MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium smegmatis JS623 plasmid pMYCSM01

Total Repeats: 147

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019957	CG	3	6	4290	4295	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_019957	CG	3	6	5440	5445	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_019957	GC	3	6	5510	5515	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_019957	GC	3	6	5572	5577	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_019957	GC	3	6	9264	9269	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_019957	GT	3	6	15403	15408	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019957	GC	3	6	15937	15942	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_019957	GC	3	6	19167	19172	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_019957	GC	3	6	19253	19258	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_019957	CT	3	6	19659	19664	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_019957	TG	3	6	19884	19889	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019957	GC	3	6	20020	20025	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_019957	CG	3	6	20099	20104	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_019957	GC	3	6	20233	20238	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_019957	TC	3	6	21922	21927	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_019957	GC	3	6	23154	23159	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_019957	GC	4	8	23397	23404	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_019957	CA	3	6	34757	34762	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_019957	AC	3	6	34870	34875	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_019957	GC	3	6	35086	35091	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_019957	CA	3	6	38956	38961	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_019957	CT	3	6	39533	39538	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_019957	GC	3	6	39721	39726	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_019957	TG	3	6	49323	49328	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019957	CG	3	6	49568	49573	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_019957	AC	3	6	50208	50213	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_019957	GC	4	8	80017	80024	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_019957	CG	3	6	80120	80125	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_019957	GC	4	8	80430	80437	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_019957	GC	3	6	80563	80568	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_019957	CG	3	6	92727	92732	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_019957	CG	3	6	92829	92834	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_019957	GA	3	6	93086	93091	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019957	GC	3	6	94756	94761	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_019957	CG	4	8	95368	95375	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_019957	GC	3	6	101344	101349	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_019957	CG	3	6	107605	107610	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_019957	CA	3	6	107654	107659	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_019957	GC	3	6	109012	109017	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_019957	GC	3	6	109174	109179	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_019957	CG	3	6	110028	110033	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_019957	GT	3	6	110065	110070	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019957	GA	3	6	118425	118430	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019957	CG	3	6	118436	118441	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_019957	AG	3	6	118518	118523	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019957	CA	3	6	118652	118657	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_019957	CG	3	6	118823	118828	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_019957	CA	4	8	130744	130751	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_019957	CG	3	6	131089	131094	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_019957	GC	3	6	131162	131167	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_019957	CA	3	6	133845	133850	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_019957	CG	3	6	134479	134484	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_019957	GC	3	6	154087	154092	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_019957	CG	3	6	157419	157424	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_019957	CG	3	6	167459	167464	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_019957	GA	3	6	171028	171033	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019957	GA	3	6	171155	171160	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019957	CT	3	6	171597	171602	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_019957	GT	3	6	173571	173576	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019957	GA	3	6	179051	179056	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019957	GC	4	8	186666	186673	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_019957	GC	3	6	188993	188998	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_019957	CA	3	6	194126	194131	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_019957	GC	3	6	195531	195536	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_019957	CA	3	6	196965	196970	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_019957	GC	3	6	197557	197562	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_019957	CG	3	6	200571	200576	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_019957	GA	3	6	201252	201257	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019957	GT	3	6	201938	201943	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019957	CG	3	6	202115	202120	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_019957	GC	3	6	208324	208329	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_019957	GC	3	6	210413	210418	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_019957	CG	3	6	210426	210431	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_019957	GC	3	6	211403	211408	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75	NC_019957	AG	3	6	212718	212723	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019957	CA	3	6	225203	225208	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_019957	GT	3	6	225834	225839	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019957	CG	3	6	228703	228708	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_019957	CG	3	6	229589	229594	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_019957	GC	3	6	230191	230196	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_019957	GC	3	6	230330	230335	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_019957	CG	3	6	231176	231181	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_019957	CG	3	6	236723	236728	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_019957	GC	3	6	237277	237282	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85	NC_019957	GC	3	6	237368	237373	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
86	NC_019957	GA	3	6	247188	247193	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019957	CA	3	6	250307	250312	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_019957	CG	3	6	254323	254328	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_019957	CG	3	6	255839	255844	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
90	NC_019957	GC	3	6	256080	256085	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_019957	TG	3	6	257322	257327	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019957	CG	3	6	258527	258532	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_019957	GC	3	6	258807	258812	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
94	NC_019957	GC	3	6	262201	262206	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_019957	GT	3	6	262291	262296	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019957	GA	3	6	262426	262431	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019957	GC	3	6	263068	263073	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_019957	GA	3	6	263913	263918	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019957	GC	3	6	265818	265823	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_019957	AG	3	6	272028	272033	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_019957	GT	3	6	274973	274978	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_019957	GC	3	6	275046	275051	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_019957	GC	5	10	281902	281911	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_019957	TG	3	6	282272	282277	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019957	GC	4	8	287360	287367	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
106	NC_019957	CG	3	6	288922	288927	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_019957	AC	3	6	291554	291559	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_019957	GC	3	6	291598	291603	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
109	NC_019957	CG	3	6	293926	293931	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_019957	GT	3	6	294299	294304	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019957	GA	3	6	296325	296330	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019957	GT	3	6	296715	296720	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_019957	TC	3	6	305517	305522	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_019957	CG	3	6	310734	310739	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
115	NC_019957	CA	3	6	310745	310750	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_019957	CG	3	6	312801	312806	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
117	NC_019957	GC	3	6	319443	319448	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
118	NC_019957	GA	3	6	319764	319769	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019957	CG	3	6	320160	320165	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_019957	GC	3	6	323033	323038	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_019957	GC	3	6	325618	325623	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_019957	GT	3	6	331525	331530	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019957	CG	3	6	333993	333998	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_019957	GC	4	8	334011	334018	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125	NC_019957	GC	4	8	334336	334343	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_019957	TC	3	6	334689	334694	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_019957	AC	3	6	335673	335678	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_019957	TC	3	6	335960	335965	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_019957	GA	3	6	335975	335980	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_019957	GC	3	6	335994	335999	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_019957	TC	3	6	342396	342401	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_019957	CG	3	6	345019	345024	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133	NC_019957	CG	3	6	346760	346765	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
134	NC_019957	GC	3	6	347035	347040	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135	NC_019957	GT	3	6	347313	347318	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_019957	TC	3	6	349681	349686	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_019957	CA	3	6	349693	349698	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_019957	GC	3	6	350653	350658	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_019957	CT	3	6	353765	353770	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_019957	CA	4	8	365902	365909	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_019957	GC	3	6	369468	369473	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_019957	AC	3	6	369535	369540	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_019957	GC	3	6	370138	370143	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
144	NC_019957	GC	3	6	370173	370178	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
145	NC_019957	GC	3	6	370255	370260	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146	NC_019957	GC	3	6	370393	370398	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
147	NC_019957	TG	3	6	370419	370424	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.