MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Mycobacterium smegmatis JS623 plasmid pMYCSM02

Total Repeats: 781

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019958	CAC	2	6	49	54	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_019958	CCG	2	6	73	78	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_019958	CG	3	6	77	82	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_019958	GC	3	6	130	135	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_019958	AC	4	8	256	263	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_019958	CCA	2	6	265	270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_019958	CCAC	2	8	279	286	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
8	NC_019958	ACA	2	6	309	314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_019958	GCA	2	6	319	324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_019958	G	6	6	338	343	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019958	CAG	2	6	383	388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_019958	CAC	2	6	446	451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_019958	CCT	2	6	1097	1102	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_019958	CG	3	6	1123	1128	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_019958	GTG	2	6	1178	1183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019958	GCG	2	6	1198	1203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_019958	ACG	2	6	1293	1298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_019958	CCG	2	6	1316	1321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_019958	ACC	2	6	1330	1335	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_019958	ACA	2	6	1410	1415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_019958	TG	3	6	1437	1442	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019958	GCC	2	6	1495	1500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_019958	CGCT	2	8	1738	1745	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
24	NC_019958	TTCC	2	8	2098	2105	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_019958	TGG	2	6	2369	2374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019958	CCG	2	6	2996	3001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_019958	GTC	2	6	3247	3252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_019958	GGGAT	2	10	3269	3278	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019958	CGG	2	6	3701	3706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_019958	GGT	2	6	3752	3757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019958	GCT	2	6	3784	3789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_019958	GTT	2	6	3891	3896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019958	CGA	2	6	3903	3908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_019958	GAG	2	6	3927	3932	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019958	GGGC	2	8	3946	3953	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
36	NC_019958	TCG	2	6	3981	3986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_019958	CAT	2	6	4025	4030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_019958	ATC	2	6	4078	4083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_019958	CCT	2	6	4849	4854	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_019958	GGC	2	6	4880	4885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_019958	GGA	2	6	4893	4898	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019958	TTC	2	6	5288	5293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_019958	GCCA	2	8	5309	5316	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
44	NC_019958	CGTT	2	8	5326	5333	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_019958	AAT	2	6	7456	7461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019958	GCC	2	6	7562	7567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_019958	G	6	6	8030	8035	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019958	ACC	2	6	8355	8360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_019958	CG	3	6	8371	8376	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_019958	CGG	2	6	8444	8449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_019958	CGG	2	6	8491	8496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_019958	CTCCGA	2	12	8955	8966	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
53	NC_019958	ACG	2	6	9005	9010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_019958	CGG	2	6	9015	9020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_019958	TTCC	2	8	9032	9039	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_019958	CGT	2	6	9094	9099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_019958	CGGG	2	8	9117	9124	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
58	NC_019958	GCC	2	6	9166	9171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_019958	GTG	2	6	9192	9197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019958	TCC	2	6	9364	9369	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_019958	GTC	2	6	9379	9384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_019958	CCG	2	6	9392	9397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_019958	TGC	2	6	9425	9430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_019958	GAG	2	6	9440	9445	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019958	TCC	2	6	9452	9457	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_019958	TG	3	6	9920	9925	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019958	CGC	2	6	9932	9937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_019958	CCG	2	6	10278	10283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_019958	GCT	2	6	10357	10362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_019958	CTC	2	6	10384	10389	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_019958	GCG	2	6	10489	10494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_019958	TTCC	2	8	11472	11479	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_019958	GAT	2	6	11480	11485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019958	TCG	2	6	11499	11504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_019958	CGTGC	2	10	13299	13308	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
76	NC_019958	GTG	2	6	13335	13340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019958	GC	3	6	14210	14215	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_019958	T	6	6	14220	14225	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019958	TGAA	2	8	14229	14236	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019958	CGA	2	6	14241	14246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_019958	CGT	2	6	14280	14285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_019958	GCC	2	6	15012	15017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_019958	GGC	2	6	16096	16101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_019958	GCC	2	6	16189	16194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_019958	CGA	2	6	16498	16503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_019958	CGG	2	6	16507	16512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_019958	CCG	2	6	16518	16523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_019958	AAGC	2	8	16549	16556	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_019958	ACC	2	6	16557	16562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_019958	CGA	2	6	16642	16647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_019958	CCG	2	6	16731	16736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_019958	CGGTCT	2	12	17940	17951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_019958	GAC	2	6	17982	17987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_019958	CGA	3	9	18026	18034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_019958	GC	3	6	18070	18075	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
96	NC_019958	GACC	2	8	18104	18111	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
97	NC_019958	GCTGC	2	10	18137	18146	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
98	NC_019958	TCG	2	6	19082	19087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_019958	TCA	2	6	19594	19599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_019958	GCG	2	6	19612	19617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_019958	GC	3	6	19656	19661	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_019958	CGG	2	6	19678	19683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_019958	CAT	2	6	19720	19725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_019958	CGG	2	6	19732	19737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_019958	GCT	2	6	19803	19808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_019958	CCCG	2	8	19879	19886	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
