MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Microcoleus sp. PCC 7113 chromosome

Total Repeats: 4055

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019738	GTAA	2	8	129	136	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019738	ATCT	2	8	7010	7017	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_019738	CTAT	2	8	12054	12061	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_019738	ATAG	2	8	12062	12069	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019738	TCTT	2	8	14456	14463	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_019738	TAGT	2	8	14921	14928	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019738	AATT	2	8	16248	16255	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019738	GGTA	2	8	19061	19068	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019738	CATT	2	8	20648	20655	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_019738	CTTG	2	8	20702	20709	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_019738	CAGC	2	8	25379	25386	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_019738	CTTT	2	8	25448	25455	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_019738	TCGT	2	8	25471	25478	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_019738	ATCA	2	8	27647	27654	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_019738	ATGA	2	8	30552	30559	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019738	TCGG	2	8	30747	30754	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_019738	TCCC	2	8	30960	30967	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
18	NC_019738	GCAG	2	8	31588	31595	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_019738	GCTG	2	8	32161	32168	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_019738	AGCT	2	8	32795	32802	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_019738	TCGG	2	8	32859	32866	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_019738	TCGC	2	8	33385	33392	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_019738	TGCT	2	8	33529	33536	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_019738	CGAC	2	8	34051	34058	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
25	NC_019738	TCGC	3	12	34403	34414	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_019738	TTTG	2	8	35616	35623	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019738	ACAG	2	8	37698	37705	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_019738	TACT	2	8	39075	39082	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_019738	ATTG	2	8	41220	41227	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019738	AATT	2	8	43629	43636	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019738	GCTT	2	8	55141	55148	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_019738	TTGA	2	8	56516	56523	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019738	TCAA	2	8	56641	56648	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_019738	GATT	2	8	57454	57461	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019738	ATCG	2	8	57569	57576	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_019738	TTCT	2	8	59620	59627	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_019738	CAAT	2	8	59918	59925	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_019738	TAAT	2	8	60734	60741	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019738	TGAG	2	8	61909	61916	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019738	CAAA	2	8	62425	62432	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_019738	GGAT	2	8	62463	62470	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019738	ACAG	2	8	62716	62723	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_019738	TCCG	2	8	63307	63314	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
44	NC_019738	AGAT	2	8	69047	69054	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019738	GACT	2	8	72881	72888	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_019738	TAGC	2	8	73016	73023	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_019738	TAAA	2	8	73137	73144	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019738	AATC	2	8	74330	74337	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_019738	TAGT	2	8	74644	74651	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019738	AACA	2	8	74681	74688	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_019738	TGGA	2	8	78739	78746	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019738	TTTC	2	8	78968	78975	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_019738	ACAT	2	8	79050	79057	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_019738	AGGA	2	8	80620	80627	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019738	TCCC	2	8	81347	81354	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
56	NC_019738	TCCA	2	8	88187	88194	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_019738	GGAG	2	8	88365	88372	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019738	TGAT	2	8	90437	90444	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019738	GGGA	2	8	91806	91813	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019738	CAAA	2	8	91920	91927	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_019738	GCTG	2	8	94036	94043	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
62	NC_019738	TCCA	2	8	94104	94111	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_019738	ATCT	2	8	95185	95192	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_019738	AGTC	2	8	95264	95271	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_019738	TTTA	2	8	96136	96143	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019738	CCTT	2	8	96172	96179	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_019738	TGCT	2	8	102661	102668	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_019738	CCTG	2	8	104004	104011	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_019738	AGCT	2	8	117716	117723	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_019738	TTAT	2	8	117745	117752	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019738	TAGG	2	8	122370	122377	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019738	TTTA	2	8	122442	122449	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019738	GCAA	2	8	123344	123351	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_019738	TCTT	2	8	123929	123936	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_019738	GATA	2	8	123939	123946	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019738	TCCA	2	8	124925	124932	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_019738	TGCC	2	8	125236	125243	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
