MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycobacterium canettii CIPT 140070008 complete genome

Total Repeats: 10004

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_019965	GGC	2	6	1914455	1914460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4002	NC_019965	GCAGT	2	10	1914467	1914476	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4003	NC_019965	GGC	2	6	1914482	1914487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4004	NC_019965	GGGTG	2	10	1914498	1914507	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_019965	GCT	2	6	1914643	1914648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4006	NC_019965	GGC	2	6	1914652	1914657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4007	NC_019965	CGT	2	6	1914668	1914673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4008	NC_019965	CCAG	2	8	1914686	1914693	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4009	NC_019965	GACT	2	8	1914704	1914711	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4010	NC_019965	CCA	2	6	1914726	1914731	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4011	NC_019965	GTC	2	6	1914786	1914791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4012	NC_019965	GCCG	2	8	1914807	1914814	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4013	NC_019965	TGG	2	6	1914844	1914849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_019965	CTGA	2	8	1914883	1914890	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4015	NC_019965	AGG	2	6	1914973	1914978	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_019965	CAT	2	6	1917109	1917114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4017	NC_019965	GCC	2	6	1918784	1918789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4018	NC_019965	ATTG	2	8	1918824	1918831	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_019965	GCT	2	6	1918854	1918859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4020	NC_019965	CGC	2	6	1918867	1918872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4021	NC_019965	CCGCGG	2	12	1918914	1918925	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4022	NC_019965	GCGCC	2	10	1918943	1918952	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
4023	NC_019965	CCT	2	6	1919847	1919852	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4024	NC_019965	TGC	2	6	1919877	1919882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4025	NC_019965	GC	3	6	1919892	1919897	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4026	NC_019965	TGCG	2	8	1919904	1919911	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4027	NC_019965	ACGCC	2	10	1921167	1921176	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
4028	NC_019965	TGCC	2	8	1921206	1921213	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4029	NC_019965	CGA	2	6	1921219	1921224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4030	NC_019965	GCCG	2	8	1925120	1925127	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4031	NC_019965	TGA	2	6	1925147	1925152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_019965	AAC	2	6	1925195	1925200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4033	NC_019965	CGG	2	6	1925262	1925267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4034	NC_019965	CGG	2	6	1925312	1925317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4035	NC_019965	ATG	2	6	1926304	1926309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_019965	GAG	3	9	1926358	1926366	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_019965	GAG	3	9	1926414	1926422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_019965	TGA	2	6	1931789	1931794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_019965	CGT	2	6	1931804	1931809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4040	NC_019965	GGGGT	2	10	1933856	1933865	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_019965	C	6	6	1933883	1933888	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4042	NC_019965	G	6	6	1933924	1933929	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_019965	TGA	2	6	1933939	1933944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_019965	CGG	2	6	1933979	1933984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4045	NC_019965	AAC	2	6	1933999	1934004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4046	NC_019965	TCA	2	6	1934059	1934064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4047	NC_019965	GCG	2	6	1934085	1934090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4048	NC_019965	CCA	2	6	1934213	1934218	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4049	NC_019965	C	6	6	1934244	1934249	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4050	NC_019965	CA	3	6	1934265	1934270	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4051	NC_019965	CTGTG	2	10	1934310	1934319	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
4052	NC_019965	TTG	2	6	1934330	1934335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_019965	TGT	2	6	1934341	1934346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_019965	ACA	2	6	1934374	1934379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4055	NC_019965	GCA	2	6	1934790	1934795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4056	NC_019965	GC	3	6	1940364	1940369	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4057	NC_019965	C	6	6	1940403	1940408	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4058	NC_019965	TGG	2	6	1941602	1941607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_019965	GGGT	2	8	1942603	1942610	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_019965	TAGCGG	2	12	1946019	1946030	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