107	NC_019958	AAC	2	6	19964	19969	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_019958	CCCA	2	8	19989	19996	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
109	NC_019958	CCA	2	6	20050	20055	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_019958	GGCC	2	8	20071	20078	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
111	NC_019958	GTC	2	6	20087	20092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_019958	GTT	2	6	20138	20143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_019958	CTCACC	2	12	20164	20175	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_019958	GGTG	2	8	20221	20228	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019958	CCG	2	6	20256	20261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_019958	GCA	2	6	20268	20273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_019958	CA	3	6	20272	20277	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_019958	GGC	2	6	20283	20288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_019958	GCA	2	6	21899	21904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_019958	CGCC	2	8	22528	22535	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
121	NC_019958	GGT	2	6	22542	22547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019958	GCT	2	6	22578	22583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_019958	CTC	2	6	22648	22653	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_019958	CGT	2	6	22685	22690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_019958	CAC	2	6	22721	22726	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_019958	GTCG	2	8	22784	22791	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
127	NC_019958	CAA	2	6	22814	22819	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_019958	ATC	2	6	23754	23759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_019958	TCG	3	9	24030	24038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_019958	CGGCA	2	10	24043	24052	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
131	NC_019958	TCC	2	6	24273	24278	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_019958	TCGG	2	8	24280	24287	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
133	NC_019958	GCT	2	6	24303	24308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_019958	CGA	3	9	24352	24360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_019958	TGG	2	6	24388	24393	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_019958	CGG	2	6	24400	24405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_019958	CAC	2	6	24434	24439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_019958	ACGC	2	8	24472	24479	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
139	NC_019958	ACG	2	6	24480	24485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_019958	CGA	2	6	24546	24551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_019958	CCT	2	6	25852	25857	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
142	NC_019958	CGT	2	6	25877	25882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_019958	CGCC	2	8	25900	25907	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
144	NC_019958	CG	3	6	25961	25966	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
145	NC_019958	CGA	2	6	27500	27505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_019958	CGC	2	6	27516	27521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
147	NC_019958	CGC	2	6	27529	27534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
148	NC_019958	CGGC	2	8	27562	27569	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
149	NC_019958	CG	3	6	28135	28140	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
150	NC_019958	AC	3	6	28160	28165	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_019958	CGT	2	6	28167	28172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_019958	CGGT	2	8	28193	28200	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
153	NC_019958	GAG	2	6	28266	28271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
154	NC_019958	GGA	2	6	28289	28294	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
155	NC_019958	GTC	2	6	28307	28312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
156	NC_019958	TGGG	2	8	28344	28351	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
157	NC_019958	CTC	2	6	28355	28360	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
158	NC_019958	CTG	2	6	28390	28395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_019958	CACT	2	8	28757	28764	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
160	NC_019958	TCC	2	6	29380	29385	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
161	NC_019958	GC	3	6	29438	29443	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
162	NC_019958	TTC	2	6	29476	29481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
163	NC_019958	CGG	2	6	29502	29507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
164	NC_019958	CGAT	2	8	30367	30374	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
165	NC_019958	CTC	2	6	31004	31009	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
166	NC_019958	TGC	2	6	31012	31017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
167	NC_019958	TGC	2	6	31040	31045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
168	NC_019958	G	6	6	31273	31278	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
169	NC_019958	CAG	2	6	31291	31296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
170	NC_019958	GTC	2	6	31307	31312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
171	NC_019958	CGC	2	6	31941	31946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
172	NC_019958	TTG	2	6	31958	31963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
173	NC_019958	CGG	2	6	32367	32372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
174	NC_019958	CCG	2	6	32384	32389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
175	NC_019958	TGG	2	6	32402	32407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
176	NC_019958	CCT	2	6	33013	33018	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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179	NC_019958	GC	3	6	34148	34153	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
180	NC_019958	GAT	2	6	34677	34682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
181	NC_019958	CGA	2	6	35045	35050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
182	NC_019958	GAC	3	9	35052	35060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
183	NC_019958	CTG	2	6	35091	35096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
184	NC_019958	GC	3	6	35104	35109	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
185	NC_019958	TCAT	2	8	35158	35165	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
186	NC_019958	TGC	2	6	35170	35175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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188	NC_019958	CGT	2	6	35317	35322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
189	NC_019958	CGA	2	6	35354	35359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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191	NC_019958	GGA	2	6	35513	35518	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
192	NC_019958	CGC	2	6	35533	35538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
193	NC_019958	ACG	2	6	35541	35546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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198	NC_019958	CG	3	6	37423	37428	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
199	NC_019958	CGA	3	9	37472	37480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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261	NC_019958	AC	3	6	56361	56366	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
262	NC_019958	C	6	6	56376	56381	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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264	NC_019958	CA	3	6	57080	57085	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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277	NC_019958	TGA	2	6	57657	57662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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280	NC_019958	CCG	2	6	57782	57787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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282	NC_019958	GCCC	2	8	57870	57877	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
283	NC_019958	TCC	2	6	57881	57886	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
284	NC_019958	CTC	2	6	58481	58486	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
285	NC_019958	CGT	2	6	58540	58545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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