78	NC_019738	TATT	2	8	125477	125484	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019738	TATC	2	8	125526	125533	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_019738	TTGA	2	8	130547	130554	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019738	CGCT	2	8	131340	131347	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
82	NC_019738	TTCT	2	8	131457	131464	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_019738	ATCT	2	8	132847	132854	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_019738	AGCA	2	8	135152	135159	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_019738	GAAC	2	8	139035	139042	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_019738	CTTT	2	8	139155	139162	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_019738	AAAT	2	8	140901	140908	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019738	TAAG	2	8	143848	143855	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019738	AATA	2	8	145988	145995	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019738	AGAC	2	8	147797	147804	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_019738	ACTA	2	8	147877	147884	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_019738	TACT	2	8	147910	147917	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_019738	GAAA	2	8	148079	148086	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019738	CTAA	2	8	159601	159608	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_019738	CTAT	2	8	161924	161931	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_019738	CTTT	2	8	162010	162017	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_019738	AGAA	2	8	164249	164256	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019738	CAAG	2	8	164291	164298	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_019738	TCTA	2	8	165590	165597	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_019738	AATC	2	8	165869	165876	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_019738	CTTT	2	8	168477	168484	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_019738	TTTC	2	8	168510	168517	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_019738	TTAT	2	8	169343	169350	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019738	CTAT	2	8	169628	169635	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_019738	ACTA	2	8	169713	169720	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_019738	TCAT	2	8	176274	176281	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_019738	GCCA	2	8	176443	176450	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
108	NC_019738	AGAA	2	8	177581	177588	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019738	TACT	2	8	177712	177719	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_019738	AGCT	2	8	181935	181942	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_019738	ATTG	2	8	182787	182794	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019738	ACCT	2	8	182843	182850	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_019738	AACA	2	8	183939	183946	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_019738	TTTC	2	8	185337	185344	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_019738	TAGA	2	8	188299	188306	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_019738	TCAG	2	8	188729	188736	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_019738	TTCT	2	8	190951	190958	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_019738	ATCT	2	8	191159	191166	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_019738	CTTT	2	8	193269	193276	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_019738	GAAA	2	8	194776	194783	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_019738	TAAA	2	8	195151	195158	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019738	ATCT	2	8	195299	195306	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_019738	GTAG	2	8	197701	197708	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_019738	TATG	2	8	198863	198870	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_019738	GTAG	2	8	198953	198960	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_019738	GTGA	2	8	207937	207944	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019738	ATGG	2	8	211478	211485	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_019738	TTCT	2	8	212666	212673	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_019738	TTCA	2	8	216662	216669	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_019738	GCCT	2	8	220009	220016	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
131	NC_019738	ACGG	2	8	220127	220134	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
132	NC_019738	ATGG	2	8	221782	221789	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_019738	GTAG	2	8	221818	221825	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_019738	GCCC	2	8	223016	223023	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
135	NC_019738	GGTT	2	8	228144	228151	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_019738	CATC	2	8	228379	228386	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_019738	AGTC	2	8	228400	228407	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_019738	AGCT	2	8	228453	228460	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
139	NC_019738	GAGG	2	8	229900	229907	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
140	NC_019738	TGGT	2	8	230200	230207	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_019738	TAAA	2	8	230499	230506	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_019738	TAAT	2	8	232815	232822	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_019738	GGTT	2	8	240375	240382	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_019738	CCTC	2	8	241450	241457	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
145	NC_019738	GACA	2	8	243713	243720	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
146	NC_019738	GATA	3	12	243828	243839	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_019738	GATT	2	8	244828	244835	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_019738	TCTA	2	8	251708	251715	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_019738	CAGC	2	8	251755	251762	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
150	NC_019738	TTTC	2	8	255724	255731	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_019738	TCTT	2	8	257092	257099	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
152	NC_019738	AGGG	2	8	262232	262239	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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