MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium smegmatis str. MC2 155 chromosome

Total Repeats: 128

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018289	TGGCAA	2	12	75954	75965	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_018289	TCGCGC	2	12	104559	104570	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
3	NC_018289	ATCACG	2	12	109081	109092	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_018289	CGATGG	2	12	232835	232846	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_018289	GGCTTC	2	12	233092	233103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_018289	GCACCG	2	12	233828	233839	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
7	NC_018289	TGAGCG	2	12	274620	274631	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_018289	GATTCG	2	12	279586	279597	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_018289	GGCCGC	2	12	332348	332359	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_018289	CGGCGA	2	12	382684	382695	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_018289	GCCAGT	2	12	426828	426839	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_018289	ACCGCC	2	12	518525	518536	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_018289	ACCTCA	2	12	649552	649563	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_018289	GCGAGT	2	12	773152	773163	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_018289	GAATGC	2	12	773166	773177	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_018289	TGCCGG	2	12	1040245	1040256	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_018289	GTGCGC	2	12	1113629	1113640	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_018289	CGACCG	2	12	1166279	1166290	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
19	NC_018289	GCGTCG	2	12	1181135	1181146	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_018289	CGACCA	2	12	1302955	1302966	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
21	NC_018289	CAGCAC	2	12	1303004	1303015	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
22	NC_018289	CCCAAT	2	12	1309494	1309505	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_018289	CCTGTT	2	12	1350129	1350140	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_018289	AGCTTC	2	12	1353684	1353695	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_018289	TCCACA	2	12	1396278	1396289	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_018289	AAGAGC	2	12	1460082	1460093	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_018289	CCGGCG	2	12	1483326	1483337	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_018289	CTCGTG	2	12	1656159	1656170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_018289	CATCGA	2	12	1680389	1680400	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_018289	CGCGAC	2	12	1836218	1836229	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
31	NC_018289	GGCCTG	2	12	1862950	1862961	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_018289	CACCGC	2	12	1913305	1913316	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_018289	GGCGGA	2	12	1930041	1930052	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_018289	ACCCGT	2	12	2012808	2012819	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
35	NC_018289	CGTGGC	2	12	2013071	2013082	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_018289	CGGGCA	2	12	2044165	2044176	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_018289	AACTGA	2	12	2154790	2154801	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_018289	CCCGCG	2	12	2184956	2184967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_018289	GCCACA	2	12	2185120	2185131	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
40	NC_018289	GCCCGC	3	18	2185186	2185203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_018289	GCTTCG	2	12	2215998	2216009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_018289	TTACGG	2	12	2216620	2216631	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_018289	GTGCGC	2	12	2406890	2406901	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_018289	GTGGGG	2	12	2431626	2431637	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018289	CAGGTG	2	12	2484492	2484503	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_018289	ACCTAT	2	12	2633821	2633832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_018289	ATCGCG	2	12	2657899	2657910	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_018289	TTCGAG	2	12	2773130	2773141	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_018289	TGGGCA	2	12	2829269	2829280	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_018289	TGTCGG	2	12	2872604	2872615	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_018289	ACCGGT	2	12	2905171	2905182	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_018289	GGCGAG	2	12	2960820	2960831	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_018289	GACAAG	2	12	2969295	2969306	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_018289	GGCCGG	2	12	3032563	3032574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_018289	TTCCGC	2	12	3050570	3050581	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
56	NC_018289	CGCGGT	2	12	3156995	3157006	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_018289	CGAGGC	2	12	3157562	3157573	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_018289	GGGAGG	2	12	3171502	3171513	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018289	ACTTGC	2	12	3181261	3181272	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_018289	GTGATT	2	12	3191012	3191023	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018289	CGAAAC	3	18	3211526	3211543	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_018289	ACGCGA	2	12	3254565	3254576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_018289	CGATCG	2	12	3326713	3326724	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_018289	GCCGCG	2	12	3326895	3326906	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_018289	CTGGTG	2	12	3327162	3327173	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_018289	CTGTTC	2	12	3327192	3327203	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_018289	CGGTCT	2	12	3371452	3371463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_018289	GGTGGG	2	12	3412614	3412625	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018289	TCGGGT	2	12	3417636	3417647	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_018289	ACGTTC	2	12	3497169	3497180	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_018289	TCAACG	2	12	3507397	3507408	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_018289	GCGACC	2	12	3555953	3555964	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
