MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium canettii CIPT 140070010 complete genome

Total Repeats: 1374

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019951	CCGA	2	8	1725	1732	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_019951	CATA	2	8	11636	11643	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_019951	GGTG	2	8	11872	11879	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019951	GACA	2	8	12561	12568	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_019951	CAGC	2	8	17192	17199	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_019951	CGCA	2	8	17271	17278	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_019951	TCCT	2	8	19528	19535	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_019951	GCCC	2	8	20655	20662	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
9	NC_019951	CCAA	2	8	20684	20691	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_019951	CGCC	2	8	20696	20703	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
11	NC_019951	TACG	2	8	20727	20734	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_019951	CGTT	2	8	21235	21242	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_019951	GCCC	2	8	23257	23264	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
14	NC_019951	ATTC	2	8	24495	24502	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_019951	ACCC	2	8	24903	24910	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
16	NC_019951	CGCT	2	8	29581	29588	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_019951	TCAA	2	8	36434	36441	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_019951	GCCG	2	8	36477	36484	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_019951	AGCT	2	8	44783	44790	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_019951	CTAC	2	8	58127	58134	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_019951	CCCG	2	8	64380	64387	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
22	NC_019951	GCCG	2	8	64471	64478	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_019951	AAGG	2	8	74712	74719	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019951	CCGG	2	8	77677	77684	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_019951	ACGC	2	8	82475	82482	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_019951	CGAC	2	8	82493	82500	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_019951	GCGT	2	8	89479	89486	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_019951	CGGT	2	8	93418	93425	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_019951	CGGT	2	8	93603	93610	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
30	NC_019951	CTTC	2	8	100002	100009	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_019951	CTGG	2	8	101681	101688	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
32	NC_019951	GCGG	2	8	103993	104000	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
33	NC_019951	ACCG	2	8	115495	115502	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_019951	ATCC	2	8	141465	141472	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_019951	GCTC	2	8	147103	147110	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
36	NC_019951	CGGG	2	8	149814	149821	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
37	NC_019951	TTCT	2	8	155731	155738	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_019951	ACGC	2	8	155803	155810	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_019951	AGCA	2	8	156973	156980	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_019951	GGCC	2	8	157016	157023	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_019951	GCCG	2	8	159777	159784	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_019951	GCCG	2	8	167394	167401	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_019951	GGCT	2	8	172804	172811	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_019951	CGCA	2	8	172830	172837	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
45	NC_019951	TCGT	2	8	176521	176528	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_019951	CCGG	2	8	176529	176536	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_019951	ACTT	2	8	186104	186111	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_019951	GGAT	2	8	192323	192330	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019951	GGCC	2	8	199063	199070	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_019951	ACCG	2	8	199877	199884	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NC_019951	GCCA	2	8	199921	199928	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
52	NC_019951	TTGA	2	8	201624	201631	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019951	CTGG	2	8	211611	211618	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_019951	CTGT	2	8	227218	227225	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_019951	CGGG	2	8	233304	233311	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
56	NC_019951	CGGT	2	8	233642	233649	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
57	NC_019951	GATG	2	8	234389	234396	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019951	AACC	2	8	245547	245554	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_019951	AACT	2	8	245588	245595	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_019951	GGAA	2	8	245763	245770	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019951	ACGT	2	8	246515	246522	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_019951	ACAT	2	8	246582	246589	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_019951	TGGA	2	8	246596	246603	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019951	GCCC	2	8	249773	249780	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
65	NC_019951	TGGC	2	8	251272	251279	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_019951	GTCG	2	8	251340	251347	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_019951	CAGC	3	12	251372	251383	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
68	NC_019951	GTGC	2	8	256297	256304	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
69	NC_019951	GAAC	2	8	263973	263980	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_019951	CGCA	2	8	268605	268612	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
71	NC_019951	GACG	2	8	271014	271021	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_019951	GCGG	2	8	287895	287902	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
73	NC_019951	CGGC	2	8	289261	289268	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_019951	TATC	2	8	289894	289901	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_019951	TGGG	2	8	295983	295990	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019951	TAGA	2	8	303379	303386	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019951	ACTT	2	8	306574	306581	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_019951	GCTG	2	8	308157	308164	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
79	NC_019951	TCGT	2	8	308202	308209	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_019951	AACT	2	8	310252	310259	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_019951	AACC	2	8	310260	310267	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_019951	ATGC	2	8	311250	311257	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_019951	AGGC	2	8	311273	311280	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
84	NC_019951	TTGC	2	8	324179	324186	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_019951	TCGG	2	8	324678	324685	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
86	NC_019951	CGCC	2	8	335854	335861	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
87	NC_019951	ACCC	2	8	337829	337836	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
