MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium smegmatis str. MC2 155 chromosome

Total Repeats: 459

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018289	GGTTA	2	10	12000	12009	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018289	GCCCC	2	10	46791	46800	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
3	NC_018289	TTGTG	2	10	93474	93483	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018289	TCGGC	2	10	97985	97994	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5	NC_018289	GCCGA	2	10	100755	100764	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
6	NC_018289	CGGCG	2	10	116024	116033	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
7	NC_018289	CCATT	2	10	121689	121698	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
8	NC_018289	GTCAG	2	10	127498	127507	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
9	NC_018289	TGTGT	2	10	226402	226411	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018289	CTGAC	2	10	229597	229606	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
11	NC_018289	CGCAG	2	10	255118	255127	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
12	NC_018289	CCGGC	2	10	262947	262956	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
13	NC_018289	CGTGG	2	10	271018	271027	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
14	NC_018289	GCAAG	2	10	275529	275538	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
15	NC_018289	CCGAT	2	10	279536	279545	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
16	NC_018289	CTGAA	2	10	289273	289282	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_018289	CCGGT	2	10	357515	357524	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
18	NC_018289	GATCG	2	10	378958	378967	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
19	NC_018289	TGGGC	2	10	383444	383453	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
20	NC_018289	CTGAC	2	10	386746	386755	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
21	NC_018289	CGATC	2	10	446352	446361	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
22	NC_018289	CGCAA	2	10	446553	446562	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
23	NC_018289	CTGAC	2	10	446952	446961	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
24	NC_018289	CCAAC	2	10	472018	472027	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
25	NC_018289	TGTCG	2	10	506601	506610	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
26	NC_018289	GTTCA	2	10	526623	526632	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
27	NC_018289	CCGGT	2	10	552794	552803	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
28	NC_018289	CGCTG	2	10	574527	574536	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
29	NC_018289	CCGGC	2	10	603570	603579	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
30	NC_018289	CGCGG	2	10	605524	605533	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
31	NC_018289	GTAAC	2	10	621286	621295	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
32	NC_018289	AACCG	2	10	625231	625240	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
33	NC_018289	CCTGG	2	10	656897	656906	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
34	NC_018289	TGCAC	2	10	659223	659232	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
35	NC_018289	CGGCG	2	10	680222	680231	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
36	NC_018289	CGTGA	2	10	683255	683264	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
37	NC_018289	CTGCG	2	10	729145	729154	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
38	NC_018289	TTGCG	2	10	737151	737160	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
39	NC_018289	ACGGC	2	10	749214	749223	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
40	NC_018289	CCGCA	2	10	758270	758279	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
41	NC_018289	GATGC	2	10	783600	783609	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
42	NC_018289	GGCAG	2	10	817233	817242	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
43	NC_018289	GCGTT	2	10	857157	857166	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
44	NC_018289	GACGG	2	10	935352	935361	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
45	NC_018289	GCGTC	2	10	977187	977196	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
46	NC_018289	CGCGG	2	10	981587	981596	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
47	NC_018289	ACGCG	2	10	1005491	1005500	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
48	NC_018289	GGTGA	2	10	1005552	1005561	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018289	CGGCC	2	10	1006948	1006957	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
50	NC_018289	CGGCC	2	10	1020924	1020933	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
51	NC_018289	GGTAA	2	10	1026152	1026161	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018289	GCCAC	2	10	1039065	1039074	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
53	NC_018289	TCCGA	2	10	1041694	1041703	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
54	NC_018289	GCGCG	2	10	1042139	1042148	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
55	NC_018289	CGCTA	2	10	1061519	1061528	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
56	NC_018289	CGGCG	2	10	1076384	1076393	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
57	NC_018289	GACAC	2	10	1088406	1088415	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
58	NC_018289	CTCGT	2	10	1098842	1098851	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
59	NC_018289	CTTTT	2	10	1113612	1113621	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_018289	TCCCG	2	10	1215576	1215585	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
61	NC_018289	GGCGT	2	10	1229157	1229166	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
62	NC_018289	CCTCT	2	10	1229904	1229913	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
63	NC_018289	GCTGC	2	10	1240150	1240159	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
64	NC_018289	CCGCA	2	10	1251152	1251161	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
65	NC_018289	GCGCT	2	10	1261106	1261115	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
66	NC_018289	TCGGG	2	10	1267082	1267091	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
67	NC_018289	CCGAG	2	10	1277532	1277541	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
68	NC_018289	GCCAC	2	10	1283567	1283576	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
69	NC_018289	GAACG	2	10	1292008	1292017	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
70	NC_018289	GAGCC	2	10	1300858	1300867	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
71	NC_018289	GGTCG	2	10	1309050	1309059	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
