MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycobacterium canettii CIPT 140070008 complete genome

Total Repeats: 10004

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_019965	GCC	2	6	2106336	2106341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4502	NC_019965	CGC	2	6	2106371	2106376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4503	NC_019965	GCC	2	6	2106399	2106404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4504	NC_019965	CCG	2	6	2106409	2106414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4505	NC_019965	CGG	2	6	2106443	2106448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4506	NC_019965	CGC	2	6	2106449	2106454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4507	NC_019965	GCC	2	6	2106486	2106491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4508	NC_019965	GCC	2	6	2106503	2106508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4509	NC_019965	GCC	2	6	2106560	2106565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4510	NC_019965	CAG	2	6	2106584	2106589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4511	NC_019965	GCC	2	6	2106599	2106604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4512	NC_019965	CCG	2	6	2106621	2106626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4513	NC_019965	CGG	2	6	2106646	2106651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4514	NC_019965	GCC	2	6	2106698	2106703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4515	NC_019965	CGC	2	6	2106706	2106711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4516	NC_019965	CAG	2	6	2106722	2106727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4517	NC_019965	CCG	2	6	2106729	2106734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4518	NC_019965	GCC	2	6	2106737	2106742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4519	NC_019965	GCC	2	6	2106746	2106751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4520	NC_019965	CCCG	2	8	2106755	2106762	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4521	NC_019965	CCG	2	6	2106783	2106788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4522	NC_019965	CGG	2	6	2106814	2106819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4523	NC_019965	CCG	2	6	2106831	2106836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4524	NC_019965	CCG	2	6	2106873	2106878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4525	NC_019965	CCG	2	6	2106882	2106887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4526	NC_019965	GCC	2	6	2106890	2106895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4527	NC_019965	CCG	2	6	2106912	2106917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4528	NC_019965	CAC	2	6	2106928	2106933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4529	NC_019965	CCG	2	6	2106957	2106962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4530	NC_019965	GCC	2	6	2106974	2106979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4531	NC_019965	GCC	2	6	2107010	2107015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4532	NC_019965	GCC	2	6	2107037	2107042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4533	NC_019965	CCG	2	6	2107059	2107064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4534	NC_019965	CCG	2	6	2107068	2107073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4535	NC_019965	GC	3	6	2107084	2107089	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4536	NC_019965	AAC	2	6	2107122	2107127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4537	NC_019965	GCG	3	9	2107158	2107166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4538	NC_019965	CCG	2	6	2107168	2107173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4539	NC_019965	CGG	2	6	2107201	2107206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4540	NC_019965	GCC	2	6	2107239	2107244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4541	NC_019965	GC	3	6	2107276	2107281	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4542	NC_019965	GCC	2	6	2107299	2107304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4543	NC_019965	GCCGCA	2	12	2107350	2107361	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
4544	NC_019965	CGC	2	6	2107364	2107369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4545	NC_019965	CGC	3	9	2107403	2107411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4546	NC_019965	CAC	3	9	2107412	2107420	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4547	NC_019965	GCC	2	6	2107428	2107433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4548	NC_019965	CTC	2	6	2107454	2107459	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4549	NC_019965	CCA	2	6	2107508	2107513	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4550	NC_019965	GCA	2	6	2107556	2107561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4551	NC_019965	GGC	2	6	2110028	2110033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4552	NC_019965	GTC	2	6	2110037	2110042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4553	NC_019965	TCGC	2	8	2110126	2110133	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4554	NC_019965	C	6	6	2111651	2111656	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4555	NC_019965	GTTC	2	8	2114536	2114543	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4556	NC_019965	TAC	2	6	2114578	2114583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4557	NC_019965	CGG	2	6	2114602	2114607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4558	NC_019965	TCG	2	6	2114693	2114698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4559	NC_019965	GCT	2	6	2120983	2120988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4560	NC_019965	CTA	2	6	2121025	2121030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4561	NC_019965	TCA	2	6	2121074	2121079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4562	NC_019965	CCACA	2	10	2121081	2121090	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
