MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycobacterium canettii CIPT 140060008 complete genome

Total Repeats: 9568

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_019950	CGA	2	6	979861	979866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2003	NC_019950	GAC	2	6	979867	979872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2004	NC_019950	AAC	2	6	979873	979878	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2005	NC_019950	CAGC	2	8	979919	979926	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2006	NC_019950	GCC	2	6	979959	979964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2007	NC_019950	TCGC	2	8	979976	979983	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2008	NC_019950	TAG	2	6	980012	980017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2009	NC_019950	ATTG	2	8	980111	980118	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2010	NC_019950	AAC	2	6	980153	980158	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2011	NC_019950	AC	3	6	980183	980188	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2012	NC_019950	GC	3	6	980306	980311	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2013	NC_019950	CGA	2	6	980376	980381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2015	NC_019950	GAT	2	6	980519	980524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2016	NC_019950	GGACT	2	10	980540	980549	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
2017	NC_019950	CTG	2	6	980607	980612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2018	NC_019950	GTC	2	6	982128	982133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2023	NC_019950	GAT	2	6	986774	986779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2032	NC_019950	AAC	2	6	989863	989868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2033	NC_019950	CGTGA	2	10	989886	989895	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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2039	NC_019950	CTTAC	2	10	992737	992746	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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2062	NC_019950	GT	3	6	1007858	1007863	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2063	NC_019950	CG	3	6	1007886	1007891	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2064	NC_019950	TGGT	2	8	1007921	1007928	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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2099	NC_019950	CGGC	2	8	1017589	1017596	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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2101	NC_019950	CG	3	6	1017629	1017634	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2102	NC_019950	GC	3	6	1017635	1017640	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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2111	NC_019950	CA	3	6	1017913	1017918	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2112	NC_019950	ACCA	2	8	1018756	1018763	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2113	NC_019950	CGC	2	6	1018960	1018965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2114	NC_019950	GCCG	2	8	1018966	1018973	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2115	NC_019950	ACG	2	6	1020416	1020421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2117	NC_019950	GT	3	6	1021811	1021816	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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2119	NC_019950	G	8	8	1021903	1021910	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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2122	NC_019950	GT	3	6	1021995	1022000	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2123	NC_019950	GT	3	6	1022052	1022057	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2124	NC_019950	GT	3	6	1022072	1022077	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2125	NC_019950	GGC	2	6	1022085	1022090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2127	NC_019950	CAACGG	2	12	1024345	1024356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2131	NC_019950	CAT	2	6	1024442	1024447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2132	NC_019950	TGCG	2	8	1024465	1024472	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2133	NC_019950	GCC	2	6	1024473	1024478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2134	NC_019950	CCTG	2	8	1027635	1027642	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2135	NC_019950	TCG	2	6	1027646	1027651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2136	NC_019950	GCG	2	6	1027668	1027673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2137	NC_019950	GACTGC	2	12	1028801	1028812	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2138	NC_019950	CAT	2	6	1028818	1028823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2139	NC_019950	TGC	2	6	1029662	1029667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2140	NC_019950	CTG	2	6	1029705	1029710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2141	NC_019950	CAT	2	6	1029771	1029776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2142	NC_019950	TGC	2	6	1029851	1029856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2143	NC_019950	CTC	2	6	1036041	1036046	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2144	NC_019950	GTG	2	6	1036058	1036063	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2145	NC_019950	GGT	2	6	1036082	1036087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2146	NC_019950	AGG	2	6	1036172	1036177	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2147	NC_019950	GC	3	6	1036202	1036207	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2148	NC_019950	GTA	2	6	1036236	1036241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2152	NC_019950	CGG	2	6	1045370	1045375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2153	NC_019950	GC	3	6	1045411	1045416	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2154	NC_019950	GAA	2	6	1045465	1045470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2156	NC_019950	GATC	2	8	1045562	1045569	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2157	NC_019950	CCA	2	6	1047361	1047366	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2158	NC_019950	CGG	2	6	1047384	1047389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2159	NC_019950	GTC	2	6	1047422	1047427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2161	NC_019950	GGC	2	6	1047491	1047496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2162	NC_019950	TGA	2	6	1047512	1047517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2164	NC_019950	CAC	2	6	1047540	1047545	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2165	NC_019950	GGT	2	6	1047552	1047557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2166	NC_019950	CAG	2	6	1047617	1047622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2169	NC_019950	CGCCGG	2	12	1047665	1047676	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2170	NC_019950	CGAT	2	8	1049920	1049927	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2171	NC_019950	CTTA	2	8	1050745	1050752	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2172	NC_019950	GT	3	6	1050853	1050858	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2173	NC_019950	CGGG	2	8	1050875	1050882	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2174	NC_019950	CGG	2	6	1051841	1051846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2177	NC_019950	CGG	2	6	1056020	1056025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2253	NC_019950	GC	3	6	1094895	1094900	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2254	NC_019950	TCC	2	6	1096242	1096247	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2255	NC_019950	GCGG	2	8	1096269	1096276	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2256	NC_019950	TGG	2	6	1096370	1096375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2257	NC_019950	GTG	2	6	1096379	1096384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2258	NC_019950	GCA	2	6	1096419	1096424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2260	NC_019950	AGC	2	6	1096459	1096464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2262	NC_019950	GC	3	6	1096561	1096566	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2263	NC_019950	CGA	2	6	1096591	1096596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2265	NC_019950	GGT	2	6	1101332	1101337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2379	NC_019950	GCCG	2	8	1166058	1166065	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2380	NC_019950	TG	3	6	1166086	1166091	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2381	NC_019950	T	6	6	1166184	1166189	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2384	NC_019950	GC	3	6	1166290	1166295	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2385	NC_019950	TTG	2	6	1166972	1166977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2387	NC_019950	CG	3	6	1167363	1167368	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2388	NC_019950	GTG	2	6	1167398	1167403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2389	NC_019950	CAC	2	6	1167418	1167423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2390	NC_019950	CGC	3	9	1168240	1168248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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2393	NC_019950	ACG	2	6	1168325	1168330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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