MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium canettii CIPT 140060008 complete genome

Total Repeats: 1212

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019950	GCCC	2	8	3148	3155	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2	NC_019950	GCAC	2	8	13311	13318	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_019950	GCCC	2	8	14156	14163	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4	NC_019950	ATTC	2	8	15394	15401	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_019950	ACCC	2	8	15801	15808	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
6	NC_019950	TCAA	2	8	27199	27206	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_019950	GAGC	2	8	27227	27234	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8	NC_019950	GGCC	2	8	27241	27248	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_019950	GCTA	2	8	35544	35551	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_019950	CTAC	2	8	49021	49028	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_019950	CTGG	2	8	54518	54525	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_019950	GCCG	2	8	55372	55379	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_019950	ATCG	2	8	71392	71399	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_019950	CGAC	2	8	72070	72077	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15	NC_019950	GGCA	2	8	72462	72469	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_019950	TGCT	2	8	72629	72636	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_019950	TCGC	2	8	72654	72661	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_019950	GCCG	2	8	72728	72735	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_019950	TTCG	2	8	72792	72799	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_019950	CGGT	2	8	72904	72911	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_019950	ATCG	2	8	73594	73601	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_019950	GCTC	2	8	74252	74259	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_019950	TCGA	2	8	74378	74385	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_019950	GCGT	2	8	75005	75012	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_019950	CGGT	2	8	82986	82993	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_019950	CGGT	2	8	83171	83178	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_019950	CTTC	2	8	89356	89363	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_019950	CGCA	2	8	93335	93342	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
29	NC_019950	GAGT	2	8	102824	102831	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019950	ATCC	2	8	130915	130922	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_019950	GCGA	2	8	136003	136010	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
32	NC_019950	CGGG	2	8	136046	136053	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
33	NC_019950	GCTC	2	8	136558	136565	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_019950	CGGG	2	8	139270	139277	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
35	NC_019950	TTCT	2	8	145187	145194	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_019950	ACGC	2	8	145259	145266	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_019950	AGCA	2	8	146431	146438	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_019950	GCCG	2	8	149237	149244	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_019950	GCGT	2	8	153781	153788	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_019950	GCGG	2	8	154847	154854	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
41	NC_019950	GCCG	2	8	157754	157761	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_019950	CCGG	2	8	161173	161180	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_019950	GGCT	2	8	163347	163354	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_019950	CGCA	2	8	163373	163380	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
45	NC_019950	TCGT	2	8	167064	167071	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_019950	CCGG	2	8	167072	167079	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_019950	CCCG	2	8	167284	167291	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
48	NC_019950	ACTT	2	8	176766	176773	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_019950	GGAT	2	8	182987	182994	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019950	GGCC	2	8	189727	189734	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_019950	ACCG	2	8	190541	190548	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
52	NC_019950	GCCA	2	8	190585	190592	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
53	NC_019950	TTGA	2	8	192288	192295	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019950	CTGG	2	8	202275	202282	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_019950	CTGT	2	8	217882	217889	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_019950	CGGG	2	8	223968	223975	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
57	NC_019950	GATG	2	8	225053	225060	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019950	AACT	2	8	236250	236257	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_019950	GGAA	2	8	236425	236432	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019950	ACGT	2	8	237177	237184	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_019950	ACAT	2	8	237244	237251	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_019950	TGGA	2	8	237258	237265	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019950	GTGC	2	8	246957	246964	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
64	NC_019950	GAAC	2	8	254643	254650	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_019950	CGCA	2	8	259252	259259	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
66	NC_019950	GACG	2	8	261661	261668	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_019950	GCGG	2	8	278571	278578	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
68	NC_019950	CGGC	2	8	279937	279944	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_019950	TGGG	2	8	286650	286657	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019950	TAGA	2	8	294046	294053	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019950	TCGT	2	8	294848	294855	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_019950	ACTT	2	8	297751	297758	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_019950	TCGT	2	8	299379	299386	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_019950	AACT	2	8	301429	301436	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_019950	AACC	2	8	301437	301444	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_019950	ATGC	2	8	302427	302434	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_019950	GACG	2	8	307745	307752	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
78	NC_019950	TTGC	2	8	315385	315392	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_019950	TCGG	2	8	315782	315789	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
80	NC_019950	CAGC	2	8	315906	315913	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
81	NC_019950	GCGG	2	8	338951	338958	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
82	NC_019950	GGTA	2	8	341420	341427	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019950	GCCG	2	8	341507	341514	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_019950	TGGC	2	8	341519	341526	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NC_019950	GCCG	2	8	344456	344463	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
86	NC_019950	TGGC	2	8	344468	344475	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
87	NC_019950	AATC	2	8	382413	382420	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_019950	GGCC	2	8	392773	392780	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_019950	AAGG	2	8	393789	393796	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019950	CAGC	2	8	397254	397261	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
91	NC_019950	TCGG	2	8	397732	397739	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
