MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycoplasma genitalium M6282 chromosome

Total Repeats: 119

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018496	GCAAA	2	10	10957	10966	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_018496	AGCAG	2	10	12148	12157	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_018496	ATTTA	2	10	12180	12189	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018496	TAATT	2	10	12273	12282	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018496	TTTAA	2	10	12931	12940	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018496	TGATT	2	10	13191	13200	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018496	AATTT	2	10	13545	13554	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018496	AAAAC	2	10	15231	15240	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_018496	TTTAA	2	10	15490	15499	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018496	AATTA	2	10	28560	28569	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018496	CATGA	2	10	28989	28998	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_018496	CAAAT	2	10	37081	37090	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_018496	AAGTT	2	10	37596	37605	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018496	TAAGT	2	10	37765	37774	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018496	TTTTC	2	10	51741	51750	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_018496	TTTAC	2	10	52296	52305	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_018496	AAAGA	2	10	56790	56799	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018496	TATCT	2	10	71605	71614	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_018496	GCTAT	2	10	72125	72134	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_018496	TTATT	2	10	84524	84533	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018496	AATTA	2	10	87889	87898	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018496	AAGAA	2	10	93402	93411	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018496	TAACT	2	10	94617	94626	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_018496	ACCAA	2	10	96612	96621	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
25	NC_018496	TGAAC	2	10	96672	96681	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_018496	TTAAG	2	10	96697	96706	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018496	ACTTT	2	10	100072	100081	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_018496	TGAAC	2	10	100487	100496	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
29	NC_018496	CAAAA	2	10	100861	100870	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_018496	TTGAA	2	10	101230	101239	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018496	CTTTT	2	10	102221	102230	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_018496	AAAGG	2	10	115812	115821	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018496	GCAAT	2	10	115966	115975	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_018496	GAAAA	2	10	121376	121385	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018496	ATCCA	2	10	131120	131129	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
36	NC_018496	TTTAT	2	10	149986	149995	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018496	CTTCA	2	10	150046	150055	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
38	NC_018496	ATTCA	2	10	150970	150979	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_018496	TCGTG	2	10	170744	170753	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
40	NC_018496	CAATA	2	10	171397	171406	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_018496	GAAAA	2	10	171618	171627	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018496	CTCAT	2	10	173924	173933	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
43	NC_018496	TTTCG	2	10	186247	186256	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
44	NC_018496	AACTT	2	10	199293	199302	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_018496	ACCTT	2	10	200084	200093	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
46	NC_018496	CAAAA	2	10	203155	203164	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_018496	CCAAC	2	10	224547	224556	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
48	NC_018496	AAACA	2	10	224843	224852	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_018496	TTACC	2	10	225027	225036	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
50	NC_018496	AAACC	2	10	225163	225172	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
51	NC_018496	TTAGA	2	10	225180	225189	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018496	AACAG	2	10	225470	225479	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
53	NC_018496	AACCA	2	10	225520	225529	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
54	NC_018496	GTTTT	2	10	229097	229106	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018496	TTAAT	2	10	231503	231512	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018496	AAACT	2	10	231516	231525	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_018496	AAGTT	2	10	236203	236212	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018496	TCATT	2	10	266106	266115	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_018496	TTAAT	2	10	269882	269891	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018496	CAATT	2	10	270745	270754	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_018496	CAAAA	2	10	270926	270935	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_018496	TTGTT	2	10	271180	271189	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018496	GTCAA	2	10	272058	272067	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
64	NC_018496	GCTTT	2	10	272659	272668	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
65	NC_018496	TTTAC	2	10	289091	289100	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_018496	AATTA	2	10	295287	295296	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018496	ATTTT	2	10	304851	304860	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018496	TTTTA	2	10	305372	305381	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018496	AAAAC	2	10	305444	305453	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_018496	AAAAC	2	10	305613	305622	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_018496	TTATT	2	10	308710	308719	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018496	AATTG	2	10	309001	309010	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018496	CCAAC	2	10	314373	314382	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
74	NC_018496	TCACT	2	10	328745	328754	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
75	NC_018496	GTTGT	2	10	328957	328966	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018496	AAAAC	2	10	341531	341540	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_018496	TAAAT	2	10	343271	343280	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018496	CAAAA	2	10	344565	344574	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_018496	ATTTA	2	10	346193	346202	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018496	TAAAT	2	10	362336	362345	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018496	TTTAA	2	10	364038	364047	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018496	TAAAC	2	10	368100	368109	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_018496	TTTAA	2	10	371482	371491	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018496	TCATG	2	10	378566	378575	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
85	NC_018496	TCTTA	2	10	378917	378926	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_018496	GCATC	2	10	379270	379279	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
87	NC_018496	TTTGC	2	10	379756	379765	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
88	NC_018496	TCGCT	2	10	390902	390911	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
89	NC_018496	AAAGC	2	10	398313	398322	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
90	NC_018496	AATTA	2	10	408465	408474	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018496	ATAAC	2	10	422873	422882	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_018496	ACTAA	2	10	425911	425920	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_018496	CCACT	2	10	426365	426374	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
94	NC_018496	GTTTG	2	10	427751	427760	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018496	TCTCC	2	10	448300	448309	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
96	NC_018496	TTAAA	2	10	450593	450602	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018496	GTTTG	2	10	452174	452183	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018496	GTTAT	2	10	458955	458964	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018496	GAAAA	2	10	462429	462438	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018496	AATTA	2	10	463121	463130	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018496	TTAAA	2	10	476938	476947	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018496	GAAAA	2	10	478014	478023	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018496	TCAAA	2	10	483330	483339	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_018496	TTTGT	2	10	492964	492973	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018496	AATTA	2	10	503902	503911	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018496	GAAAT	2	10	508398	508407	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018496	TTTTC	2	10	508452	508461	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_018496	AAATG	2	10	515654	515663	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018496	TTTCT	2	10	515688	515697	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_018496	TAAAT	2	10	520871	520880	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018496	AAATT	2	10	533205	533214	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018496	TTTTC	2	10	537757	537766	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_018496	AATTG	2	10	543839	543848	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018496	TTTAA	2	10	550983	550992	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018496	ATTTT	2	10	551463	551472	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018496	AACAA	2	10	551544	551553	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_018496	AACAT	2	10	552444	552453	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_018496	GAATT	2	10	557445	557454	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018496	AAAAT	2	10	563385	563394	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.