MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycoplasma cynos C142 complete genome

Total Repeats: 185

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019949	TTATA	2	10	75	84	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019949	AATAA	2	10	1758	1767	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019949	TATTC	2	10	1832	1841	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_019949	TTTTA	2	10	8943	8952	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019949	ATTTT	2	10	25027	25036	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019949	ATTTT	2	10	31331	31340	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019949	AGTTA	2	10	31522	31531	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019949	TAATA	2	10	33012	33021	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019949	TATTT	2	10	38432	38441	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019949	TCGTG	2	10	44634	44643	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
11	NC_019949	GCTAC	2	10	44908	44917	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
12	NC_019949	TTTGT	2	10	45269	45278	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019949	GAAAA	2	10	45577	45586	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019949	GGGAG	2	10	45889	45898	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019949	TTGTA	2	10	48918	48927	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019949	ATTGT	2	10	77224	77233	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019949	ATTTT	2	10	78096	78105	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019949	GAATT	2	10	87843	87852	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019949	AACTT	2	10	97129	97138	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_019949	AAATA	2	10	99395	99404	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019949	TTAAA	2	10	100379	100388	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019949	TAATT	2	10	110556	110565	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019949	AAATT	2	10	113976	113985	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019949	ATTTA	2	10	114024	114033	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019949	AAATT	2	10	121240	121249	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019949	ATTTA	2	10	121288	121297	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019949	ATATT	2	10	127687	127696	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019949	TTTAA	2	10	128021	128030	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019949	TAAAT	2	10	140013	140022	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019949	AAAAT	2	10	147040	147049	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019949	ATTAA	2	10	147147	147156	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019949	AATGA	2	10	155267	155276	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019949	ATTTT	2	10	165684	165693	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019949	AAAAT	2	10	165951	165960	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019949	ATATG	2	10	175607	175616	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019949	TTTTA	2	10	190911	190920	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019949	TCGTG	2	10	206945	206954	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
38	NC_019949	GCTAC	2	10	207219	207228	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
39	NC_019949	TTTGT	2	10	207580	207589	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019949	GAAAA	2	10	207888	207897	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019949	GGGAG	2	10	208200	208209	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019949	AAATA	2	10	210656	210665	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019949	TTATT	2	10	211955	211964	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019949	TTAAT	2	10	221913	221922	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019949	AAGTT	2	10	240202	240211	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019949	AATAA	2	10	247660	247669	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019949	AATTG	2	10	250359	250368	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019949	AAAAT	2	10	250642	250651	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019949	TATAT	2	10	262144	262153	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019949	TTATT	2	10	276027	276036	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019949	AAATA	2	10	276042	276051	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019949	TTTAA	2	10	276380	276389	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019949	TTAAA	2	10	296915	296924	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019949	AAATT	2	10	311343	311352	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019949	TTTAA	2	10	311881	311890	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019949	TTAAA	2	10	313942	313951	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019949	AATTT	2	10	334361	334370	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019949	ATTAA	2	10	337079	337088	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019949	AAATT	2	10	339559	339568	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019949	ATTTT	2	10	344336	344345	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019949	ATTAT	2	10	354775	354784	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019949	ATTAA	2	10	354814	354823	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019949	TAAAA	2	10	364611	364620	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019949	TAAAA	2	10	367188	367197	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019949	ACAAA	3	15	367232	367246	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_019949	ATTTT	2	10	367257	367266	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019949	ATTAT	2	10	377939	377948	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019949	TCGTG	2	10	383195	383204	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
69	NC_019949	GCTAC	2	10	383468	383477	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
70	NC_019949	TTTGT	2	10	383829	383838	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019949	GAAAA	2	10	384138	384147	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019949	GGGAG	2	10	384450	384459	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019949	AATTT	2	10	402581	402590	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019949	AAGAA	2	10	402602	402611	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019949	TTTTA	2	10	402748	402757	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019949	AATTT	2	10	406078	406087	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019949	TAATT	2	10	406178	406187	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019949	ATATA	2	10	406569	406578	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019949	AGTTT	2	10	415401	415410	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019949	GTGAG	2	10	422536	422545	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019949	AAATA	2	10	429451	429460	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019949	ATTTT	2	10	443966	443975	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019949	TTCTT	2	10	451438	451447	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_019949	ATAAA	2	10	457287	457296	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019949	AAAAT	2	10	460498	460507	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019949	AATTT	2	10	461762	461771	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019949	AAGAA	2	10	461783	461792	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019949	TATTT	2	10	461899	461908	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019949	TTATT	2	10	471147	471156	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019949	TTTTA	2	10	471303	471312	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019949	TTTTA	2	10	471352	471361	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019949	TTTAT	2	10	474404	474413	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_019949	AAAAT	2	10	485385	485394	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019949	AATTT	2	10	488702	488711	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019949	AAGAA	2	10	488723	488732	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019949	ATATT	2	10	535948	535957	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019949	TTTAA	2	10	537515	537524	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019949	AAATT	2	10	546749	546758	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019949	CTTAA	2	10	550678	550687	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_019949	TTATT	2	10	556663	556672	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_019949	AAAAT	2	10	560048	560057	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_019949	ATTTT	2	10	568806	568815	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_019949	CATTT	2	10	572806	572815	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_019949	TATGC	2	10	575576	575585	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
105	NC_019949	TTCAT	2	10	577185	577194	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_019949	TATTT	2	10	577389	577398	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_019949	TAAAA	2	10	577928	577937	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019949	TACAT	2	10	586730	586739	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_019949	TTCTA	2	10	586740	586749	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_019949	TACAT	2	10	591179	591188	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_019949	TTCTA	2	10	591189	591198	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_019949	ACTTT	2	10	591295	591304	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_019949	TAATT	2	10	591440	591449	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019949	AGTTA	2	10	598587	598596	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019949	ATAAA	2	10	599877	599886	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_019949	TTTTA	2	10	599938	599947	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_019949	TTTTA	2	10	606974	606983	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_019949	AATTA	2	10	608680	608689	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019949	AATAT	2	10	608873	608882	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_019949	TCATA	2	10	624368	624377	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_019949	TAAAA	2	10	650117	650126	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019949	GAAAT	2	10	653112	653121	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019949	TAAAT	2	10	654541	654550	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_019949	AATTT	2	10	662489	662498	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_019949	TAATT	2	10	680970	680979	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_019949	TAATT	2	10	681997	682006	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019949	TTATA	2	10	687000	687009	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_019949	TAATT	2	10	687032	687041	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_019949	TTTTA	2	10	712969	712978	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_019949	TAATT	2	10	720145	720154	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_019949	TATAA	2	10	740455	740464	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_019949	TGATA	2	10	751786	751795	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_019949	AATTA	2	10	768562	768571	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_019949	ATAAA	2	10	773852	773861	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_019949	TAATT	2	10	773912	773921	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_019949	TGTTT	2	10	777683	777692	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_019949	TAAAA	2	10	781082	781091	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_019949	ATTAA	2	10	786625	786634	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_019949	TAAAA	2	10	793102	793111	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_019949	ATTTT	2	10	793242	793251	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_019949	TATAA	2	10	800778	800787	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_019949	ATTTT	2	10	806285	806294	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_019949	TAATT	2	10	806609	806618	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_019949	TAATA	2	10	822615	822624	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_019949	AAAAT	2	10	823005	823014	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_019949	AAATT	2	10	824941	824950	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_019949	CTTTT	2	10	833170	833179	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
148	NC_019949	ATATT	2	10	833309	833318	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_019949	ACAAA	2	10	833333	833342	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.