4061	NC_019965	GCCG	2	8	1947464	1947471	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4062	NC_019965	GGT	2	6	1947615	1947620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_019965	GGC	2	6	1947658	1947663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4064	NC_019965	GCAG	2	8	1947666	1947673	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4065	NC_019965	AGT	2	6	1947743	1947748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_019965	GTC	2	6	1947757	1947762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4067	NC_019965	CGT	2	6	1947792	1947797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4068	NC_019965	CGA	2	6	1947798	1947803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4069	NC_019965	TGA	2	6	1947852	1947857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_019965	CTG	2	6	1947886	1947891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4071	NC_019965	TCGA	2	8	1947916	1947923	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4072	NC_019965	ACCGCA	2	12	1947988	1947999	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
4073	NC_019965	CGA	2	6	1948013	1948018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4074	NC_019965	GCC	2	6	1948667	1948672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4075	NC_019965	TGGG	2	8	1952795	1952802	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
4076	NC_019965	CGT	2	6	1952815	1952820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4077	NC_019965	CGATA	2	10	1952821	1952830	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4078	NC_019965	TCT	2	6	1952879	1952884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4079	NC_019965	A	6	6	1952887	1952892	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_019965	CG	3	6	1952909	1952914	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4081	NC_019965	AC	3	6	1952978	1952983	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4082	NC_019965	GTG	2	6	1953016	1953021	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_019965	CGA	2	6	1953059	1953064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4084	NC_019965	GAC	2	6	1953148	1953153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4085	NC_019965	GCG	2	6	1953345	1953350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4086	NC_019965	ATC	2	6	1953626	1953631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4087	NC_019965	GGGTT	2	10	1953739	1953748	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_019965	GGGA	2	8	1960610	1960617	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_019965	G	6	6	1960754	1960759	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_019965	CGA	2	6	1963669	1963674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4091	NC_019965	AGCGA	2	10	1963680	1963689	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
4092	NC_019965	GAG	2	6	1963694	1963699	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_019965	GAG	2	6	1964527	1964532	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_019965	CGG	2	6	1965411	1965416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4095	NC_019965	TCG	2	6	1965425	1965430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4096	NC_019965	GCC	2	6	1965486	1965491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4097	NC_019965	GGT	2	6	1965492	1965497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_019965	CTG	2	6	1965611	1965616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4099	NC_019965	CGC	2	6	1965727	1965732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4100	NC_019965	TCG	2	6	1965734	1965739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4101	NC_019965	CCG	2	6	1966678	1966683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4102	NC_019965	CCCG	2	8	1966703	1966710	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4103	NC_019965	TCC	2	6	1974496	1974501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4104	NC_019965	CGC	2	6	1974505	1974510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4105	NC_019965	CGT	2	6	1974534	1974539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4106	NC_019965	TCC	2	6	1974553	1974558	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4107	NC_019965	CGC	2	6	1974562	1974567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4109	NC_019965	G	6	6	1976191	1976196	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_019965	CAAC	2	8	1976208	1976215	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4111	NC_019965	TTC	2	6	1976300	1976305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4112	NC_019965	GA	3	6	1976373	1976378	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_019965	CTGG	2	8	1976391	1976398	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4114	NC_019965	GCG	2	6	1976429	1976434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4115	NC_019965	AAG	2	6	1976477	1976482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_019965	TCG	2	6	1976493	1976498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4117	NC_019965	TTC	2	6	1976555	1976560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4118	NC_019965	CTG	2	6	1979537	1979542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4119	NC_019965	TGG	2	6	1979547	1979552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4121	NC_019965	CAC	2	6	1979694	1979699	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4122	NC_019965	GAACGC	2	12	1979742	1979753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4124	NC_019965	GCC	2	6	1979820	1979825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4125	NC_019965	GGT	2	6	1979835	1979840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_019965	GCG	2	6	1979849	1979854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4127	NC_019965	CAC	3	9	1979931	1979939	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4128	NC_019965	CGC	2	6	1979991	1979996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4129	NC_019965	GGTC	2	8	1980018	1980025	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4130	NC_019965	GACAGC	2	12	1980034	1980045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4134	NC_019965	GCT	2	6	1980188	1980193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4383	NC_019965	CGGT	2	8	2052807	2052814	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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