIPT 140070008 complete genome

Total Repeats: 158

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019965	AACTTC	2	12	63533	63544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_019965	CAACGG	2	12	76095	76106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_019965	CTCGGT	2	12	148981	148992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_019965	CGCAGA	2	12	183466	183477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_019965	TCGGCG	2	12	183982	183993	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_019965	ACAGCC	2	12	218317	218328	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
7	NC_019965	GGGGCC	2	12	280412	280423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_019965	CTCGCC	2	12	280858	280869	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_019965	GCACGA	2	12	290479	290490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_019965	AGATTC	2	12	331773	331784	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_019965	GGGCCG	2	12	340445	340456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_019965	GTGACC	2	12	389176	389187	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_019965	TGCGGG	2	12	470344	470355	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_019965	GCACCC	2	12	471251	471262	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_019965	CCGATA	2	12	471698	471709	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_019965	ATAGTC	2	12	541269	541280	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_019965	ACCAGT	2	12	589181	589192	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_019965	AGGCCG	2	12	699783	699794	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_019965	CGCCGT	2	12	718244	718255	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
20	NC_019965	CGCGGG	2	12	831136	831147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_019965	CCGGCG	2	12	854165	854176	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_019965	ACCGGG	2	12	860886	860897	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_019965	TCAGTG	2	12	882662	882673	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_019965	GCGGCC	2	12	901759	901770	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_019965	ACAGCA	2	12	903132	903143	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_019965	CTGGGT	2	12	917972	917983	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_019965	TCGGGT	2	12	959070	959081	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_019965	CATCGT	2	12	962266	962277	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_019965	GTCGAT	2	12	984220	984231	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_019965	GAGCGG	2	12	1019070	1019081	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_019965	CAACGG	2	12	1023851	1023862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_019965	GATCGA	2	12	1023899	1023910	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_019965	GACTGC	2	12	1028303	1028314	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_019965	CGCCGG	2	12	1047164	1047175	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_019965	TGGTTT	2	12	1093643	1093654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019965	CAGTCT	2	12	1093739	1093750	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_019965	CAATGC	2	12	1121890	1121901	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_019965	TTCCGT	2	12	1160338	1160349	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_019965	CGGCAC	2	12	1183627	1183638	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
40	NC_019965	TAGCCA	2	12	1208687	1208698	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_019965	AGTTAC	2	12	1234402	1234413	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_019965	AGGCCA	2	12	1351788	1351799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_019965	TCGACA	2	12	1379375	1379386	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_019965	CCGAGT	2	12	1434829	1434840	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_019965	TCGGGG	2	12	1460266	1460277	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_019965	GTCGAA	2	12	1461129	1461140	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_019965	CACGCG	2	12	1540711	1540722	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
48	NC_019965	ATATTC	2	12	1577557	1577568	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_019965	GCCCCT	2	12	1651240	1651251	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_019965	GGCGCC	2	12	1744403	1744414	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_019965	CTGGGC	2	12	1772863	1772874	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_019965	CGAGTG	2	12	1808917	1808928	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_019965	GGCGCC	2	12	1855180	1855191	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_019965	TCCCAC	2	12	1870935	1870946	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_019965	CCGCGG	2	12	1918914	1918925	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_019965	TAGCGG	2	12	1946019	1946030	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_019965	ACCGCA	2	12	1947988	1947999	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
58	NC_019965	GAACGC	2	12	1979742	1979753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_019965	GACAGC	2	12	1980034	1980045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_019965	GCCATC	2	12	1981571	1981582	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
61	NC_019965	CATCGC	2	12	1982395	1982406	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
62	NC_019965	CGTCGC	2	12	1983225	1983236	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
63	NC_019965	GGTGAT	2	12	2062048	2062059	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019965	TTCGGC	2	12	2075987	2075998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_019965	AGTCGC	2	12	2081354	2081365	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_019965	AGAGGG	2	12	2094175	2094186	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019965	GCCGCA	2	12	2107350	2107361	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
68	NC_019965	GCTGGG	2	12	2162833	2162844	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_019965	CGCGAG	2	12	2196402	2196413	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_019965	CGCTTC	2	12	2208166	2208177	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
71	NC_019965	GGCGAA	2	12	2225278	2225289	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_019965	CGGTTG	2	12	2259284	2259295	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_019965	CGGCTC	2	12	2298934	2298945	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
74	NC_019965	TCGGCG	2	12	2303475	2303486	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_019965	ATAGAA	2	12	2418633	2418644	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019965	GATTCG	2	12	2449063	2449074	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_019965	CTCAAC	2	12	2461311	2461322	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_019965	CCGCTG	2	12	2481901	2481912	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
79	NC_019965	GCGTCG	2	12	2548414	2548425	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_019965	CACGAC	2	12	2566585	2566596	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