92	NC_019950	AGCA	2	8	397864	397871	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_019950	TGAC	2	8	402760	402767	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_019950	GTCA	2	8	402771	402778	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_019950	CGGC	2	8	406604	406611	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
96	NC_019950	CGAG	2	8	417559	417566	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
97	NC_019950	ATCG	2	8	423760	423767	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_019950	GCCA	2	8	423851	423858	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
99	NC_019950	GTCC	2	8	423877	423884	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
100	NC_019950	ACGG	2	8	423963	423970	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
101	NC_019950	GAGC	2	8	430745	430752	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
102	NC_019950	GAGC	2	8	430796	430803	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
103	NC_019950	GAGC	2	8	430847	430854	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
104	NC_019950	GCGG	2	8	453305	453312	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
105	NC_019950	CACG	2	8	461235	461242	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
106	NC_019950	TGCG	2	8	462347	462354	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
107	NC_019950	GGGT	2	8	462778	462785	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019950	CGTC	2	8	464069	464076	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
109	NC_019950	GCTC	2	8	464293	464300	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
110	NC_019950	GGAT	2	8	476586	476593	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019950	CGAG	2	8	476729	476736	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
112	NC_019950	CCCA	2	8	482109	482116	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
113	NC_019950	TGGC	2	8	482171	482178	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
114	NC_019950	CAAC	2	8	486603	486610	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_019950	AGAA	2	8	497160	497167	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_019950	GCGG	2	8	509536	509543	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
117	NC_019950	ACCG	2	8	511354	511361	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
118	NC_019950	CGGG	2	8	511391	511398	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
119	NC_019950	GCGT	2	8	513433	513440	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
120	NC_019950	ACGG	2	8	516694	516701	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
121	NC_019950	CTGA	2	8	522291	522298	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
122	NC_019950	GCAA	2	8	524926	524933	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_019950	GCTG	2	8	527799	527806	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NC_019950	CCGT	2	8	534844	534851	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
125	NC_019950	CGGC	2	8	540156	540163	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_019950	CGGC	2	8	544899	544906	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NC_019950	AATC	2	8	551592	551599	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_019950	GTCT	2	8	552214	552221	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_019950	CGGC	2	8	566215	566222	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130	NC_019950	CCGG	2	8	567150	567157	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_019950	GTCG	2	8	568960	568967	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
132	NC_019950	AGCA	2	8	571292	571299	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_019950	CGAC	2	8	571962	571969	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
134	NC_019950	CGCC	2	8	583912	583919	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
135	NC_019950	GCAT	2	8	583995	584002	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_019950	GTTT	2	8	592705	592712	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_019950	GCCG	2	8	597719	597726	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
138	NC_019950	TGCC	2	8	602833	602840	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
139	NC_019950	TGGC	2	8	602899	602906	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
140	NC_019950	GCTA	2	8	603080	603087	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_019950	GCGT	2	8	610966	610973	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
142	NC_019950	CCGA	2	8	610991	610998	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
143	NC_019950	CCGA	2	8	614994	615001	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
144	NC_019950	GTCC	2	8	617549	617556	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
145	NC_019950	CGGC	2	8	621160	621167	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146	NC_019950	CCGC	2	8	621191	621198	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
147	NC_019950	GCCC	2	8	634652	634659	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
148	NC_019950	AGCC	2	8	639133	639140	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
149	NC_019950	CCGG	2	8	644669	644676	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
150	NC_019950	TGCC	2	8	649106	649113	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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464	NC_019950	CGCC	2	8	1815716	1815723	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
465	NC_019950	TCGC	2	8	1815956	1815963	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
466	NC_019950	TGCC	2	8	1824068	1824075	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
467	NC_019950	ATCG	2	8	1837030	1837037	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
468	NC_019950	TGGG	2	8	1837646	1837653	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
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471	NC_019950	CTAT	2	8	1843148	1843155	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
472	NC_019950	GACG	2	8	1849428	1849435	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
473	NC_019950	TCGG	2	8	1853078	1853085	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
474	NC_019950	CCGG	2	8	1853148	1853155	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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480	NC_019950	CCAG	2	8	1896714	1896721	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
481	NC_019950	GACT	2	8	1896732	1896739	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
482	NC_019950	GTGC	2	8	1898211	1898218	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
483	NC_019950	CTGA	2	8	1898317	1898324	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
484	NC_019950	ATTG	2	8	1902258	1902265	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
485	NC_019950	TGCG	2	8	1903338	1903345	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
486	NC_019950	TGCC	2	8	1904640	1904647	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
487	NC_019950	GCCG	2	8	1908554	1908561	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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489	NC_019950	GTAG	2	8	1929882	1929889	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
490	NC_019950	TGGC	2	8	1929899	1929906	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
491	NC_019950	CAGG	2	8	1930143	1930150	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
492	NC_019950	CGGT	2	8	1930303	1930310	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
493	NC_019950	GGGT	2	8	1930427	1930434	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
494	NC_019950	GCCG	2	8	1930896	1930903	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
495	NC_019950	TCGA	2	8	1931316	1931323	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
496	NC_019950	TGGG	2	8	1936195	1936202	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
497	NC_019950	GGGA	2	8	1944010	1944017	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
498	NC_019950	TTCG	2	8	1949196	1949203	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
499	NC_019950	CCCG	2	8	1949928	1949935	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
500	NC_019950	CAAC	2	8	1959489	1959496	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding

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