4563	NC_019965	CTAC	2	8	2122044	2122051	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4564	NC_019965	CCT	2	6	2122770	2122775	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4565	NC_019965	ACG	2	6	2122889	2122894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4566	NC_019965	TTC	2	6	2125671	2125676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4567	NC_019965	CCGG	2	8	2126695	2126702	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4568	NC_019965	GCC	2	6	2126738	2126743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4569	NC_019965	CGG	2	6	2126762	2126767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4570	NC_019965	CAG	2	6	2126806	2126811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4571	NC_019965	CA	3	6	2126841	2126846	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4572	NC_019965	TGT	2	6	2127281	2127286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4573	NC_019965	GCG	2	6	2127311	2127316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4574	NC_019965	ATG	2	6	2127336	2127341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4576	NC_019965	CGG	2	6	2130783	2130788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4577	NC_019965	CGTG	2	8	2130892	2130899	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4578	NC_019965	CTG	2	6	2130924	2130929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4579	NC_019965	TCGT	2	8	2133293	2133300	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4580	NC_019965	CGG	2	6	2133435	2133440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4582	NC_019965	CGC	2	6	2133487	2133492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4583	NC_019965	CTC	3	9	2133512	2133520	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4584	NC_019965	TCG	2	6	2133541	2133546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4585	NC_019965	CGG	2	6	2135051	2135056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4586	NC_019965	GCA	2	6	2135057	2135062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4587	NC_019965	GAG	2	6	2135120	2135125	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4588	NC_019965	AC	3	6	2137254	2137259	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4589	NC_019965	TGC	2	6	2138500	2138505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4590	NC_019965	TGT	2	6	2138513	2138518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4591	NC_019965	GGC	2	6	2139224	2139229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4592	NC_019965	GC	3	6	2139254	2139259	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4593	NC_019965	CGG	2	6	2139262	2139267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4594	NC_019965	CG	3	6	2141426	2141431	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4595	NC_019965	CAG	2	6	2142866	2142871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4596	NC_019965	TGC	2	6	2142873	2142878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4597	NC_019965	CTAAC	2	10	2142937	2142946	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
4598	NC_019965	CGC	2	6	2142989	2142994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4599	NC_019965	CG	3	6	2145790	2145795	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4600	NC_019965	TCGA	2	8	2149670	2149677	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4601	NC_019965	TTC	2	6	2149685	2149690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4602	NC_019965	CGC	2	6	2151536	2151541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4603	NC_019965	GTC	2	6	2153708	2153713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4604	NC_019965	GT	3	6	2153737	2153742	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4605	NC_019965	GTC	2	6	2153771	2153776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4606	NC_019965	CCG	2	6	2153795	2153800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4607	NC_019965	GT	3	6	2153813	2153818	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4608	NC_019965	AGG	2	6	2153820	2153825	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4609	NC_019965	GCTC	2	8	2153934	2153941	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4610	NC_019965	CGA	2	6	2153951	2153956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4611	NC_019965	TC	3	6	2155960	2155965	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4612	NC_019965	TCGGC	2	10	2156944	2156953	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4613	NC_019965	GGTG	2	8	2158067	2158074	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
4614	NC_019965	GC	4	8	2158634	2158641	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4615	NC_019965	GTC	2	6	2158644	2158649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4616	NC_019965	GC	3	6	2159891	2159896	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4617	NC_019965	GGCC	2	8	2159946	2159953	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4618	NC_019965	CAA	2	6	2159956	2159961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4619	NC_019965	ACC	2	6	2160018	2160023	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4620	NC_019965	CGA	2	6	2160025	2160030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4621	NC_019965	CTG	2	6	2160044	2160049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4622	NC_019965	TGC	2	6	2162809	2162814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4623	NC_019965	GCTGGG	2	12	2162833	2162844	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
4624	NC_019965	CAG	2	6	2166936	2166941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4625	NC_019965	CGA	2	6	2166954	2166959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4626	NC_019965	GCG	2	6	2168296	2168301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4627	NC_019965	TGG	2	6	2168747	2168752	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4628	NC_019965	G	6	6	2168751	2168756	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4629	NC_019965	TGA	2	6	2168844	2168849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4632	NC_019965	ACCG	2	8	2169363	2169370	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4633	NC_019965	CA	3	6	2170862	2170867	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4634	NC_019965	ACTC	2	8	2170898	2170905	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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4655	NC_019965	CGGGG	2	10	2187736	2187745	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
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4662	NC_019965	ATT	2	6	2190946	2190951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4663	NC_019965	CG	3	6	2191005	2191010	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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4667	NC_019965	GCCG	2	8	2191627	2191634	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4668	NC_019965	TGG	2	6	2191635	2191640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4763	NC_019965	GTTC	2	8	2225510	2225517	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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