MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycoplasma gallisepticum NC08_2008.031-4-3P chromosome

Total Repeats: 131

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018413	AAAAC	2	10	824	833	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_018413	ATCAT	2	10	1087	1096	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_018413	AAAGT	2	10	1575	1584	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018413	ATATT	2	10	1852	1861	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018413	AGTTA	2	10	30063	30072	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018413	ATTTT	2	10	36628	36637	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018413	TTAAT	2	10	49805	49814	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018413	TTAGC	2	10	63804	63813	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_018413	TTTAT	2	10	64356	64365	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018413	GCAAA	2	10	68426	68435	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_018413	CTAAA	2	10	78885	78894	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_018413	TTTAA	2	10	80101	80110	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018413	CAAAC	2	10	80202	80211	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
14	NC_018413	ATCAA	2	10	80416	80425	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_018413	ATATA	2	10	80431	80440	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018413	CTCAT	2	10	82993	83002	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
17	NC_018413	CTTCC	2	10	83267	83276	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
18	NC_018413	TAATA	2	10	87007	87016	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018413	TAAAA	2	10	94937	94946	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018413	ATATA	2	10	105261	105270	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018413	GAGAT	2	10	118486	118495	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018413	ATCTC	2	10	118512	118521	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
23	NC_018413	GTTTT	2	10	118677	118686	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018413	ACATA	2	10	122766	122775	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_018413	TTTGC	2	10	122893	122902	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_018413	ATTTT	2	10	132798	132807	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018413	TATTT	2	10	134296	134305	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018413	TTACT	2	10	134775	134784	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_018413	AATTA	2	10	134979	134988	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018413	TAAAT	2	10	141283	141292	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018413	GTTAG	2	10	149574	149583	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018413	TCTTA	2	10	169741	169750	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_018413	TTTTA	2	10	175058	175067	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018413	TAAAG	2	10	180359	180368	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018413	TTTTA	2	10	181874	181883	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018413	TGATC	2	10	183316	183325	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
37	NC_018413	TAAAA	2	10	202353	202362	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018413	TAGCT	2	10	203161	203170	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
39	NC_018413	TATAT	2	10	211172	211181	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018413	TCTTT	2	10	251351	251360	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_018413	TAGTT	2	10	273505	273514	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018413	TATTT	2	10	274507	274516	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018413	CTAAC	2	10	276078	276087	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
44	NC_018413	AGAGA	2	10	301162	301171	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018413	ATATT	2	10	306933	306942	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018413	AGTTA	2	10	307045	307054	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018413	TAATT	2	10	309218	309227	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018413	TCTAG	2	10	315043	315052	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
49	NC_018413	TCGTG	2	10	315462	315471	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
50	NC_018413	TAGGG	2	10	315843	315852	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018413	ATCAA	2	10	316520	316529	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_018413	ATATA	2	10	316535	316544	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018413	CTCAT	2	10	319096	319105	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
54	NC_018413	CTTCC	2	10	319370	319379	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
55	NC_018413	AATTA	2	10	344471	344480	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018413	ATTAT	2	10	344500	344509	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018413	GAAAA	2	10	344530	344539	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018413	TTAAA	2	10	345750	345759	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018413	TAAAT	2	10	349274	349283	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018413	ATTAA	2	10	349285	349294	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018413	TATAT	2	10	352258	352267	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018413	AGTTA	2	10	357003	357012	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018413	ATTTT	2	10	359436	359445	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018413	ATTAA	2	10	367458	367467	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018413	AAATT	2	10	367572	367581	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018413	TAGTT	2	10	369847	369856	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018413	TAAAA	2	10	374381	374390	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018413	AAGTT	2	10	374667	374676	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018413	AAATT	2	10	385160	385169	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018413	AAGAA	2	10	403892	403901	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018413	ATATA	2	10	429092	429101	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018413	GTCAG	2	10	430884	430893	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
73	NC_018413	ATCTA	2	10	442064	442073	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_018413	TTAAC	2	10	443674	443683	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_018413	TAAAA	2	10	461315	461324	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018413	TAATT	2	10	470672	470681	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018413	TAAAA	2	10	511565	511574	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018413	ATCTT	2	10	512381	512390	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_018413	ATTTA	2	10	516882	516891	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018413	AAATT	2	10	527314	527323	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018413	TTAGT	2	10	527360	527369	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018413	ATTTT	2	10	529993	530002	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018413	TTAAA	2	10	560816	560825	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018413	ATCAA	2	10	562384	562393	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_018413	TTTAT	2	10	568954	568963	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018413	TAGTC	2	10	569507	569516	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
87	NC_018413	TAATT	2	10	570235	570244	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018413	TGAAA	2	10	574707	574716	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018413	AAATT	2	10	576422	576431	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018413	ATTTA	2	10	576446	576455	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018413	AAATC	2	10	577738	577747	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_018413	TAATT	2	10	581712	581721	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018413	CATTT	2	10	588901	588910	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_018413	AAATG	2	10	588917	588926	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018413	TATTT	2	10	601107	601116	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018413	TTAAT	2	10	612461	612470	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018413	AAATA	2	10	614059	614068	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018413	CTTAT	2	10	615333	615342	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_018413	ATTAT	2	10	618490	618499	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018413	TTAAC	2	10	632763	632772	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_018413	TAATA	2	10	645749	645758	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018413	TTTAA	2	10	646174	646183	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018413	AGATC	2	10	670293	670302	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
104	NC_018413	TTAAG	2	10	672228	672237	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018413	TTTTG	2	10	672269	672278	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018413	ATTTA	2	10	677922	677931	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018413	ATTTA	2	10	678135	678144	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018413	CAAAA	2	10	688264	688273	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_018413	TATAA	2	10	693167	693176	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018413	AAATT	2	10	696197	696206	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018413	TATTT	2	10	702605	702614	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018413	CCAAA	2	10	765540	765549	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
113	NC_018413	AAAAG	2	10	778665	778674	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018413	TTTTC	2	10	779505	779514	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_018413	TTTTA	2	10	798133	798142	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018413	ATTAA	2	10	807511	807520	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018413	CCCTA	2	10	811988	811997	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
118	NC_018413	CACGA	2	10	812369	812378	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
119	NC_018413	CTAGA	2	10	812788	812797	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
120	NC_018413	TATCT	2	10	822390	822399	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_018413	ACTTC	2	10	830623	830632	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
122	NC_018413	AAAGC	2	10	838517	838526	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
123	NC_018413	AGAAA	2	10	838680	838689	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018413	AGATC	2	10	843765	843774	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
125	NC_018413	TTAAT	2	10	849749	849758	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018413	AATTA	2	10	853134	853143	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018413	ATAGC	2	10	884417	884426	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
128	NC_018413	TCCTT	2	10	884560	884569	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
129	NC_018413	AATTT	2	10	884768	884777	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018413	AATCA	2	10	898694	898703	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_018413	TAACC	2	10	913828	913837	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.