MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium smegmatis str. MC2 155 chromosome

Total Repeats: 1456

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018289	GATT	2	8	8249	8256	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018289	GGAA	2	8	16884	16891	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018289	CGCC	2	8	47395	47402	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4	NC_018289	TCGC	2	8	52973	52980	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_018289	CGCC	2	8	59490	59497	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6	NC_018289	TTCG	2	8	59512	59519	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_018289	GGCC	2	8	60036	60043	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_018289	CGGT	2	8	62987	62994	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_018289	TCGC	2	8	71697	71704	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_018289	CGAA	2	8	71907	71914	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_018289	CGTA	2	8	76047	76054	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_018289	GTGC	2	8	89294	89301	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_018289	TGGC	2	8	92399	92406	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_018289	TGGC	2	8	92524	92531	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_018289	GCTG	2	8	92860	92867	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_018289	CCGG	2	8	93633	93640	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_018289	TTAA	2	8	94062	94069	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018289	GCGA	2	8	94314	94321	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_018289	GATG	2	8	94460	94467	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018289	AGGG	2	8	101391	101398	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018289	CGTA	2	8	103047	103054	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_018289	CAAT	2	8	103318	103325	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_018289	TCTT	2	8	103342	103349	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_018289	TCCC	2	8	104481	104488	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
25	NC_018289	TCGA	2	8	104706	104713	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_018289	GGTC	2	8	104763	104770	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_018289	ATCG	2	8	116034	116041	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_018289	GTTC	2	8	118808	118815	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_018289	GTGG	2	8	124579	124586	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018289	CCGC	2	8	129647	129654	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
31	NC_018289	GTCT	2	8	138562	138569	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_018289	TGAT	2	8	142776	142783	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018289	TTGA	2	8	143527	143534	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018289	AGTG	2	8	143567	143574	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018289	GCCT	2	8	151097	151104	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
36	NC_018289	CTTT	2	8	171952	171959	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_018289	GACT	2	8	181173	181180	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_018289	AGTC	2	8	181279	181286	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_018289	CGGC	2	8	194786	194793	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_018289	TGAA	2	8	195019	195026	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018289	TGGA	2	8	195061	195068	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018289	GCCG	2	8	196760	196767	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_018289	AAGA	2	8	196778	196785	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018289	ATTG	2	8	200738	200745	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018289	ACAA	2	8	205214	205221	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_018289	AGGT	2	8	205252	205259	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018289	GACC	2	8	206790	206797	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_018289	GGCG	2	8	209987	209994	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
49	NC_018289	CTTG	2	8	213563	213570	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_018289	AATG	2	8	213657	213664	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018289	AATA	2	8	218424	218431	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018289	TGCG	2	8	225715	225722	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_018289	CCAT	2	8	229537	229544	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_018289	CGGG	2	8	229578	229585	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
55	NC_018289	GGCC	2	8	231969	231976	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_018289	TCGA	2	8	232387	232394	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_018289	TTGT	2	8	232582	232589	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018289	GGCC	2	8	233361	233368	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_018289	GCGT	2	8	244117	244124	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
60	NC_018289	GCAC	2	8	244157	244164	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
61	NC_018289	ACCG	2	8	244192	244199	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
62	NC_018289	TGGC	2	8	255059	255066	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
63	NC_018289	GCGT	2	8	259109	259116	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
64	NC_018289	GCAC	2	8	259152	259159	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
65	NC_018289	GCTC	2	8	260911	260918	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
66	NC_018289	CGAT	2	8	269080	269087	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_018289	GCCC	2	8	269115	269122	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
68	NC_018289	ACCA	2	8	269177	269184	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_018289	GTTC	2	8	274818	274825	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_018289	CGAA	2	8	274853	274860	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_018289	TGCG	2	8	279490	279497	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_018289	GACA	2	8	289302	289309	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_018289	GCCG	2	8	293974	293981	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_018289	TGCC	2	8	297608	297615	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
75	NC_018289	GGGT	2	8	300905	300912	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018289	GTCG	2	8	303129	303136	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
77	NC_018289	TACG	2	8	312104	312111	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_018289	GACG	2	8	313718	313725	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
79	NC_018289	GCTA	2	8	319108	319115	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_018289	ACGC	2	8	319220	319227	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
