MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycobacterium canettii CIPT 140060008 complete genome

Total Repeats: 9568

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_019950	TGG	2	6	190437	190442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
502	NC_019950	TCG	2	6	190491	190496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_019950	GGT	2	6	190498	190503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
504	NC_019950	CGG	2	6	190525	190530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_019950	ACCG	2	8	190541	190548	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
506	NC_019950	AAG	2	6	190571	190576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
507	NC_019950	GCCA	2	8	190585	190592	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
508	NC_019950	CGA	2	6	190603	190608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_019950	CGG	3	9	192079	192087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_019950	GAA	3	9	192136	192144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
511	NC_019950	TCG	2	6	192152	192157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_019950	CGT	2	6	192162	192167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_019950	CGC	2	6	192260	192265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
514	NC_019950	AAC	2	6	192279	192284	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_019950	TTGA	2	8	192288	192295	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
516	NC_019950	CGA	2	6	192333	192338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_019950	GC	3	6	194445	194450	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
518	NC_019950	CCG	2	6	194451	194456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
519	NC_019950	GGC	2	6	196151	196156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_019950	TGC	2	6	197527	197532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_019950	CGC	2	6	199173	199178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
522	NC_019950	GGAAG	2	10	200541	200550	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
523	NC_019950	CTGG	2	8	202275	202282	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
524	NC_019950	CA	3	6	202339	202344	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
525	NC_019950	AGG	3	9	202360	202368	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
526	NC_019950	ATG	2	6	202377	202382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
527	NC_019950	CGC	2	6	202383	202388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
528	NC_019950	CGG	2	6	202408	202413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_019950	GTC	2	6	212367	212372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_019950	CCG	2	6	215307	215312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
531	NC_019950	CTGT	2	8	217882	217889	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
532	NC_019950	GCCGA	2	10	220551	220560	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
533	NC_019950	CGGG	2	8	223968	223975	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
534	NC_019950	TCG	2	6	224032	224037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_019950	ACAGCC	2	12	224103	224114	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
536	NC_019950	GGT	2	6	224203	224208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
537	NC_019950	AT	3	6	224240	224245	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_019950	GGT	2	6	224279	224284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
539	NC_019950	CTG	2	6	224292	224297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_019950	GC	3	6	224298	224303	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
541	NC_019950	GGT	2	6	224311	224316	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
542	NC_019950	GATG	2	8	225053	225060	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
543	NC_019950	TGC	2	6	225084	225089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_019950	CGC	2	6	227376	227381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
545	NC_019950	ATG	2	6	227430	227435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
546	NC_019950	CGC	2	6	227786	227791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
547	NC_019950	CAC	2	6	227813	227818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
548	NC_019950	GGTGC	2	10	227824	227833	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
549	NC_019950	ACC	2	6	227875	227880	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
550	NC_019950	CAG	2	6	229156	229161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_019950	GAA	2	6	229202	229207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
552	NC_019950	CG	3	6	230293	230298	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
553	NC_019950	GGC	2	6	232269	232274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_019950	ACC	2	6	232459	232464	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
555	NC_019950	AACT	2	8	236250	236257	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
556	NC_019950	TGT	2	6	236390	236395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
557	NC_019950	GGAA	2	8	236425	236432	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
558	NC_019950	CAC	2	6	236433	236438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
559	NC_019950	G	6	6	236440	236445	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
560	NC_019950	GAG	2	6	236491	236496	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
561	NC_019950	TCC	2	6	236501	236506	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
562	NC_019950	ACGT	2	8	237177	237184	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
563	NC_019950	GGCCG	2	10	237187	237196	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
564	NC_019950	GTG	2	6	237208	237213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
565	NC_019950	ACAT	2	8	237244	237251	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
566	NC_019950	TGGA	2	8	237258	237265	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
567	NC_019950	GCG	2	6	237266	237271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_019950	CTG	2	6	246923	246928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_019950	GTGC	2	8	246957	246964	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
570	NC_019950	GGC	2	6	247026	247031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_019950	TCG	2	6	247061	247066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_019950	GCC	2	6	247084	247089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
