MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Microcoleus sp. PCC 7113 plasmid pMIC7113.01

Total Repeats: 145

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019739	CAT	2	6	11253	11258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_019739	GCT	2	6	11365	11370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_019739	AGC	2	6	11381	11386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_019739	CAG	2	6	11435	11440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_019739	GCC	2	6	11446	11451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_019739	CTT	3	9	11652	11660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_019739	AAG	2	6	11742	11747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019739	GGC	2	6	11885	11890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_019739	TCG	2	6	11940	11945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_019739	ACC	2	6	12919	12924	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_019739	TAT	2	6	13570	13575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019739	ATC	2	6	13632	13637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_019739	AAC	2	6	13678	13683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_019739	TAT	2	6	14396	14401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019739	TCC	2	6	14416	14421	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_019739	TGT	2	6	14426	14431	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019739	ACT	2	6	14510	14515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_019739	TGC	2	6	19035	19040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_019739	CAA	2	6	19918	19923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_019739	CTC	2	6	20902	20907	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_019739	TAG	2	6	20928	20933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019739	CTT	2	6	20970	20975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_019739	AGC	2	6	20981	20986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_019739	CTC	2	6	24285	24290	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_019739	ATA	2	6	24384	24389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019739	GCT	2	6	24491	24496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_019739	TGT	2	6	24574	24579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019739	TGC	2	6	24692	24697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_019739	TTG	2	6	24905	24910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019739	ACC	2	6	32748	32753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_019739	ACA	2	6	32770	32775	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_019739	TGT	2	6	34621	34626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019739	TTG	2	6	34665	34670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019739	CTT	2	6	35454	35459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_019739	ACG	2	6	43770	43775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_019739	TAC	2	6	43869	43874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_019739	TCA	2	6	43923	43928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_019739	GTT	2	6	44087	44092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019739	TAA	2	6	44349	44354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019739	ATG	2	6	44463	44468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019739	AGA	2	6	44541	44546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019739	GAA	2	6	44552	44557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019739	AGG	2	6	44562	44567	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019739	ATA	2	6	44722	44727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019739	TGG	3	9	44966	44974	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019739	GAC	2	6	45028	45033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_019739	AGC	2	6	45117	45122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_019739	GAC	2	6	45376	45381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_019739	ACA	2	6	45558	45563	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_019739	AAC	3	9	45615	45623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_019739	ATT	3	9	45632	45640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019739	GTT	2	6	45670	45675	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019739	GTA	2	6	45704	45709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019739	TGA	2	6	47813	47818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019739	TGA	2	6	47821	47826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019739	TGC	2	6	47875	47880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_019739	ACG	2	6	48011	48016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_019739	CCT	2	6	49036	49041	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_019739	CAT	2	6	49226	49231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_019739	TAA	2	6	49501	49506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019739	CTG	2	6	50364	50369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_019739	AAG	2	6	51088	51093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019739	TCA	2	6	52212	52217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_019739	TGA	2	6	52228	52233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019739	CTA	2	6	52242	52247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_019739	AAT	2	6	53015	53020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019739	GAT	2	6	54622	54627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019739	AGA	2	6	54636	54641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019739	AGA	2	6	62456	62461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019739	GCC	2	6	64673	64678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_019739	GTT	2	6	64679	64684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019739	TTG	2	6	70039	70044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019739	GAA	2	6	70060	70065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019739	TAA	2	6	71925	71930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019739	CTG	2	6	72818	72823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_019739	AAC	2	6	72887	72892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_019739	GCA	2	6	74032	74037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_019739	TAA	2	6	75604	75609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019739	TGA	2	6	75712	75717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019739	CTT	2	6	75725	75730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_019739	AAC	2	6	75819	75824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_019739	TCA	2	6	76470	76475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_019739	AAG	2	6	76495	76500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019739	AAT	2	6	76521	76526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019739	ATT	2	6	77639	77644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019739	TCT	2	6	77863	77868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_019739	CAA	2	6	78004	78009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_019739	ATG	2	6	79660	79665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019739	TAA	2	6	80895	80900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019739	ATT	2	6	82383	82388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019739	TGA	2	6	82391	82396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019739	ATT	2	6	82438	82443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_019739	ACT	2	6	82503	82508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_019739	CTC	2	6	82515	82520	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_019739	ACT	2	6	82620	82625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_019739	TCT	2	6	85515	85520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_019739	GGA	2	6	85640	85645	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019739	GTT	2	6	87803	87808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019739	GAA	2	6	87939	87944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_019739	TTA	2	6	93554	93559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_019739	AAT	2	6	93581	93586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_019739	TAT	2	6	94617	94622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_019739	TTG	2	6	95433	95438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019739	AGA	2	6	95476	95481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019739	AGG	2	6	95601	95606	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019739	ATA	2	6	95623	95628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_019739	AAC	2	6	97550	97555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_019739	CTC	2	6	99514	99519	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_019739	GAA	2	6	105579	105584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_019739	AAT	2	6	105664	105669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019739	TCT	2	6	105781	105786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_019739	AGA	2	6	107328	107333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_019739	TTG	2	6	107747	107752	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019739	GAG	2	6	107762	107767	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019739	TGT	2	6	107938	107943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_019739	ACA	2	6	111317	111322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_019739	GAA	2	6	111469	111474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_019739	ACC	2	6	111560	111565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_019739	ATG	2	6	111623	111628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_019739	AGG	2	6	111656	111661	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_019739	AGC	2	6	111678	111683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_019739	TAC	2	6	111684	111689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_019739	TTG	2	6	111829	111834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_019739	ACT	3	9	111840	111848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_019739	GGT	2	6	111905	111910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_019739	CTG	2	6	111949	111954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_019739	TGT	2	6	111983	111988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_019739	CCT	2	6	112043	112048	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_019739	TGA	2	6	112110	112115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_019739	GGA	2	6	112409	112414	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_019739	CAG	2	6	112425	112430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_019739	CAA	2	6	112529	112534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_019739	TCA	2	6	132104	132109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_019739	GAA	3	9	134230	134238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_019739	CAT	2	6	134293	134298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_019739	TGT	2	6	134335	134340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_019739	TAA	2	6	134372	134377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_019739	AGT	2	6	135355	135360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_019739	CTC	2	6	135381	135386	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_019739	AGC	2	6	135491	135496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_019739	AAC	2	6	135634	135639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_019739	CGC	2	6	135646	135651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
143	NC_019739	TGG	2	6	135700	135705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
144	NC_019739	ATG	2	6	135746	135751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_019739	TCA	2	6	135805	135810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.