81	NC_018289	GTGG	2	8	326904	326911	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018289	TTTG	2	8	349639	349646	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018289	CGTC	2	8	360322	360329	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
84	NC_018289	GGTC	2	8	360419	360426	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NC_018289	TCAG	2	8	369709	369716	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_018289	ACCG	2	8	377805	377812	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
87	NC_018289	TCGC	2	8	382714	382721	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
88	NC_018289	GGGA	2	8	382724	382731	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018289	TATT	2	8	383424	383431	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018289	CCCG	2	8	395096	395103	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
91	NC_018289	GTCG	2	8	395191	395198	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
92	NC_018289	CAGC	2	8	402750	402757	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
93	NC_018289	TCGC	2	8	417898	417905	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
94	NC_018289	GTTT	2	8	419302	419309	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018289	TCGA	2	8	419437	419444	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_018289	TCGT	2	8	419482	419489	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_018289	GACG	2	8	424576	424583	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
98	NC_018289	CGAT	2	8	426651	426658	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_018289	TTGC	2	8	426764	426771	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_018289	TCGA	2	8	445976	445983	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_018289	TCCT	2	8	445993	446000	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_018289	CCAT	2	8	446892	446899	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_018289	CGGG	2	8	446933	446940	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
104	NC_018289	TTCG	2	8	472077	472084	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_018289	GTGG	2	8	490752	490759	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018289	TGAT	2	8	506612	506619	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018289	CGTT	2	8	508074	508081	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_018289	GAAG	2	8	508220	508227	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018289	GGCG	2	8	508340	508347	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
110	NC_018289	AGGC	2	8	510280	510287	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
111	NC_018289	GGAC	2	8	526777	526784	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
112	NC_018289	TCGG	2	8	531590	531597	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
113	NC_018289	TACG	2	8	535899	535906	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_018289	TCGG	2	8	544542	544549	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
115	NC_018289	CGAC	2	8	544615	544622	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
116	NC_018289	TTGC	2	8	551487	551494	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_018289	CGTG	2	8	551579	551586	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
118	NC_018289	TGTC	2	8	574453	574460	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_018289	GGCG	2	8	579147	579154	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
120	NC_018289	CGGG	2	8	579187	579194	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
121	NC_018289	ACGC	2	8	580861	580868	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
122	NC_018289	GAGC	2	8	591225	591232	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
123	NC_018289	CGAA	2	8	600201	600208	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_018289	CGGC	2	8	603462	603469	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125	NC_018289	TGAG	2	8	603715	603722	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018289	TTCC	2	8	613376	613383	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_018289	AAGG	2	8	613481	613488	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018289	CCGG	2	8	613492	613499	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_018289	TCCC	2	8	622380	622387	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
130	NC_018289	CGGC	2	8	624470	624477	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_018289	CCGG	2	8	624547	624554	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_018289	CAGT	2	8	625136	625143	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_018289	ACGC	2	8	625167	625174	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
134	NC_018289	TAAT	2	8	628296	628303	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018289	CGGC	2	8	635702	635709	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
136	NC_018289	GCGG	2	8	649405	649412	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
137	NC_018289	GGCT	2	8	649576	649583	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
138	NC_018289	AGAC	2	8	650929	650936	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
139	NC_018289	CACC	2	8	664834	664841	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
140	NC_018289	TTCC	2	8	680952	680959	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_018289	CGGT	2	8	683233	683240	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
142	NC_018289	AACC	2	8	686068	686075	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_018289	CATA	2	8	693508	693515	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_018289	CGCA	2	8	693545	693552	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
145	NC_018289	GACG	2	8	736197	736204	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
146	NC_018289	GGCC	2	8	745528	745535	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
147	NC_018289	CTCC	2	8	747419	747426	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
148	NC_018289	CAGT	2	8	747479	747486	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
149	NC_018289	CAAA	2	8	758163	758170	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_018289	CCGT	2	8	765794	765801	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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491	NC_018289	CGCC	2	8	2235693	2235700	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
492	NC_018289	CGAC	2	8	2235719	2235726	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
493	NC_018289	CCGG	2	8	2235884	2235891	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
494	NC_018289	CGGC	2	8	2242569	2242576	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
495	NC_018289	CGAT	2	8	2248429	2248436	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
496	NC_018289	CGCA	2	8	2248456	2248463	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
497	NC_018289	GCGT	2	8	2248535	2248542	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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500	NC_018289	ACGC	2	8	2257670	2257677	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding

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