88	NC_019951	CCGG	2	8	343663	343670	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_019951	GCGG	2	8	350722	350729	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
90	NC_019951	GAAG	2	8	353341	353348	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019951	AGGG	2	8	353483	353490	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019951	ATCG	2	8	353743	353750	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_019951	AGGT	2	8	353780	353787	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019951	TGAA	2	8	353824	353831	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019951	TGAT	2	8	353917	353924	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019951	GCAA	2	8	355233	355240	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_019951	GCCG	2	8	355307	355314	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_019951	CTGG	2	8	357869	357876	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
99	NC_019951	CCTT	2	8	358100	358107	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_019951	CCGG	2	8	378497	378504	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101	NC_019951	GCGT	2	8	383275	383282	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
102	NC_019951	AATC	2	8	395829	395836	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_019951	CGGC	2	8	406157	406164	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_019951	AGGA	2	8	407191	407198	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019951	TGAC	2	8	416159	416166	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_019951	GTCA	2	8	416170	416177	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_019951	CGGC	2	8	420005	420012	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NC_019951	ATCG	2	8	436853	436860	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_019951	GAGC	2	8	441458	441465	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
110	NC_019951	CTGC	2	8	455989	455996	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
111	NC_019951	GCTG	2	8	456033	456040	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
112	NC_019951	CACG	2	8	473005	473012	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
113	NC_019951	GGAT	2	8	486216	486223	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019951	CGAG	2	8	486359	486366	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
115	NC_019951	TGGG	2	8	491680	491687	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
116	NC_019951	GAGC	2	8	493355	493362	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
117	NC_019951	AGAA	2	8	503786	503793	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_019951	GCGG	2	8	516162	516169	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
119	NC_019951	ACCG	2	8	517980	517987	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
120	NC_019951	CGGG	2	8	518017	518024	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
121	NC_019951	GAGG	2	8	519970	519977	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019951	GCGT	2	8	520056	520063	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
123	NC_019951	ACGG	2	8	523306	523313	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NC_019951	GCAA	2	8	531505	531512	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_019951	GCTG	2	8	534378	534385	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
126	NC_019951	CCGT	2	8	541423	541430	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
127	NC_019951	CGGC	2	8	546740	546747	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_019951	CGGC	2	8	551482	551489	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_019951	GACG	2	8	551492	551499	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
130	NC_019951	AATC	2	8	558182	558189	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_019951	GTCT	2	8	558804	558811	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_019951	CGGC	2	8	572711	572718	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133	NC_019951	GCAT	2	8	574570	574577	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_019951	AGCA	2	8	577794	577801	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_019951	CGAC	2	8	578464	578471	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
136	NC_019951	CGCC	2	8	590187	590194	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
137	NC_019951	GTTT	2	8	598980	598987	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_019951	GCCG	2	8	603973	603980	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_019951	TGCC	2	8	609030	609037	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
140	NC_019951	TGGC	2	8	609096	609103	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
141	NC_019951	GCTA	2	8	609278	609285	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_019951	GCGT	2	8	617155	617162	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
143	NC_019951	ATGT	2	8	619117	619124	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_019951	CCGA	2	8	621173	621180	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
145	NC_019951	CGGC	2	8	627305	627312	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146	NC_019951	GCCC	2	8	640751	640758	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
147	NC_019951	AGCC	2	8	645232	645239	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
148	NC_019951	TGCC	2	8	655230	655237	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
149	NC_019951	CGCC	2	8	656172	656179	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
150	NC_019951	GCCG	2	8	666762	666769	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
151	NC_019951	TGGC	2	8	670052	670059	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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295	NC_019951	CGAT	2	8	1091625	1091632	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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482	NC_019951	TGGG	2	8	1708532	1708539	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
483	NC_019951	GTTG	2	8	1708591	1708598	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
484	NC_019951	CGCC	2	8	1710263	1710270	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
485	NC_019951	GCCG	2	8	1710342	1710349	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
486	NC_019951	GCCA	2	8	1710350	1710357	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
487	NC_019951	GCAG	2	8	1710502	1710509	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
488	NC_019951	CGCC	2	8	1711078	1711085	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
489	NC_019951	ACCG	2	8	1711870	1711877	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
490	NC_019951	GCCG	2	8	1712651	1712658	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
491	NC_019951	GGCC	2	8	1712830	1712837	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
492	NC_019951	GCCA	3	12	1713459	1713470	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
493	NC_019951	TCGG	2	8	1713528	1713535	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
494	NC_019951	GCCC	2	8	1713601	1713608	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
495	NC_019951	CTTC	2	8	1732649	1732656	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
496	NC_019951	CGAC	2	8	1733829	1733836	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
497	NC_019951	CCGG	2	8	1737387	1737394	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
498	NC_019951	CCGG	2	8	1737448	1737455	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
499	NC_019951	AGGC	2	8	1737950	1737957	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
500	NC_019951	CGCC	2	8	1744656	1744663	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding

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