MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycoplasma gallisepticum NC06_2006.080-5-2P chromosome

Total Repeats: 136

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018411	AAAAC	2	10	824	833	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_018411	ATCAT	2	10	1087	1096	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_018411	AAAGT	2	10	1575	1584	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018411	ATATT	2	10	1852	1861	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018411	AGTTA	2	10	30063	30072	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018411	ATTTT	2	10	36629	36638	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018411	TTAAT	2	10	49806	49815	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018411	TTAGC	2	10	63805	63814	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_018411	TTTAT	2	10	64357	64366	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018411	GCAAA	2	10	68428	68437	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_018411	CTAAA	2	10	78887	78896	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_018411	TTTAA	2	10	80103	80112	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018411	CAAAC	2	10	80204	80213	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
14	NC_018411	ATCAA	2	10	80418	80427	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_018411	ATATA	2	10	80433	80442	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018411	CTCAT	2	10	82994	83003	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
17	NC_018411	CTTCC	2	10	83268	83277	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
18	NC_018411	TAATA	2	10	87008	87017	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018411	TAAAA	2	10	94937	94946	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018411	ATATA	2	10	105261	105270	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018411	GAGAT	2	10	118486	118495	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018411	ATCTC	2	10	118512	118521	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
23	NC_018411	GTTTT	2	10	118677	118686	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018411	ACATA	2	10	122766	122775	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_018411	TTTGC	2	10	122893	122902	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_018411	ATTTT	2	10	132876	132885	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018411	TATTT	2	10	134374	134383	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018411	TTACT	2	10	134853	134862	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_018411	AATTA	2	10	135057	135066	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018411	TAAAT	2	10	141361	141370	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018411	GTTAG	2	10	149652	149661	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018411	TCTTA	2	10	169820	169829	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_018411	TTTTA	2	10	175137	175146	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018411	TAAAG	2	10	180438	180447	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018411	TTTTA	2	10	181953	181962	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018411	TGATC	2	10	183395	183404	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
37	NC_018411	TAAAA	2	10	202352	202361	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018411	TAGCT	2	10	203160	203169	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
39	NC_018411	TATAT	2	10	211171	211180	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018411	TCTTT	2	10	251359	251368	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_018411	TAGTT	2	10	273558	273567	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018411	TATTT	2	10	274560	274569	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018411	CTAAC	2	10	276131	276140	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
44	NC_018411	AGAGA	2	10	301216	301225	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018411	ATATT	2	10	306981	306990	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018411	AGTTA	2	10	307093	307102	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018411	TAATT	2	10	309267	309276	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018411	TCTAG	2	10	315092	315101	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
49	NC_018411	TCGTG	2	10	315511	315520	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
50	NC_018411	TAGGG	2	10	315892	315901	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018411	ATCAA	2	10	316568	316577	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_018411	ATATA	2	10	316583	316592	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018411	CTCAT	2	10	319144	319153	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
54	NC_018411	CTTCC	2	10	319418	319427	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
55	NC_018411	AATTA	2	10	344513	344522	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018411	ATTAT	2	10	344542	344551	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018411	AATAT	2	10	347526	347535	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018411	ATTAA	2	10	347582	347591	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018411	ATTTA	2	10	348228	348237	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018411	TAAAT	2	10	349315	349324	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018411	ATTAA	2	10	349326	349335	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018411	TATAT	2	10	352299	352308	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018411	AGTTA	2	10	357043	357052	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018411	ATTTT	2	10	359476	359485	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018411	ATTAA	2	10	367498	367507	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018411	AAATT	2	10	367612	367621	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018411	TAGTT	2	10	369887	369896	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018411	TAAAA	2	10	374421	374430	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018411	AAGTT	2	10	374707	374716	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018411	AAAAT	2	10	375530	375539	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018411	AAATT	2	10	385200	385209	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018411	TAAAG	2	10	394041	394050	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018411	AAGAA	2	10	403932	403941	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018411	ATATA	2	10	429132	429141	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018411	GTCAG	2	10	430924	430933	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
76	NC_018411	ATCTA	2	10	442104	442113	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_018411	TTAAC	2	10	443714	443723	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_018411	TAAAA	2	10	461355	461364	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018411	TAATT	2	10	470712	470721	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018411	TAAAA	2	10	511596	511605	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018411	ATCTT	2	10	512411	512420	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_018411	ATTTA	2	10	516912	516921	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018411	AAATT	2	10	527344	527353	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018411	TTAGT	2	10	527390	527399	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018411	ATTTT	2	10	530012	530021	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018411	CCAAA	2	10	539454	539463	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
87	NC_018411	TTAAA	2	10	565778	565787	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018411	ATCAA	2	10	567346	567355	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_018411	TTTAT	2	10	573916	573925	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018411	TAGTC	2	10	574469	574478	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
91	NC_018411	TAATT	2	10	575197	575206	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018411	TGAAA	2	10	579669	579678	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018411	AAATT	2	10	581384	581393	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018411	ATTTA	2	10	581408	581417	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018411	AAATC	2	10	582700	582709	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_018411	TAATT	2	10	586674	586683	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018411	CATTT	2	10	593863	593872	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_018411	AAATG	2	10	593879	593888	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018411	TATTT	2	10	606073	606082	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018411	TTAAT	2	10	617426	617435	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018411	AAATA	2	10	619024	619033	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018411	CTTAT	2	10	620298	620307	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_018411	ATTAT	2	10	623455	623464	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018411	TTAAC	2	10	637728	637737	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_018411	TAATA	2	10	650714	650723	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018411	TTTAA	2	10	651139	651148	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018411	AGATC	2	10	675258	675267	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
108	NC_018411	TTAAG	2	10	677193	677202	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018411	TTTTG	2	10	677234	677243	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018411	ATTTA	2	10	682887	682896	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018411	ATTTA	2	10	683100	683109	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018411	CAAAA	2	10	693232	693241	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_018411	TATAA	2	10	698135	698144	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018411	AAATT	2	10	701165	701174	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018411	TATTT	2	10	707573	707582	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018411	GATCT	2	10	733237	733246	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
117	NC_018411	CCAAA	2	10	770529	770538	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
118	NC_018411	AAAAG	2	10	791120	791129	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018411	TTTTC	2	10	791960	791969	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_018411	TTTTA	2	10	810588	810597	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018411	ATTAA	2	10	819966	819975	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018411	CCCTA	2	10	824443	824452	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
123	NC_018411	CACGA	2	10	824824	824833	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
124	NC_018411	CTAGA	2	10	825243	825252	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
125	NC_018411	TATCT	2	10	834845	834854	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_018411	ACTTC	2	10	843078	843087	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
127	NC_018411	AAAGC	2	10	850972	850981	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
128	NC_018411	AGAAA	2	10	851135	851144	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018411	AGATC	2	10	856220	856229	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
130	NC_018411	TTAAT	2	10	862204	862213	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018411	AATTA	2	10	865260	865269	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018411	ATAGC	2	10	896621	896630	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
133	NC_018411	TCCTT	2	10	896764	896773	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
134	NC_018411	AATTT	2	10	896972	896981	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018411	AATCA	2	10	910913	910922	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_018411	TAACC	2	10	926047	926056	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.