MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycobacterium canettii CIPT 140070010 complete genome

Total Repeats: 11722

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_019951	AT	3	6	233576	233581	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_019951	CTG	2	6	233628	233633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_019951	GC	3	6	233634	233639	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
504	NC_019951	CGGT	2	8	233642	233649	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
505	NC_019951	GATG	2	8	234389	234396	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
506	NC_019951	TGC	2	6	234420	234425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_019951	CGC	2	6	236712	236717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
508	NC_019951	ATG	2	6	236766	236771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
509	NC_019951	CGC	2	6	237122	237127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
510	NC_019951	CAC	2	6	237149	237154	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
511	NC_019951	GGTGC	2	10	237160	237169	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
512	NC_019951	ACC	2	6	237211	237216	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
513	NC_019951	CAG	2	6	238492	238497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_019951	GAA	2	6	238538	238543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
515	NC_019951	CG	3	6	239629	239634	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
516	NC_019951	GGC	2	6	241605	241610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_019951	CGG	2	6	241703	241708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_019951	ACC	2	6	241797	241802	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
519	NC_019951	AACC	2	8	245547	245554	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
520	NC_019951	AACT	2	8	245588	245595	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
521	NC_019951	TGT	2	6	245728	245733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
522	NC_019951	GGAA	2	8	245763	245770	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
523	NC_019951	CAC	2	6	245771	245776	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
524	NC_019951	G	6	6	245778	245783	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
525	NC_019951	GAG	2	6	245829	245834	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
526	NC_019951	TCC	2	6	245839	245844	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
527	NC_019951	ACGT	2	8	246515	246522	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
528	NC_019951	GGCCG	2	10	246525	246534	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
529	NC_019951	GTG	2	6	246546	246551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
530	NC_019951	ACAT	2	8	246582	246589	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
531	NC_019951	TGGA	2	8	246596	246603	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
532	NC_019951	GCG	2	6	246604	246609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_019951	CTGCG	2	10	249500	249509	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
534	NC_019951	CGG	2	6	249598	249603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_019951	CGG	2	6	249626	249631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_019951	GAA	2	6	249681	249686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
537	NC_019951	CAG	2	6	249756	249761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_019951	GCCC	2	8	249773	249780	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
539	NC_019951	GAG	2	6	249824	249829	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
540	NC_019951	CGA	2	6	249842	249847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_019951	CG	3	6	249851	249856	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
542	NC_019951	TCG	3	9	249916	249924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_019951	CCA	2	6	249927	249932	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
544	NC_019951	CGT	2	6	249953	249958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_019951	TCG	2	6	249973	249978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_019951	CCG	2	6	250018	250023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
547	NC_019951	GGC	2	6	250029	250034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_019951	TCG	2	6	250036	250041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_019951	TGG	2	6	250059	250064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
550	NC_019951	GTA	2	6	250110	250115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
551	NC_019951	TCG	2	6	250147	250152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_019951	GTC	2	6	250230	250235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_019951	AGT	2	6	250256	250261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
554	NC_019951	GC	3	6	250316	250321	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
555	NC_019951	GCG	2	6	250334	250339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_019951	ATCCA	2	10	250342	250351	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
557	NC_019951	GCTGAT	2	12	250356	250367	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
558	NC_019951	CCT	2	6	250376	250381	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
559	NC_019951	CCA	2	6	250391	250396	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
560	NC_019951	CGG	2	6	250422	250427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_019951	CCA	2	6	250478	250483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
562	NC_019951	GCT	2	6	250514	250519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_019951	TCC	2	6	250555	250560	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
564	NC_019951	CAC	2	6	250824	250829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
565	NC_019951	GC	3	6	250838	250843	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
566	NC_019951	CGA	2	6	250865	250870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_019951	CGG	2	6	250961	250966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_019951	GTA	2	6	250983	250988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
569	NC_019951	TCG	2	6	250993	250998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_019951	GCC	3	9	251079	251087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
