MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycoplasma gallisepticum NC06_2006.080-5-2P chromosome

Total Repeats: 61

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018411	ATATTT	2	12	82	93	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018411	TTTTTA	2	12	20635	20646	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018411	TTAAAA	2	12	50194	50205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018411	TTATAT	3	18	61377	61394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018411	AAGCGA	2	12	81127	81138	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_018411	ATATCG	2	12	83457	83468	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_018411	TTAGTT	2	12	132889	132900	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018411	ACAGAA	2	12	135556	135567	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_018411	TTTAAC	2	12	149664	149675	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_018411	ATTTTT	2	12	187088	187099	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018411	CAATAT	2	12	218545	218556	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_018411	TTAATC	2	12	221150	221161	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_018411	AAAACT	2	12	226210	226221	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_018411	GAAAAA	3	18	253823	253840	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018411	ATTTAG	2	12	269210	269221	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018411	GTTAAA	2	12	276117	276128	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018411	TTTTAT	2	12	284091	284102	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018411	ATTTAA	2	12	311002	311013	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018411	AGGCGA	2	12	315170	315181	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_018411	AAGCGA	2	12	317277	317288	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_018411	ATATCG	2	12	319607	319618	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_018411	TTTATA	2	12	348168	348179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018411	GCTTAT	2	12	349673	349684	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_018411	TTATTT	2	12	358634	358645	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018411	GATCAT	2	12	376719	376730	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_018411	ATTTAT	2	12	383742	383753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018411	ATTAAA	2	12	394001	394012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018411	TTTATT	2	12	424292	424303	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018411	CAAAAA	2	12	424323	424334	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_018411	ATATTT	2	12	429151	429162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018411	TTTGCT	2	12	441931	441942	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_018411	ATCAGC	2	12	455258	455269	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_018411	TTATCA	2	12	455553	455564	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_018411	TTTTAT	2	12	461388	461399	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018411	ATTTTT	2	12	508334	508345	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018411	GTTTTG	2	12	527245	527256	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018411	GTTTTT	2	12	527504	527515	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018411	AAAGAT	2	12	541946	541957	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018411	AAAGAT	2	12	544391	544402	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018411	TTAAAT	2	12	581485	581496	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018411	TAGAAA	2	12	605848	605859	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018411	TTATAA	2	12	623559	623570	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018411	GTTTTT	2	12	637920	637931	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018411	TAAAAA	2	12	646764	646775	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018411	TGCAAA	2	12	650893	650904	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_018411	TATTTA	2	12	677421	677432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018411	TTTAAT	2	12	682363	682374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018411	AAAATA	2	12	693310	693321	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018411	AAAGAT	2	12	773018	773029	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018411	AAAGAT	2	12	775470	775481	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018411	GAAAAT	2	12	790021	790032	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018411	ATCTAG	2	12	791296	791307	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_018411	TGTTCT	2	12	792104	792115	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_018411	TCGCCT	2	12	825163	825174	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
55	NC_018411	ATATTT	2	12	834174	834185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018411	TGATAA	2	12	851953	851964	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018411	TATAAA	2	12	858767	858778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018411	AAGAAC	2	12	864137	864148	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_018411	CTAAAC	2	12	875384	875395	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_018411	TTAATC	2	12	884745	884756	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_018411	AACTAA	2	12	916187	916198	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.