MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium smegmatis JS623 plasmid pMYCSM03

Total Repeats: 262

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019959	TTG	3	9	756	764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019959	CAG	2	6	770	775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_019959	TCT	2	6	2628	2633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_019959	CTG	2	6	2707	2712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_019959	GCC	2	6	2752	2757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_019959	GGC	2	6	2758	2763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_019959	AGC	3	9	2776	2784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_019959	CTC	2	6	3566	3571	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_019959	GGA	2	6	3645	3650	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019959	GCG	2	6	4166	4171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_019959	GCG	2	6	4245	4250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_019959	TGG	2	6	4284	4289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019959	CTC	2	6	4315	4320	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_019959	GTG	2	6	4350	4355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019959	GCC	3	9	7796	7804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_019959	CCG	3	9	7816	7824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_019959	TCC	2	6	12448	12453	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_019959	TGG	2	6	12474	12479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019959	GCC	2	6	18442	18447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_019959	CCG	2	6	18516	18521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_019959	CCG	2	6	18556	18561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_019959	CCA	2	6	18655	18660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_019959	CCA	2	6	18689	18694	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_019959	CGG	2	6	18695	18700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_019959	GCT	2	6	18711	18716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_019959	CGT	2	6	18731	18736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_019959	GAT	2	6	21860	21865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019959	GCC	2	6	23228	23233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_019959	CGA	2	6	23258	23263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_019959	GGA	2	6	23281	23286	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019959	GCC	2	6	26280	26285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_019959	GCC	2	6	26301	26306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_019959	GAG	2	6	26380	26385	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019959	GGT	2	6	26709	26714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019959	AGG	2	6	26766	26771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019959	GTG	2	6	28917	28922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019959	CGA	2	6	28930	28935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_019959	TTG	2	6	31464	31469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019959	CGA	3	9	31490	31498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_019959	TTC	2	6	31509	31514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_019959	GAC	2	6	33571	33576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_019959	CGC	2	6	33598	33603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_019959	ACC	2	6	33679	33684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_019959	TCC	2	6	33688	33693	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_019959	TCG	2	6	33717	33722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_019959	ACC	2	6	33751	33756	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_019959	TTC	2	6	33760	33765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_019959	GAC	2	6	38970	38975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_019959	ACG	2	6	39589	39594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_019959	AGC	2	6	39635	39640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_019959	CAC	2	6	39668	39673	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_019959	CGG	2	6	39687	39692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_019959	GGC	2	6	41299	41304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_019959	CGG	2	6	41336	41341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_019959	TGG	2	6	41386	41391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019959	CGT	2	6	41393	41398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_019959	CAG	2	6	42016	42021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_019959	GCT	2	6	42047	42052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_019959	GTC	2	6	42058	42063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_019959	CCA	2	6	42104	42109	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_019959	GCG	2	6	42116	42121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_019959	TTC	2	6	42132	42137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_019959	CCA	2	6	42140	42145	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_019959	CGA	2	6	42178	42183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_019959	CCG	2	6	42558	42563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_019959	GGC	2	6	42980	42985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_019959	TCG	2	6	42987	42992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_019959	GAC	2	6	43046	43051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_019959	GGT	2	6	43109	43114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019959	GCG	2	6	43182	43187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_019959	GCG	2	6	43200	43205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_019959	GGC	2	6	43211	43216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_019959	CGA	2	6	43222	43227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_019959	GGT	2	6	43235	43240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019959	CGA	2	6	43261	43266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_019959	GGT	2	6	43273	43278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019959	GCG	2	6	43308	43313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_019959	CGC	2	6	43351	43356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_019959	GTG	2	6	43389	43394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019959	GGC	2	6	43421	43426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_019959	CGT	2	6	43429	43434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_019959	CGG	2	6	43441	43446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_019959	CGC	2	6	43504	43509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_019959	GGC	2	6	43559	43564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_019959	GAT	2	6	43574	43579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019959	ATG	2	6	43614	43619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019959	CCG	3	9	47710	47718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_019959	GCG	2	6	47738	47743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_019959	GCG	2	6	52131	52136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_019959	GGT	2	6	52204	52209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019959	GCC	2	6	52249	52254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_019959	TGC	2	6	54377	54382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_019959	GCG	2	6	54396	54401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_019959	CGG	2	6	54465	54470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_019959	ACG	2	6	54509	54514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_019959	TGG	3	9	54576	54584	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019959	CGG	2	6	54594	54599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_019959	TGT	2	6	54619	54624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019959	CGC	2	6	54798	54803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_019959	GCG	2	6	54832	54837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_019959	GTC	2	6	55192	55197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_019959	GTG	2	6	55198	55203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_019959	CTT	2	6	55216	55221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_019959	GTG	2	6	57320	57325	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019959	GTT	2	6	57349	57354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019959	GTG	2	6	57548	57553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_019959	GGT	2	6	57578	57583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019959	CGC	2	6	57631	57636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_019959	TCC	2	6	57709	57714	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_019959	GTA	2	6	57757	57762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019959	GCG	2	6	57773	57778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_019959	CCG	2	6	59429	59434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_019959	GCC	2	6	65030	65035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_019959	ATC	2	6	65053	65058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_019959	GCC	2	6	65745	65750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_019959	GCA	2	6	75475	75480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_019959	GGC	2	6	75488	75493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_019959	GAG	2	6	75576	75581	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019959	GCC	2	6	75593	75598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_019959	GAC	2	6	75690	75695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_019959	CCA	2	6	76566	76571	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_019959	GCG	2	6	76573	76578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_019959	CAC	2	6	78292	78297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_019959	CGC	2	6	78324	78329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_019959	CTG	2	6	86314	86319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_019959	TCC	2	6	88156	88161	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_019959	CCG	2	6	88188	88193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_019959	AAG	2	6	88228	88233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_019959	ACG	2	6	88929	88934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_019959	ATG	2	6	89789	89794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_019959	CTG	2	6	95480	95485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_019959	GGC	2	6	95562	95567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_019959	GCT	2	6	95593	95598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_019959	GCG	2	6	95613	95618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_019959	TGC	2	6	95622	95627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_019959	GCT	2	6	95659	95664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_019959	CGG	2	6	95672	95677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_019959	TGG	2	6	95789	95794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_019959	TCG	2	6	95874	95879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_019959	TGG	2	6	95881	95886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_019959	GAA	2	6	95918	95923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.