MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycoplasma gallisepticum NC08_2008.031-4-3P chromosome

Total Repeats: 60

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018413	ATATTT	2	12	82	93	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018413	TTTTTA	2	12	20635	20646	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018413	TTAAAA	2	12	50193	50204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018413	TTATAT	3	18	61376	61393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018413	AAGCGA	2	12	81125	81136	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_018413	ATATCG	2	12	83456	83467	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_018413	TTAGTT	2	12	132811	132822	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018413	ACAGAA	2	12	135478	135489	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_018413	TTTAAC	2	12	149586	149597	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_018413	ATTTTT	2	12	187088	187099	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018413	CAATAT	2	12	218540	218551	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_018413	TTAATC	2	12	221145	221156	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_018413	AAAACT	2	12	226205	226216	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_018413	GAAAAA	2	12	253815	253826	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018413	GTTAAA	2	12	276064	276075	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018413	TTTTAT	2	12	284037	284048	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018413	ATTTAA	2	12	310953	310964	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018413	AGGCGA	2	12	315121	315132	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_018413	AAGCGA	2	12	317229	317240	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_018413	ATATCG	2	12	319559	319570	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_018413	GAAAAA	2	12	344918	344929	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018413	GCTTAT	2	12	349632	349643	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_018413	TTATTT	2	12	358594	358605	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018413	GATCAT	2	12	376679	376690	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_018413	ATTTAT	2	12	383702	383713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018413	ATTAAA	2	12	393961	393972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018413	TTTATT	2	12	424252	424263	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018413	CAAAAA	2	12	424283	424294	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_018413	ATATTT	2	12	429111	429122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018413	TTTGCT	2	12	441891	441902	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_018413	ATCAGC	2	12	455218	455229	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_018413	TTATCA	2	12	455513	455524	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_018413	TTTTAT	2	12	461348	461359	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018413	AGTTGA	2	12	472530	472541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018413	ATTTTT	2	12	508303	508314	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018413	GTTTTG	2	12	527215	527226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018413	GTTTTT	2	12	527474	527485	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018413	TTAAAT	2	12	576523	576534	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018413	TAGAAA	2	12	600882	600893	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018413	TTATAA	2	12	618594	618605	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018413	GTTTTT	2	12	632955	632966	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018413	TAAAAA	2	12	641799	641810	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018413	TGCAAA	2	12	645928	645939	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_018413	TATTTA	2	12	672456	672467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018413	TTTAAT	2	12	677398	677409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018413	AAAATA	2	12	688342	688353	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018413	AAAGAT	2	12	768035	768046	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018413	AAAGAT	2	12	770466	770477	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018413	GAAAAT	2	12	777566	777577	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018413	ATCTAG	2	12	778841	778852	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_018413	TGTTCT	2	12	779649	779660	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_018413	TCGCCT	2	12	812708	812719	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
53	NC_018413	ATATTT	2	12	821719	821730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018413	TGATAA	2	12	839498	839509	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018413	TATAAA	2	12	846312	846323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018413	ATTAAA	2	12	851763	851774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018413	AAGAAC	2	12	852011	852022	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_018413	CTAAAC	2	12	863192	863203	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_018413	TTAATC	2	12	872553	872564	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_018413	AACTAA	2	12	903968	903979	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.