573	NC_019950	CCG	3	9	247560	247568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
574	NC_019950	G	6	6	248909	248914	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
575	NC_019950	GCC	2	6	248930	248935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
576	NC_019950	CGC	2	6	248968	248973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
577	NC_019950	ACG	2	6	248980	248985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
578	NC_019950	CCG	2	6	248986	248991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
579	NC_019950	CA	3	6	252996	253001	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
580	NC_019950	GCC	2	6	254548	254553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
581	NC_019950	CGG	2	6	254586	254591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_019950	CTG	2	6	254603	254608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_019950	CGG	2	6	254619	254624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_019950	CCA	2	6	254633	254638	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
585	NC_019950	GAAC	2	8	254643	254650	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
586	NC_019950	GTT	2	6	257238	257243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
587	NC_019950	CCA	2	6	257342	257347	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
588	NC_019950	CGCA	2	8	259252	259259	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
589	NC_019950	GACG	2	8	261661	261668	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
590	NC_019950	GGA	2	6	261672	261677	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
591	NC_019950	AGA	2	6	261684	261689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
592	NC_019950	TGC	2	6	263309	263314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_019950	TGG	2	6	266570	266575	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
594	NC_019950	CTC	3	9	273429	273437	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
595	NC_019950	TCG	2	6	273454	273459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_019950	CGG	2	6	273461	273466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_019950	GTG	2	6	278536	278541	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
598	NC_019950	GCGG	2	8	278571	278578	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
599	NC_019950	TCG	2	6	278592	278597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_019950	CCT	2	6	278622	278627	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
601	NC_019950	TCG	2	6	278642	278647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_019950	CAG	2	6	278700	278705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_019950	CGGC	2	8	279937	279944	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
604	NC_019950	TA	3	6	280570	280575	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_019950	AT	4	8	280590	280597	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_019950	GCAGT	2	10	281659	281668	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
607	NC_019950	TCG	2	6	281679	281684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_019950	CG	3	6	283467	283472	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
609	NC_019950	AGG	2	6	283545	283550	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
610	NC_019950	TGGG	2	8	286650	286657	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
611	NC_019950	AGG	2	6	286714	286719	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
612	NC_019950	CCT	2	6	286728	286733	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
613	NC_019950	TCG	2	6	286799	286804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_019950	GCC	2	6	292521	292526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
615	NC_019950	GCG	2	6	292534	292539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_019950	CTC	2	6	292734	292739	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
617	NC_019950	C	6	6	292798	292803	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
618	NC_019950	TAGA	2	8	294046	294053	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
619	NC_019950	T	6	6	294731	294736	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_019950	GCACGA	2	12	294819	294830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_019950	TCGT	2	8	294848	294855	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
622	NC_019950	GCG	2	6	294898	294903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_019950	GCC	2	6	294918	294923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
624	NC_019950	CGC	2	6	294926	294931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
625	NC_019950	GAA	2	6	294958	294963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
626	NC_019950	GC	3	6	297718	297723	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
627	NC_019950	ACTT	2	8	297751	297758	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
628	NC_019950	GTA	2	6	297776	297781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
629	NC_019950	GCC	2	6	299199	299204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
630	NC_019950	GGT	2	6	299222	299227	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
631	NC_019950	GTT	2	6	299273	299278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
632	NC_019950	C	6	6	299285	299290	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
633	NC_019950	GCC	2	6	299328	299333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
634	NC_019950	TGG	2	6	299336	299341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
635	NC_019950	GCG	2	6	299353	299358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_019950	TCGT	2	8	299379	299386	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
637	NC_019950	CCA	2	6	299398	299403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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639	NC_019950	CCA	2	6	301359	301364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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652	NC_019950	GAT	2	6	302328	302333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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911	NC_019950	TGG	2	6	481915	481920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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946	NC_019950	GCG	2	6	497116	497121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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