MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium smegmatis JS623 plasmid pMYCSM02

Total Repeats: 93

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019958	CCAC	2	8	279	286	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
2	NC_019958	CGCT	2	8	1738	1745	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_019958	TTCC	2	8	2098	2105	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_019958	GGGC	2	8	3946	3953	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5	NC_019958	GCCA	2	8	5309	5316	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_019958	CGTT	2	8	5326	5333	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_019958	TTCC	2	8	9032	9039	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_019958	CGGG	2	8	9117	9124	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
9	NC_019958	TTCC	2	8	11472	11479	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_019958	TGAA	2	8	14229	14236	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019958	AAGC	2	8	16549	16556	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_019958	GACC	2	8	18104	18111	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_019958	CCCG	2	8	19879	19886	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
14	NC_019958	CCCA	2	8	19989	19996	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
15	NC_019958	GGCC	2	8	20071	20078	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_019958	GGTG	2	8	20221	20228	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019958	CGCC	2	8	22528	22535	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
18	NC_019958	GTCG	2	8	22784	22791	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_019958	TCGG	2	8	24280	24287	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_019958	ACGC	2	8	24472	24479	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_019958	CGCC	2	8	25900	25907	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
22	NC_019958	CGGC	2	8	27562	27569	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_019958	CGGT	2	8	28193	28200	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_019958	TGGG	2	8	28344	28351	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019958	CACT	2	8	28757	28764	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_019958	CGAT	2	8	30367	30374	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_019958	TCAT	2	8	35158	35165	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_019958	AAGT	2	8	36013	36020	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019958	CACC	2	8	36280	36287	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
30	NC_019958	CAGG	2	8	39543	39550	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_019958	TCCT	2	8	39970	39977	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_019958	GGAC	2	8	49170	49177	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_019958	CCAC	2	8	50896	50903	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
34	NC_019958	ACCG	2	8	50955	50962	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_019958	CCGC	2	8	57134	57141	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
36	NC_019958	ACGG	2	8	57201	57208	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_019958	CGAC	2	8	57755	57762	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_019958	GCCC	2	8	57870	57877	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
39	NC_019958	GCGT	2	8	61252	61259	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_019958	GGAG	2	8	65910	65917	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019958	TGGG	2	8	66462	66469	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019958	CCTA	2	8	67415	67422	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_019958	GCCG	2	8	73659	73666	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_019958	AGCC	2	8	74841	74848	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
45	NC_019958	ATCG	3	12	74927	74938	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_019958	GTTG	2	8	79327	79334	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019958	CGCA	2	8	81297	81304	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_019958	TCCG	2	8	81345	81352	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
49	NC_019958	GGGA	2	8	81571	81578	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019958	GTGC	2	8	83784	83791	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_019958	ATTG	2	8	84174	84181	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019958	GACC	2	8	91412	91419	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
53	NC_019958	CAAC	2	8	91515	91522	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_019958	AAGC	2	8	94477	94484	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_019958	CTGG	2	8	102771	102778	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_019958	TCGG	2	8	103736	103743	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
57	NC_019958	TCCT	2	8	113532	113539	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_019958	TGCT	2	8	114083	114090	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_019958	CGGG	2	8	116564	116571	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
60	NC_019958	CTGG	2	8	119174	119181	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
61	NC_019958	CAGC	2	8	133449	133456	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
62	NC_019958	CGGT	2	8	133755	133762	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
63	NC_019958	AGCC	2	8	134881	134888	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
64	NC_019958	GCCA	2	8	135623	135630	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
65	NC_019958	GTTG	2	8	135886	135893	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019958	CCGC	2	8	135982	135989	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
67	NC_019958	AGCC	2	8	136009	136016	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
68	NC_019958	GACC	2	8	136464	136471	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_019958	TCGG	2	8	136571	136578	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
70	NC_019958	GTAG	2	8	136781	136788	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019958	GGGC	2	8	146961	146968	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
72	NC_019958	TGCC	2	8	148969	148976	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
73	NC_019958	CGTT	2	8	153793	153800	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_019958	CACG	2	8	153837	153844	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
75	NC_019958	ACCC	2	8	154326	154333	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
76	NC_019958	CAGT	2	8	159780	159787	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_019958	GGTG	2	8	164430	164437	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019958	CGAT	2	8	164631	164638	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_019958	CGGG	2	8	167573	167580	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
80	NC_019958	GGCC	2	8	169325	169332	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_019958	ACCA	2	8	172248	172255	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_019958	CAAC	2	8	172364	172371	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_019958	CCGG	2	8	174151	174158	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_019958	GTCG	2	8	174166	174173	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NC_019958	TCCT	2	8	174585	174592	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_019958	CGGC	2	8	178435	178442	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_019958	TGGG	3	12	178455	178466	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019958	CGTC	2	8	183552	183559	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
89	NC_019958	TGAT	2	8	183576	183583	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019958	CTGA	2	8	186479	186486	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_019958	ACGC	2	8	189829	189836	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
92	NC_019958	ATTC	2	8	190934	190941	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_019958	GTGG	2	8	198085	198092	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.