571	NC_019951	GCG	2	6	251116	251121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_019951	GTG	2	6	251166	251171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
573	NC_019951	GC	3	6	251188	251193	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
574	NC_019951	TCG	2	6	251206	251211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_019951	GCA	2	6	251260	251265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
576	NC_019951	TGGC	2	8	251272	251279	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
577	NC_019951	GAT	2	6	251283	251288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
578	NC_019951	GTCG	2	8	251340	251347	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
579	NC_019951	CAGC	3	12	251372	251383	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
580	NC_019951	GTC	2	6	251406	251411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_019951	CTG	2	6	256263	256268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_019951	GTGC	2	8	256297	256304	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
583	NC_019951	GGC	2	6	256366	256371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_019951	TCG	2	6	256401	256406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_019951	CCG	3	9	256900	256908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
586	NC_019951	G	6	6	258249	258254	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
587	NC_019951	GCC	2	6	258270	258275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
588	NC_019951	ACG	2	6	258310	258315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_019951	GCC	2	6	263878	263883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
590	NC_019951	CGG	2	6	263916	263921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_019951	CTG	2	6	263933	263938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_019951	CGG	2	6	263949	263954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_019951	CCA	2	6	263963	263968	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
594	NC_019951	GAAC	2	8	263973	263980	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
595	NC_019951	GTT	2	6	266580	266585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
596	NC_019951	A	6	6	266645	266650	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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598	NC_019951	CGCA	2	8	268605	268612	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
599	NC_019951	GACG	2	8	271014	271021	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
600	NC_019951	GGA	2	6	271025	271030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
601	NC_019951	AGA	2	6	271037	271042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
602	NC_019951	TGC	2	6	272662	272667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_019951	TGG	2	6	275923	275928	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
604	NC_019951	CTC	3	9	282783	282791	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
605	NC_019951	CGCTC	2	10	282794	282803	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
606	NC_019951	TCG	2	6	282808	282813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_019951	CGG	2	6	282815	282820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_019951	GTG	2	6	287860	287865	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
609	NC_019951	GCGG	2	8	287895	287902	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
610	NC_019951	TCG	2	6	287916	287921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_019951	CCT	2	6	287946	287951	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
612	NC_019951	TCG	2	6	287966	287971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_019951	CAG	2	6	288024	288029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_019951	CGGC	2	8	289261	289268	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
615	NC_019951	TATC	2	8	289894	289901	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
616	NC_019951	AT	4	8	289914	289921	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_019951	GCAGT	2	10	290983	290992	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
618	NC_019951	TCG	2	6	291003	291008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_019951	TCG	2	6	292788	292793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_019951	CG	3	6	292800	292805	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
621	NC_019951	TCA	2	6	292867	292872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_019951	AGG	2	6	292878	292883	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
623	NC_019951	TGGG	2	8	295983	295990	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
624	NC_019951	AGG	2	6	296047	296052	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
625	NC_019951	CCT	2	6	296061	296066	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
626	NC_019951	TCG	2	6	296132	296137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_019951	GCC	2	6	301854	301859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
628	NC_019951	GCG	2	6	301867	301872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_019951	CTC	2	6	302067	302072	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
630	NC_019951	C	6	6	302131	302136	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
631	NC_019951	TAGA	2	8	303379	303386	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
632	NC_019951	CCA	2	6	304046	304051	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
633	NC_019951	CGG	2	6	304068	304073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_019951	TCG	2	6	304075	304080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_019951	TGT	2	6	304100	304105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
636	NC_019951	CAT	2	6	304167	304172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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759	NC_019951	A	7	7	354172	354178	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
760	NC_019951	A	11	11	354197	354207	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
761	NC_019951	AAC	2	6	354223	354228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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767	NC_019951	TTA	2	6	354547	354552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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770	NC_019951	GCAA	2	8	355233	355240	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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