MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycoplasma gallisepticum VA94_7994-1-7P chromosome

Total Repeats: 136

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018406	AAAAC	2	10	824	833	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_018406	ATCAT	2	10	1087	1096	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_018406	AAAGT	2	10	1575	1584	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018406	ATATT	2	10	1852	1861	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018406	AGTTA	2	10	30063	30072	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018406	ATTTT	2	10	36629	36638	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018406	TTAAT	2	10	49815	49824	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018406	TTAGC	2	10	63813	63822	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_018406	TTTAT	2	10	64365	64374	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018406	GCAAA	2	10	68435	68444	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_018406	CTAAA	2	10	78894	78903	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_018406	TTTAA	2	10	80110	80119	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018406	CAAAC	2	10	80211	80220	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
14	NC_018406	ATCAA	2	10	80425	80434	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_018406	ATATA	2	10	80440	80449	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018406	CTCAT	2	10	83001	83010	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
17	NC_018406	CTTCC	2	10	83275	83284	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
18	NC_018406	TAATA	2	10	87015	87024	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018406	TAAAA	2	10	94945	94954	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018406	ATATA	2	10	105269	105278	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018406	GAGAT	2	10	118494	118503	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018406	ATCTC	2	10	118520	118529	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
23	NC_018406	GTTTT	2	10	118685	118694	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018406	ACATA	2	10	122774	122783	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_018406	TTTGC	2	10	122901	122910	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_018406	ATTTT	2	10	132806	132815	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018406	TATTT	2	10	134304	134313	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018406	TTACT	2	10	134783	134792	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_018406	AATTA	2	10	134987	134996	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018406	TAAAT	2	10	141291	141300	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018406	GTTAG	2	10	149580	149589	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018406	CATTT	2	10	150029	150038	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_018406	TCTTA	2	10	169399	169408	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_018406	TTTTA	2	10	174716	174725	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018406	TAAAG	2	10	180017	180026	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018406	TTTTA	2	10	181532	181541	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018406	TGATC	2	10	182974	182983	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
38	NC_018406	TAAAA	2	10	218023	218032	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018406	TAGCT	2	10	218831	218840	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_018406	TATAT	2	10	226842	226851	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018406	TCTTT	2	10	267033	267042	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_018406	TAGTT	2	10	289537	289546	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018406	TATTT	2	10	290539	290548	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018406	CTAAC	2	10	292110	292119	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
45	NC_018406	AGAGA	2	10	317191	317200	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018406	ATATT	2	10	322963	322972	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018406	AGTTA	2	10	323075	323084	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018406	TAATT	2	10	325248	325257	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018406	TCTAG	2	10	331073	331082	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
50	NC_018406	TCGTG	2	10	331492	331501	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
51	NC_018406	TAGGG	2	10	331873	331882	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018406	ATCAA	2	10	332549	332558	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_018406	ATATA	2	10	332564	332573	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018406	CTCAT	2	10	335125	335134	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
55	NC_018406	CTTCC	2	10	335399	335408	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
56	NC_018406	AATTA	2	10	360476	360485	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018406	ATTAT	2	10	360505	360514	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018406	TAAAT	2	10	365278	365287	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018406	ATTAA	2	10	365289	365298	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018406	TATAT	2	10	368262	368271	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018406	AGTTA	2	10	373006	373015	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018406	ATTTT	2	10	375439	375448	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018406	ATTAA	2	10	383461	383470	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018406	AAATT	2	10	383575	383584	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018406	TAGTT	2	10	385850	385859	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018406	TAAAA	2	10	390384	390393	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018406	AAGTT	2	10	390670	390679	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018406	AAATT	2	10	401162	401171	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018406	AAGAA	2	10	419893	419902	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018406	ATATA	2	10	445093	445102	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018406	GTCAG	2	10	446885	446894	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
72	NC_018406	ATCTA	2	10	458063	458072	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_018406	TTAAC	2	10	459673	459682	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_018406	TAAAA	2	10	477314	477323	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018406	TAATT	2	10	486671	486680	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018406	TAAAA	2	10	527556	527565	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018406	ATCTT	2	10	528372	528381	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_018406	ATTTA	2	10	532873	532882	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018406	AAATT	2	10	543305	543314	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018406	TTAGT	2	10	543351	543360	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018406	ATTTT	2	10	545973	545982	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018406	TTAAA	2	10	577084	577093	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018406	ATCAA	2	10	578652	578661	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_018406	TTTAT	2	10	585222	585231	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018406	TAGTC	2	10	585775	585784	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
86	NC_018406	TAATT	2	10	586503	586512	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018406	TGAAA	2	10	590975	590984	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018406	AAATT	2	10	592690	592699	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018406	ATTTA	2	10	592714	592723	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018406	AAATC	2	10	594006	594015	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_018406	TAATT	2	10	597980	597989	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018406	CATTT	2	10	605169	605178	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_018406	AAATG	2	10	605185	605194	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018406	TATTT	2	10	617378	617387	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018406	TTAAT	2	10	628731	628740	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018406	AAATA	2	10	630329	630338	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018406	CTTAT	2	10	631603	631612	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_018406	ATTAT	2	10	634760	634769	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018406	TTAAC	2	10	649033	649042	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_018406	TAATA	2	10	662019	662028	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018406	TTTAA	2	10	662444	662453	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018406	AGATC	2	10	686563	686572	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
103	NC_018406	TTAAG	2	10	688498	688507	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018406	TTTTG	2	10	688539	688548	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018406	AAATC	2	10	692305	692314	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_018406	ATTTA	2	10	694193	694202	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018406	ATTTA	2	10	694406	694415	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018406	CAAAA	2	10	704538	704547	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_018406	TATAA	2	10	709441	709450	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018406	AAATT	2	10	712471	712480	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018406	TATTT	2	10	718879	718888	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018406	CCAAA	2	10	781925	781934	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
113	NC_018406	AAAAG	2	10	802771	802780	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018406	TTTTC	2	10	803611	803620	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_018406	TTTTA	2	10	822239	822248	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018406	ATTAA	2	10	831617	831626	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018406	CCCTA	2	10	836094	836103	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
118	NC_018406	CACGA	2	10	836475	836484	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
119	NC_018406	CTAGA	2	10	836894	836903	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
120	NC_018406	TATCT	2	10	846496	846505	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_018406	ACTTC	2	10	854730	854739	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
122	NC_018406	AAAGC	2	10	862624	862633	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
123	NC_018406	AGAAA	2	10	862787	862796	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018406	AGATC	2	10	867872	867881	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
125	NC_018406	TTAAT	2	10	873856	873865	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018406	CAATT	2	10	882382	882391	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_018406	ATAAA	2	10	883725	883734	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018406	ATCAT	2	10	884505	884514	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_018406	AAATC	2	10	884585	884594	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_018406	AATTA	2	10	890356	890365	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018406	AATTA	2	10	890488	890497	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018406	ATAGC	2	10	921856	921865	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
133	NC_018406	TCCTT	2	10	921999	922008	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
134	NC_018406	AATTT	2	10	922207	922216	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018406	AATCA	2	10	936154	936163	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_018406	TAACC	2	10	951288	951297	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.