MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycoplasma gallisepticum NC95_13295-2-2P chromosome

Total Repeats: 62

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018407	ATATTT	2	12	82	93	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018407	TTTTTA	2	12	20635	20646	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018407	TTAAAA	2	12	50203	50214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018407	TTATAT	3	18	61386	61403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018407	AAGCGA	2	12	81135	81146	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_018407	ATATCG	2	12	83465	83476	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_018407	TTAGTT	2	12	132820	132831	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018407	ACAGAA	2	12	135487	135498	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_018407	TTTAAC	2	12	149593	149604	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_018407	ATTTTT	2	12	186668	186679	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018407	ACTTAA	2	12	198095	198106	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_018407	CAATAT	2	12	223499	223510	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_018407	TTAATC	2	12	226104	226115	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_018407	AAAACT	2	12	231164	231175	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_018407	GAAAAA	2	12	258780	258791	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018407	GTTAAA	2	12	281341	281352	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018407	TTTTAT	2	12	289315	289326	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018407	ATTTAA	2	12	316222	316233	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018407	AGGCGA	2	12	320390	320401	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_018407	AAGCGA	2	12	322497	322508	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_018407	ATATCG	2	12	324827	324838	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_018407	GCTTAT	2	12	354875	354886	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_018407	TTATTT	2	12	363836	363847	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018407	GATCAT	2	12	381919	381930	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_018407	ATTTAT	2	12	388942	388953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018407	ATTAAA	2	12	399201	399212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018407	TTTATT	2	12	429482	429493	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018407	CAAAAA	2	12	429513	429524	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_018407	ATATTT	2	12	434341	434352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018407	TTTGCT	2	12	447121	447132	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_018407	ATCAGC	2	12	460448	460459	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_018407	TTATCA	2	12	460743	460754	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_018407	TTTTAT	2	12	466578	466589	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018407	AGTTGA	2	12	477760	477771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018407	ATTTTT	2	12	513524	513535	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018407	GTTTTG	2	12	532436	532447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018407	GTTTTT	2	12	532695	532706	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018407	TTAAAT	2	12	581985	581996	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018407	TAGAAA	2	12	606347	606358	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018407	TTATAA	2	12	624058	624069	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018407	GTTTTT	2	12	638419	638430	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018407	TAAAAA	2	12	647263	647274	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018407	TGCAAA	2	12	651392	651403	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_018407	TATTTA	2	12	677921	677932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018407	TTTAAT	2	12	682863	682874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018407	AAAATA	2	12	693810	693821	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018407	AAAGAT	2	12	773659	773670	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018407	AAAGAT	2	12	776092	776103	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018407	GAAAAT	2	12	790955	790966	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018407	ATCTAG	2	12	792230	792241	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_018407	TGTTCT	2	12	793038	793049	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_018407	TCGCCT	2	12	826097	826108	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
53	NC_018407	ATATTT	2	12	835108	835119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018407	TGATAA	2	12	852888	852899	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018407	TATAAA	2	12	859702	859713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018407	CAATAA	2	12	877915	877926	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_018407	ATTAAA	2	12	878864	878875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018407	AAGAAC	2	12	879112	879123	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_018407	CTAAAC	2	12	890498	890509	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_018407	TTAATC	2	12	899859	899870	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_018407	TCAGAA	2	12	900300	900311	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_018407	AACTAA	2	12	931307	931318	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.