MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycoplasma hyorhinis SK76 chromosome

Total Repeats: 71

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019552	TATTGT	2	12	1304	1315	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019552	ATTTTT	2	12	18027	18038	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019552	CTGGAG	2	12	22582	22593	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_019552	AAGTGT	2	12	22889	22900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019552	ATATTT	2	12	25720	25731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019552	ATAAAA	2	12	35782	35793	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019552	AATTAA	2	12	46560	46571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019552	GATAGA	2	12	51008	51019	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019552	ATTTTT	2	12	53635	53646	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019552	AATTAA	2	12	61246	61257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019552	TTTCTA	2	12	65967	65978	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_019552	TTTGTT	2	12	78243	78254	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019552	TAAAAA	2	12	138819	138830	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019552	ATTTGA	2	12	208574	208585	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019552	TCAAAT	2	12	215415	215426	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_019552	TGTAAT	2	12	244891	244902	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019552	TTTCAT	2	12	264994	265005	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_019552	TTTGAT	2	12	265185	265196	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019552	TTTTAG	2	12	277371	277382	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019552	ATAAAG	2	12	290009	290020	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019552	TAAAAT	2	12	293010	293021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019552	CTTTTG	2	12	293164	293175	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_019552	TAAAAA	2	12	299654	299665	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019552	GTAAAA	2	12	311034	311045	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019552	TATAAA	2	12	323649	323660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019552	GTAATT	2	12	341380	341391	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019552	AATTAA	2	12	352865	352876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019552	TAACAC	2	12	368672	368683	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_019552	TTTTTA	2	12	391489	391500	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019552	TTTTCA	2	12	438782	438793	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_019552	AAAATA	2	12	440229	440240	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019552	ATTTAA	2	12	441665	441676	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019552	ATTTTT	2	12	450212	450223	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019552	TTTTGT	2	12	450265	450276	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019552	ATTTTT	2	12	477553	477564	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019552	ACTGAT	2	12	485418	485429	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_019552	TAAAAA	2	12	520236	520247	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019552	ATTTTT	2	12	540111	540122	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019552	TATTAA	2	12	550274	550285	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019552	ATCTAA	2	12	554663	554674	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_019552	AAAATT	2	12	555692	555703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019552	ACTTGT	2	12	556383	556394	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_019552	AGCCAA	2	12	562812	562823	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_019552	TTTTAA	2	12	563635	563646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019552	TAAAAA	3	18	576434	576451	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019552	AATAAA	2	12	583293	583304	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019552	AATAAA	2	12	585091	585102	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019552	TAATTT	2	12	585202	585213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019552	TTTAAA	2	12	607632	607643	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019552	AAATAA	2	12	614938	614949	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019552	TATAAA	2	12	657158	657169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019552	AAATAA	2	12	666433	666444	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019552	ATCAAA	2	12	672442	672453	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_019552	TTTTAA	2	12	687345	687356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019552	TTATAA	2	12	699123	699134	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019552	TATTTT	2	12	706336	706347	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019552	TAAAAA	2	12	712219	712230	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019552	TAAAAT	2	12	712297	712308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019552	ATATCT	2	12	714374	714385	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_019552	CAAAAA	2	12	720044	720055	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_019552	TTAAAT	2	12	746054	746065	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019552	ATAAAA	2	12	746166	746177	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019552	TAATGT	2	12	752837	752848	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019552	AAAGAA	2	12	755074	755085	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019552	ATTACA	2	12	763304	763315	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_019552	TCATAA	2	12	785444	785455	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_019552	TAAAAA	2	12	820951	820962	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019552	AAACAA	2	12	826138	826149	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_019552	ATGTAG	2	12	826155	826166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019552	GTAAAA	2	12	833023	833034	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019552	TATAAT	2	12	836667	836678	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.