73	NC_018289	ATGTCG	2	12	3566870	3566881	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_018289	CGGGCG	2	12	3579765	3579776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_018289	CCTTGA	2	12	3692889	3692900	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_018289	TCCCTC	2	12	3712376	3712387	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_018289	GCCTCC	2	12	3747457	3747468	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_018289	CGCCGA	2	12	3829922	3829933	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
79	NC_018289	TGGCAA	2	12	3930801	3930812	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_018289	CCACGT	2	12	3943154	3943165	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
81	NC_018289	CCGGGC	2	12	4002911	4002922	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_018289	CGACGT	2	12	4044350	4044361	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_018289	TCAATA	2	12	4056467	4056478	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_018289	CCCAGA	2	12	4156274	4156285	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
85	NC_018289	TCCATA	2	12	4255616	4255627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_018289	CGCCCG	2	12	4266790	4266801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_018289	CCGGCC	2	12	4370581	4370592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_018289	GCTCCG	2	12	4452642	4452653	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
89	NC_018289	CCCCGG	2	12	4456304	4456315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_018289	TGGTCG	2	12	4500846	4500857	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_018289	GCTCCG	2	12	4659344	4659355	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
92	NC_018289	GTCCGA	2	12	4686915	4686926	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_018289	ACTGCT	2	12	4694264	4694275	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_018289	TGTCGG	2	12	4730957	4730968	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_018289	GTGCTG	2	12	4766088	4766099	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_018289	CAACCG	2	12	4827169	4827180	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
97	NC_018289	GACGTC	2	12	4850275	4850286	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_018289	AACAGC	2	12	5048237	5048248	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_018289	CGATCC	2	12	5060511	5060522	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
100	NC_018289	CCGCTG	2	12	5188867	5188878	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
101	NC_018289	CCGCGG	2	12	5189162	5189173	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_018289	CGAGGC	2	12	5189748	5189759	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_018289	GCCACC	2	12	5238740	5238751	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_018289	CGCTCG	2	12	5315086	5315097	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
105	NC_018289	CCTCCA	2	12	5325404	5325415	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_018289	CGGTGT	2	12	5386457	5386468	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_018289	AAATGT	2	12	5417521	5417532	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018289	CGTCAG	2	12	5495876	5495887	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_018289	GACGTC	2	12	5596635	5596646	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_018289	CCTTCC	2	12	5626899	5626910	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_018289	ATCCGG	2	12	5626927	5626938	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_018289	CCTCTC	2	12	5774916	5774927	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_018289	ACCCGA	2	12	5787137	5787148	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
114	NC_018289	CTCGGC	2	12	5796212	5796223	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
115	NC_018289	CAGCAC	2	12	5827677	5827688	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
116	NC_018289	AACAGC	2	12	5827855	5827866	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_018289	CCGTCG	2	12	5832879	5832890	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
118	NC_018289	CGTCAC	2	12	5874384	5874395	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
119	NC_018289	GTCGCT	2	12	5950525	5950536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_018289	CCGACA	2	12	6307586	6307597	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
121	NC_018289	GTCCGG	2	12	6326522	6326533	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_018289	TGGCGG	2	12	6395430	6395441	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_018289	GTTGCG	2	12	6478933	6478944	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_018289	CACGGC	2	12	6603636	6603647	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
125	NC_018289	ACCGAA	2	12	6841592	6841603	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_018289	ACCCGG	2	12	6882977	6882988	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
127	NC_018289	GCAACA	2	12	6939559	6939570	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_018289	CGGTCT	2	12	6986872	6986883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.