81	NC_019965	CTGGAC	2	12	2664979	2664990	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_019965	GCCGGG	2	12	2690432	2690443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_019965	GCAACC	2	12	2692181	2692192	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
84	NC_019965	CACGTG	2	12	2770487	2770498	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_019965	GAGGTC	2	12	2774099	2774110	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_019965	CGCCAC	2	12	2846356	2846367	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_019965	TCAAAC	2	12	2848109	2848120	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_019965	GCACCC	2	12	2876185	2876196	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_019965	CGACGG	2	12	2923620	2923631	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_019965	GCCCGA	2	12	2930715	2930726	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
91	NC_019965	GTATTG	2	12	2969151	2969162	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019965	CCGTTG	2	12	2979096	2979107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_019965	GGCGCC	2	12	2998919	2998930	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
94	NC_019965	CGACTC	2	12	3023774	3023785	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
95	NC_019965	CATATT	2	12	3057051	3057062	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_019965	CCGGCA	2	12	3122531	3122542	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
97	NC_019965	CGGGTA	2	12	3146546	3146557	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_019965	CGAACC	2	12	3156534	3156545	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
99	NC_019965	CATCAC	2	12	3226107	3226118	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_019965	GATCCA	2	12	3240498	3240509	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_019965	CCCCGC	2	12	3287576	3287587	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
102	NC_019965	TCGCCG	2	12	3333602	3333613	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
103	NC_019965	TCGCCG	2	12	3333659	3333670	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
104	NC_019965	TCGCCG	2	12	3333716	3333727	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
105	NC_019965	CGCCAC	2	12	3349744	3349755	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_019965	AGGCCG	2	12	3355442	3355453	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_019965	GCGGCC	2	12	3360261	3360272	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NC_019965	CGTAGG	2	12	3418794	3418805	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_019965	CGTGAC	2	12	3429293	3429304	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_019965	CGATGC	2	12	3451456	3451467	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_019965	TGTACA	2	12	3468491	3468502	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_019965	CCGTTG	2	12	3495534	3495545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_019965	CTGTCA	2	12	3530956	3530967	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_019965	TCGACG	2	12	3573899	3573910	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_019965	TCCGCT	2	12	3576786	3576797	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
116	NC_019965	GCCTCC	2	12	3671574	3671585	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_019965	CCGGTG	2	12	3765995	3766006	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_019965	GAAGGC	2	12	3766399	3766410	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_019965	GGGGAT	2	12	3768349	3768360	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_019965	GGATCG	2	12	3769110	3769121	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_019965	CCGATA	2	12	3769484	3769495	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_019965	GTTGAT	2	12	3770422	3770433	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019965	GGCCGC	2	12	3771745	3771756	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_019965	TGCCGC	2	12	3772956	3772967	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
125	NC_019965	CGTTGC	2	12	3773079	3773090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_019965	CGCCAC	2	12	3773205	3773216	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_019965	GTGTCT	2	12	3773607	3773618	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_019965	GTTTTT	2	12	3773897	3773908	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_019965	AATGCA	2	12	3790820	3790831	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_019965	TGTACA	2	12	3823005	3823016	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_019965	GTCGGT	2	12	3874237	3874248	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_019965	CACGTT	2	12	3899484	3899495	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_019965	TCCTCT	2	12	3904763	3904774	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_019965	TCGGAG	2	12	3929071	3929082	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
135	NC_019965	CGTTGG	2	12	3945730	3945741	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
136	NC_019965	CGGCCG	2	12	3949870	3949881	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
137	NC_019965	CGGCAA	2	12	3951191	3951202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_019965	ATTTTG	2	12	3952225	3952236	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_019965	GCGCCG	2	12	3957823	3957834	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140	NC_019965	TGGCGG	2	12	3957992	3958003	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
141	NC_019965	CGCCGG	2	12	3958352	3958363	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_019965	GGCACC	2	12	3958539	3958550	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
143	NC_019965	CGCCGG	2	12	3958697	3958708	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
144	NC_019965	GGCACC	2	12	3958884	3958895	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
145	NC_019965	CGCCGG	2	12	3959042	3959053	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146	NC_019965	GGCACC	2	12	3959229	3959240	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
147	NC_019965	CGCGGG	2	12	3959681	3959692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_019965	GCCGGT	2	12	3960003	3960014	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_019965	CAACGG	2	12	3961199	3961210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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151	NC_019965	CGAACA	2	12	4028513	4028524	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_019965	GGCGAG	2	12	4121912	4121923	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
153	NC_019965	TGGCGG	2	12	4209398	4209409	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
154	NC_019965	GGCGAG	2	12	4263167	4263178	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
155	NC_019965	TTGGTG	2	12	4263246	4263257	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
156	NC_019965	CTCATC	2	12	4276888	4276899	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
157	NC_019965	CATCGC	2	12	4331786	4331797	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
158	NC_019965	GGGTTG	2	12	4334350	4334361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.