MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Methanolobus psychrophilus R15 chromosome

Total Repeats: 136

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018876	CAATAC	2	12	9138	9149	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_018876	CGATAC	2	12	12336	12347	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_018876	ATCAAA	2	12	52610	52621	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_018876	ATAGAA	2	12	97965	97976	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018876	AGGGAG	2	12	98164	98175	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018876	TATTTA	2	12	121644	121655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018876	CTTTTA	2	12	136916	136927	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_018876	GATAAA	2	12	181300	181311	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018876	CAATTT	2	12	190372	190383	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_018876	AAAACC	2	12	216608	216619	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_018876	TTAAAC	2	12	221958	221969	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_018876	CAATAT	2	12	226059	226070	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_018876	ATTAAT	2	12	228011	228022	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018876	AAATAT	2	12	228952	228963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018876	ATTCTT	2	12	233824	233835	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_018876	GATTTT	2	12	242537	242548	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018876	ATCAAA	2	12	274988	274999	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_018876	AATCAG	2	12	284643	284654	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_018876	ATCATA	2	12	314246	314257	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_018876	AATATA	2	12	317503	317514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018876	TTTTCA	2	12	317554	317565	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_018876	CCATTT	2	12	317575	317586	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_018876	AAATAA	2	12	367252	367263	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018876	TATTCT	2	12	373960	373971	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_018876	TAAAAA	2	12	384431	384442	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018876	TAAATC	2	12	393017	393028	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_018876	ATTCTT	2	12	399537	399548	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_018876	AATAAA	2	12	442446	442457	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018876	TATAAT	2	12	456255	456266	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018876	ATAATT	2	12	470019	470030	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018876	ACAAGC	2	12	491575	491586	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_018876	TAAATA	2	12	542153	542164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018876	GGCACC	2	12	562871	562882	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
34	NC_018876	AAATAT	2	12	582967	582978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018876	AACTAT	2	12	590056	590067	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_018876	AAAGAA	2	12	604295	604306	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018876	TCAATA	2	12	623252	623263	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_018876	CTTTTC	2	12	626724	626735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_018876	TTAAAA	2	12	630151	630162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018876	TTATCA	2	12	669013	669024	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_018876	TAATCA	2	12	738819	738830	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_018876	TATTTT	2	12	752870	752881	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018876	CATATC	2	12	797031	797042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_018876	CACGAT	2	12	856869	856880	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_018876	TATTGT	2	12	871331	871342	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018876	AAAAGC	2	12	885042	885053	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_018876	AGTATT	2	12	902078	902089	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018876	ATGATA	2	12	932725	932736	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018876	TATAAA	2	12	939086	939097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018876	CTTTTT	2	12	975746	975757	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_018876	AGGAGA	2	12	1027641	1027652	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018876	ACAAAT	2	12	1061522	1061533	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_018876	TTTCAC	2	12	1087110	1087121	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_018876	CTTTTT	2	12	1089634	1089645	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_018876	CATTCC	2	12	1097100	1097111	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_018876	TAATCT	2	12	1136537	1136548	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_018876	ATGATC	2	12	1158283	1158294	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_018876	AATTTA	2	12	1238357	1238368	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018876	AAATAT	2	12	1256045	1256056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018876	AAAAAG	2	12	1292223	1292234	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018876	ATATTT	2	12	1311493	1311504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018876	ATTGCA	2	12	1350999	1351010	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_018876	ACACAT	2	12	1418840	1418851	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_018876	TTCTTT	2	12	1441666	1441677	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_018876	CGGTCA	2	12	1449397	1449408	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_018876	ACCCGT	2	12	1454187	1454198	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
67	NC_018876	GAATCT	2	12	1471610	1471621	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_018876	GAAAAA	2	12	1491314	1491325	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018876	ATAATT	2	12	1537625	1537636	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018876	ACAGTC	2	12	1542882	1542893	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_018876	ATAAAT	2	12	1544063	1544074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018876	CTTCAT	2	12	1580105	1580116	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_018876	CAGGAT	2	12	1592325	1592336	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_018876	ATTTAT	2	12	1604946	1604957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018876	TGTTCC	2	12	1630254	1630265	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_018876	ACTCAC	2	12	1647194	1647205	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_018876	ATATTT	2	12	1651547	1651558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018876	TATAAA	2	12	1667506	1667517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018876	ATGGTT	2	12	1698710	1698721	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018876	TAATTT	2	12	1741583	1741594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018876	TCAAAT	2	12	1772802	1772813	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_018876	CTGTAT	2	12	1836379	1836390	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_018876	TGTTTA	2	12	1852103	1852114	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018876	CCTTTT	2	12	1882979	1882990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_018876	TGATTA	2	12	1883025	1883036	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018876	TATTTA	2	12	1914805	1914816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018876	ACTAAC	2	12	1915780	1915791	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_018876	AGTAAT	2	12	1924452	1924463	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018876	TGATTG	2	12	1949170	1949181	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018876	TATTTC	2	12	1973945	1973956	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_018876	ACCTCC	2	12	1974557	1974568	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_018876	AATCCA	2	12	2011286	2011297	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_018876	GAAAAA	2	12	2109087	2109098	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018876	AAATTT	2	12	2117976	2117987	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018876	GCTCTT	2	12	2119910	2119921	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_018876	AGTTGA	2	12	2142956	2142967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018876	ATGGCT	2	12	2142988	2142999	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_018876	TATTTT	2	12	2154414	2154425	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018876	TTTATG	2	12	2183127	2183138	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018876	TTGAGA	2	12	2184798	2184809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018876	TGGAAT	2	12	2195072	2195083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018876	TATTGA	2	12	2198332	2198343	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018876	ATTGGC	2	12	2212588	2212599	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_018876	AACCCC	2	12	2220375	2220386	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_018876	TTTTAA	2	12	2233958	2233969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018876	TATATT	2	12	2254621	2254632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018876	TATTTT	2	12	2341658	2341669	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018876	AGTTAC	2	12	2341968	2341979	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_018876	TATTCA	2	12	2360669	2360680	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_018876	CCTGCA	2	12	2366186	2366197	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
111	NC_018876	TTGCAT	2	12	2395365	2395376	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_018876	GGTACT	2	12	2424450	2424461	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_018876	AGCTTT	2	12	2430376	2430387	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_018876	GAAAAA	2	12	2446490	2446501	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018876	AACTAA	2	12	2450842	2450853	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_018876	TATTTA	2	12	2486746	2486757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018876	ACGTTT	2	12	2516962	2516973	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_018876	CAATAT	2	12	2552169	2552180	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_018876	TATAAT	2	12	2552333	2552344	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018876	TTGATA	2	12	2553728	2553739	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018876	CATTCC	2	12	2553782	2553793	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_018876	GTGTAA	2	12	2578206	2578217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018876	ATCCTA	2	12	2584505	2584516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_018876	TTATTT	2	12	2648265	2648276	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018876	CAAATT	2	12	2682529	2682540	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_018876	TATTTA	2	12	2722032	2722043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018876	GTTCCT	2	12	2728364	2728375	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_018876	AGAAAG	2	12	2782179	2782190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018876	TTTTAT	2	12	2789633	2789644	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018876	TAAAAA	2	12	2870547	2870558	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018876	TATTTT	2	12	2879400	2879411	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018876	TCAACT	2	12	2932639	2932650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_018876	TGTAAG	2	12	2941484	2941495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018876	TATTTT	2	12	2943351	2943362	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018876	ATTTCA	2	12	3055738	3055749	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
136	NC_018876	GCATGG	2	12	3063964	3063975	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.