72	NC_018289	CCGCG	2	10	1309459	1309468	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
73	NC_018289	CGACA	2	10	1313232	1313241	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
74	NC_018289	AGGAG	2	10	1351745	1351754	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018289	GAATC	2	10	1353374	1353383	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
76	NC_018289	CCACG	2	10	1353603	1353612	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
77	NC_018289	CGGCA	2	10	1421575	1421584	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
78	NC_018289	TTCCG	2	10	1439487	1439496	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
79	NC_018289	GACTC	2	10	1445370	1445379	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
80	NC_018289	GCCCG	2	10	1449821	1449830	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
81	NC_018289	GGCCG	2	10	1462558	1462567	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
82	NC_018289	CGGCC	2	10	1462571	1462580	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
83	NC_018289	CACCT	2	10	1463081	1463090	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
84	NC_018289	CACCT	2	10	1482101	1482110	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
85	NC_018289	CACCT	2	10	1482133	1482142	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
86	NC_018289	CCCGA	2	10	1495604	1495613	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
87	NC_018289	CCAGA	2	10	1497624	1497633	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
88	NC_018289	CCGGG	2	10	1497714	1497723	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
89	NC_018289	ACGCG	2	10	1504319	1504328	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
90	NC_018289	CGCGG	2	10	1563313	1563322	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
91	NC_018289	CCGGT	2	10	1563350	1563359	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
92	NC_018289	GCGCG	2	10	1564995	1565004	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
93	NC_018289	AGCGG	2	10	1578927	1578936	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
94	NC_018289	TCCTG	2	10	1590140	1590149	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
95	NC_018289	ACGAA	2	10	1613179	1613188	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
96	NC_018289	GGGCG	2	10	1649190	1649199	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
97	NC_018289	ACCGG	2	10	1651153	1651162	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
98	NC_018289	TCGTG	2	10	1680019	1680028	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
99	NC_018289	CCCAG	2	10	1722066	1722075	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
100	NC_018289	GTCCG	2	10	1727246	1727255	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
101	NC_018289	CTTGC	2	10	1749885	1749894	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
102	NC_018289	TGTGG	2	10	1762545	1762554	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018289	TGCCG	2	10	1770315	1770324	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
104	NC_018289	GCGCA	2	10	1814628	1814637	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
105	NC_018289	ACGCC	2	10	1816496	1816505	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
106	NC_018289	AACCG	2	10	1816545	1816554	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
107	NC_018289	GCCGT	2	10	1817012	1817021	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
108	NC_018289	TGAGT	2	10	1820786	1820795	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018289	CCGGC	2	10	1830624	1830633	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
110	NC_018289	GGTGC	2	10	1858695	1858704	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
111	NC_018289	GAAAG	2	10	1860092	1860101	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018289	CGCAG	2	10	1861591	1861600	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
113	NC_018289	CCCTT	2	10	1863661	1863670	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
114	NC_018289	CGATG	2	10	1863681	1863690	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
115	NC_018289	GCGGA	2	10	1870133	1870142	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
116	NC_018289	CTCGC	2	10	1870242	1870251	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
117	NC_018289	GTCAC	2	10	1872421	1872430	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
118	NC_018289	CAGCC	2	10	1876112	1876121	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
119	NC_018289	GGCTT	2	10	1897466	1897475	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
120	NC_018289	AGTCA	2	10	1916374	1916383	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
121	NC_018289	CGGTT	2	10	1920933	1920942	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
122	NC_018289	AACAC	2	10	1939490	1939499	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
123	NC_018289	ACTCA	2	10	1941675	1941684	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
124	NC_018289	TCGGC	2	10	1942016	1942025	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
125	NC_018289	ACTCA	2	10	1943720	1943729	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
126	NC_018289	CGGCG	2	10	1944642	1944651	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
127	NC_018289	GAAGG	2	10	1998618	1998627	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018289	GAGTG	2	10	1999781	1999790	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018289	TGCAG	2	10	2003720	2003729	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
130	NC_018289	TTCGG	2	10	2013014	2013023	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
131	NC_018289	ACGAC	2	10	2072815	2072824	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
132	NC_018289	CAAGC	2	10	2080092	2080101	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
133	NC_018289	TTTCG	2	10	2090481	2090490	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
134	NC_018289	TCACT	2	10	2102530	2102539	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
135	NC_018289	TTGCT	2	10	2128659	2128668	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
136	NC_018289	TCCGA	2	10	2145966	2145975	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
137	NC_018289	ACGGA	2	10	2173806	2173815	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
138	NC_018289	TGGAA	2	10	2181785	2181794	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018289	CCCGC	2	10	2185211	2185220	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
140	NC_018289	TAGGC	2	10	2209871	2209880	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
141	NC_018289	CCGAA	2	10	2216557	2216566	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
142	NC_018289	GTCGA	2	10	2218740	2218749	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
