MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium smegmatis JS623 plasmid pMYCSM02

Total Repeats: 35

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019958	GGGAT	2	10	3269	3278	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019958	CGTGC	2	10	13299	13308	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3	NC_019958	GCTGC	2	10	18137	18146	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4	NC_019958	CGGCA	2	10	24043	24052	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5	NC_019958	TCGCC	2	10	35260	35269	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
6	NC_019958	AGACG	2	10	41998	42007	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
7	NC_019958	GCCAT	2	10	42766	42775	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
8	NC_019958	CGACA	2	10	49286	49295	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
9	NC_019958	GCGCC	2	10	74939	74948	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
10	NC_019958	CCCGC	2	10	79366	79375	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
11	NC_019958	CGCAC	2	10	91386	91395	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
12	NC_019958	CACCT	2	10	94349	94358	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
13	NC_019958	CAGCT	2	10	111240	111249	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
14	NC_019958	CGTTT	2	10	117089	117098	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_019958	CGACA	2	10	133228	133237	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
16	NC_019958	GTGCA	2	10	133917	133926	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
17	NC_019958	CCGCG	2	10	152860	152869	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
18	NC_019958	GGGGA	2	10	157425	157434	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019958	CGTCA	2	10	161175	161184	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
20	NC_019958	CGAAG	2	10	164303	164312	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
21	NC_019958	GTGCG	2	10	164667	164676	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
22	NC_019958	TTGCA	2	10	168817	168826	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
23	NC_019958	GCCGG	2	10	173695	173704	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
24	NC_019958	CCGAA	2	10	178598	178607	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
25	NC_019958	CGGTC	2	10	179215	179224	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
26	NC_019958	GGCGA	2	10	183391	183400	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
27	NC_019958	TCGCG	2	10	188721	188730	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
28	NC_019958	CACCC	2	10	189846	189855	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
29	NC_019958	GGGTG	2	10	189867	189876	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019958	ACACC	2	10	190710	190719	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
31	NC_019958	GGGTG	2	10	190737	190746	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019958	GCCAA	2	10	195781	195790	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
33	NC_019958	GTTGT	2	10	198053	198062	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019958	CCGGC	2	10	198459	198468	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
35	NC_019958	TGACT	2	10	198529	198538	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.