MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Microcoleus sp. PCC 7113 plasmid pMIC7113.03

Total Repeats: 214

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019740	AGT	2	6	207	212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019740	TAC	2	6	918	923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_019740	TAA	2	6	1578	1583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019740	ACT	2	6	1611	1616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_019740	AAT	2	6	2647	2652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019740	GAA	2	6	3001	3006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019740	CAG	2	6	3010	3015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_019740	GTC	2	6	8024	8029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_019740	GCT	2	6	8431	8436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_019740	AAT	2	6	8645	8650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019740	CCT	2	6	8723	8728	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_019740	ACA	2	6	8784	8789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_019740	AGG	2	6	10866	10871	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019740	ATA	2	6	11355	11360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019740	GTG	2	6	11566	11571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019740	ACA	2	6	11887	11892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_019740	CTT	2	6	13022	13027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_019740	TTG	2	6	13323	13328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019740	TCT	2	6	13354	13359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_019740	CCT	2	6	13373	13378	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_019740	TTG	2	6	13423	13428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019740	ATT	2	6	14014	14019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019740	CCA	2	6	15135	15140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_019740	CTT	2	6	15693	15698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_019740	CAA	2	6	15832	15837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_019740	TTC	2	6	16056	16061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_019740	ATA	2	6	16070	16075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019740	CAC	2	6	16400	16405	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_019740	TGA	2	6	18466	18471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019740	CAG	2	6	18547	18552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_019740	CCT	2	6	25038	25043	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_019740	GTA	2	6	25055	25060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019740	GGT	2	6	29850	29855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019740	TCA	2	6	29862	29867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_019740	TGC	2	6	29890	29895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_019740	TGT	2	6	29973	29978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019740	GAA	2	6	30005	30010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019740	CTA	2	6	30067	30072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_019740	CTA	2	6	30075	30080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_019740	GTG	2	6	30192	30197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019740	GTC	2	6	30286	30291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_019740	TGT	2	6	30392	30397	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019740	GTA	2	6	30466	30471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019740	GGA	2	6	30515	30520	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019740	TCC	2	6	30534	30539	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_019740	GAA	2	6	30692	30697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019740	TCC	2	6	30788	30793	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_019740	TGC	2	6	30797	30802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_019740	GTA	2	6	33249	33254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019740	AAT	2	6	33300	33305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019740	GGA	2	6	33309	33314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019740	AAC	2	6	33356	33361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_019740	ATT	2	6	33490	33495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019740	CAA	2	6	33648	33653	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_019740	TGA	2	6	33677	33682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019740	ACA	2	6	33719	33724	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_019740	GCC	2	6	33832	33837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_019740	AGC	2	6	33958	33963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_019740	GCT	2	6	34151	34156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_019740	CCA	2	6	34215	34220	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_019740	TAA	2	6	34265	34270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019740	CGT	2	6	34293	34298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_019740	TAA	2	6	35572	35577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019740	CAC	2	6	35639	35644	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_019740	TTA	2	6	38985	38990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019740	AGA	2	6	39095	39100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019740	CTC	2	6	39791	39796	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_019740	TAG	2	6	39812	39817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019740	AAT	2	6	39866	39871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019740	AGC	2	6	40144	40149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_019740	TAC	2	6	40386	40391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_019740	ATT	2	6	40425	40430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019740	GTT	2	6	43515	43520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019740	TTC	2	6	43541	43546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_019740	TGT	2	6	43569	43574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019740	GGA	3	9	43587	43595	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019740	GAT	2	6	43673	43678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019740	TCC	2	6	44384	44389	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_019740	TCC	2	6	44420	44425	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_019740	TCC	2	6	44429	44434	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_019740	TCC	2	6	44456	44461	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_019740	TCC	2	6	44465	44470	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_019740	TCC	2	6	45248	45253	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_019740	CAA	2	6	45333	45338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_019740	CGT	2	6	45348	45353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_019740	TCA	2	6	45516	45521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_019740	GTA	2	6	45541	45546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019740	AGA	2	6	45570	45575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019740	AGC	2	6	45625	45630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_019740	CCT	2	6	45695	45700	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_019740	TGA	2	6	45800	45805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019740	CAA	2	6	45925	45930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_019740	ATT	2	6	45967	45972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019740	AGA	2	6	45978	45983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019740	TTA	3	9	46097	46105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019740	CTG	2	6	46375	46380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_019740	GGA	2	6	46488	46493	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019740	TAG	2	6	46535	46540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019740	AAG	2	6	46603	46608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_019740	AGA	2	6	46713	46718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_019740	GCT	2	6	46752	46757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_019740	CAA	2	6	46759	46764	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_019740	AAT	2	6	46777	46782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019740	AGC	2	6	46796	46801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_019740	GAG	2	6	46823	46828	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019740	GAA	2	6	46888	46893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_019740	GTT	2	6	46932	46937	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019740	GAA	2	6	46986	46991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019740	AGA	2	6	47604	47609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_019740	TGC	2	6	47723	47728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_019740	ATG	2	6	47782	47787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019740	CAC	2	6	47800	47805	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_019740	TGG	2	6	48041	48046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019740	CTG	2	6	48949	48954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_019740	TTG	2	6	48956	48961	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_019740	AGG	2	6	49035	49040	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_019740	GTG	2	6	49044	49049	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_019740	ATT	2	6	49292	49297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019740	TCT	2	6	49375	49380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_019740	AGC	2	6	49483	49488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_019740	AGG	2	6	50351	50356	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019740	AGG	2	6	50432	50437	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019740	AGG	2	6	50441	50446	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_019740	AGG	2	6	50450	50455	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_019740	AGG	2	6	50459	50464	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_019740	TTG	2	6	50478	50483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019740	AGA	2	6	50739	50744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_019740	ATC	2	6	52220	52225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_019740	ATT	2	6	52660	52665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_019740	GAG	2	6	54319	54324	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_019740	CAA	2	6	54402	54407	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_019740	GGA	2	6	54553	54558	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_019740	ACA	2	6	54674	54679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_019740	AAC	2	6	54815	54820	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_019740	GAA	2	6	55133	55138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_019740	CAA	2	6	55206	55211	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_019740	GAA	2	6	55308	55313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_019740	TCC	2	6	55404	55409	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_019740	TGC	2	6	55413	55418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_019740	GTA	2	6	57865	57870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_019740	AAT	2	6	57916	57921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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176	NC_019740	CAA	2	6	67277	67282	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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186	NC_019740	TAA	2	6	73070	73075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.