143	NC_018289	CGTCG	2	10	2223964	2223973	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
144	NC_018289	GCGTG	2	10	2261381	2261390	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
145	NC_018289	CCGCA	2	10	2345919	2345928	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
146	NC_018289	CGGCG	2	10	2369644	2369653	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
147	NC_018289	GACAC	2	10	2381666	2381675	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
148	NC_018289	CTCGT	2	10	2392102	2392111	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
149	NC_018289	CTTTT	2	10	2406873	2406882	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
150	NC_018289	CGGGT	2	10	2469677	2469686	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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152	NC_018289	GCGCC	2	10	2479841	2479850	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
153	NC_018289	GGCGG	2	10	2479958	2479967	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
154	NC_018289	GCTAG	2	10	2489786	2489795	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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158	NC_018289	CGGCA	2	10	2524334	2524343	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
159	NC_018289	TCTCT	2	10	2537721	2537730	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
160	NC_018289	GCGCA	2	10	2594781	2594790	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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162	NC_018289	GGTTT	2	10	2689107	2689116	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
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171	NC_018289	CGTCT	2	10	2819247	2819256	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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179	NC_018289	GCCGA	2	10	2890158	2890167	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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184	NC_018289	CGTGT	2	10	2969173	2969182	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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186	NC_018289	ATGAC	2	10	2985209	2985218	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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189	NC_018289	CGCTG	2	10	2993356	2993365	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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192	NC_018289	TGCGA	2	10	3042471	3042480	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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197	NC_018289	GGGGT	2	10	3126466	3126475	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
198	NC_018289	CGTGG	2	10	3137121	3137130	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
199	NC_018289	GACGG	2	10	3157587	3157596	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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207	NC_018289	TCGGA	2	10	3267554	3267563	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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247	NC_018289	CACGA	2	10	3825697	3825706	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
248	NC_018289	GATCG	2	10	3836302	3836311	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
249	NC_018289	GCGCG	2	10	3846784	3846793	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
250	NC_018289	GTCTT	2	10	3891358	3891367	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
251	NC_018289	CATTG	2	10	3900485	3900494	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
252	NC_018289	GAAAT	2	10	3928135	3928144	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
253	NC_018289	CCGGG	2	10	3936535	3936544	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
254	NC_018289	GAAGT	2	10	3940409	3940418	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
255	NC_018289	CGGGC	2	10	3942870	3942879	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
256	NC_018289	CGAGC	2	10	3942918	3942927	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
257	NC_018289	CTGCC	2	10	3970050	3970059	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
258	NC_018289	CGCTT	2	10	3987406	3987415	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
259	NC_018289	GGCTG	2	10	3989303	3989312	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
260	NC_018289	CCCGT	2	10	4031073	4031082	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
261	NC_018289	CGTGC	2	10	4044483	4044492	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
262	NC_018289	TCCCC	2	10	4048488	4048497	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
263	NC_018289	CCTTG	2	10	4050561	4050570	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
264	NC_018289	CGCTG	2	10	4072986	4072995	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
265	NC_018289	ACCGC	2	10	4085251	4085260	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
266	NC_018289	GCGTT	2	10	4100574	4100583	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
267	NC_018289	GACAA	2	10	4104560	4104569	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
268	NC_018289	ACAGC	2	10	4117492	4117501	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
269	NC_018289	CAATC	2	10	4124651	4124660	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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271	NC_018289	GCTGC	2	10	4147943	4147952	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
272	NC_018289	CGCCC	2	10	4155450	4155459	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
273	NC_018289	TGGCC	2	10	4168774	4168783	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
274	NC_018289	CATCC	2	10	4205550	4205559	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
275	NC_018289	CAGCG	2	10	4213737	4213746	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
276	NC_018289	TGAGT	2	10	4213900	4213909	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
277	NC_018289	TCGCC	2	10	4223908	4223917	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
278	NC_018289	CGGGC	2	10	4226075	4226084	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
279	NC_018289	CGGCT	2	10	4237620	4237629	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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281	NC_018289	TCGTC	2	10	4266883	4266892	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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355	NC_018289	TGCCG	2	10	5356626	5356635	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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400	NC_018289	CTCGT	2	10	5872414	5872423	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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459	NC_018289	TGTCG	2	10	6987741	6987750	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.