MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Melissococcus plutonius DAT561 plasmid 1

Total Repeats: 90

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018265	TAAAA	2	10	408	417	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018265	TTTAA	2	10	2018	2027	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018265	TTAAA	2	10	2043	2052	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018265	ATTTT	2	10	2515	2524	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018265	TATAA	2	10	3008	3017	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018265	CTATA	2	10	9419	9428	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_018265	CTTAA	2	10	9538	9547	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_018265	ATAAA	2	10	13385	13394	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018265	AAAAG	2	10	13550	13559	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018265	TTTAT	2	10	13641	13650	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018265	TATAA	2	10	14816	14825	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018265	TATAG	2	10	17670	17679	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018265	TGAAT	2	10	18151	18160	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018265	ACTTC	2	10	19362	19371	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
15	NC_018265	TTGGT	2	10	19459	19468	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018265	TAATT	2	10	19865	19874	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018265	TTACT	2	10	20276	20285	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_018265	AAAAC	2	10	21967	21976	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_018265	CAAGC	2	10	22016	22025	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
20	NC_018265	GTATA	2	10	23501	23510	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018265	AAATG	2	10	23766	23775	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018265	TACTA	2	10	23922	23931	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_018265	ACTTA	2	10	23945	23954	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_018265	TGTTT	2	10	23977	23986	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018265	TTTTA	2	10	23987	23996	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018265	AAGTT	2	10	24005	24014	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018265	AAATT	2	10	26477	26486	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018265	TAGCA	2	10	29166	29175	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
29	NC_018265	ATTTT	2	10	29880	29889	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018265	TATAT	2	10	31319	31328	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018265	TTATT	2	10	34900	34909	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018265	ATTCA	2	10	37879	37888	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_018265	TATTT	2	10	39259	39268	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018265	ATTTA	2	10	43532	43541	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018265	AAATA	2	10	43987	43996	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018265	TATAA	2	10	44274	44283	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018265	TATCT	2	10	45223	45232	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_018265	AAATT	2	10	45870	45879	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018265	TTATT	2	10	45921	45930	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018265	TTGAA	2	10	46001	46010	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018265	TATCT	2	10	49343	49352	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_018265	AATAA	2	10	54323	54332	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018265	TTATT	2	10	54434	54443	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018265	ATTTA	2	10	57529	57538	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018265	ATAAA	2	10	60772	60781	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018265	ATATT	2	10	69082	69091	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018265	ATAAA	2	10	72302	72311	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018265	ATAAA	2	10	75515	75524	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018265	TAAGC	2	10	79592	79601	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
50	NC_018265	ATTTT	2	10	81449	81458	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018265	TTTAA	2	10	81484	81493	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018265	TTAAT	2	10	81633	81642	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018265	GTAAA	2	10	82133	82142	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018265	AAGGA	2	10	82215	82224	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018265	AAATT	2	10	82378	82387	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018265	TTATT	2	10	86679	86688	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018265	AGGAA	2	10	88175	88184	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018265	TTCAA	2	10	89671	89680	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_018265	TTCTT	2	10	96042	96051	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_018265	TTAAA	2	10	97603	97612	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018265	TTTAT	2	10	101065	101074	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018265	TTAAA	2	10	101261	101270	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018265	AAGAA	2	10	115212	115221	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018265	CTTAT	2	10	117619	117628	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_018265	AATAA	2	10	117818	117827	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018265	ATTTC	2	10	118813	118822	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_018265	TAATA	2	10	119044	119053	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018265	TAAAA	2	10	119221	119230	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018265	ATTAA	2	10	119764	119773	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018265	AGTTA	2	10	123763	123772	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018265	AATAA	2	10	129615	129624	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018265	TCATT	2	10	130963	130972	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_018265	TAAAT	2	10	135847	135856	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018265	ATTTA	2	10	136291	136300	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018265	ATTTT	2	10	138178	138187	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018265	AAATG	2	10	141174	141183	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018265	AGATA	2	10	148357	148366	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018265	TAACT	2	10	148375	148384	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_018265	ATTAT	2	10	156995	157004	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018265	TTTTA	2	10	159565	159574	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018265	CAATA	2	10	162880	162889	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_018265	TTTTA	2	10	171116	171125	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018265	TTAAA	2	10	182047	182056	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018265	AAATA	2	10	182392	182401	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018265	TTAAT	2	10	183347	183356	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018265	TAAAT	2	10	184136	184145	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018265	TAATT	2	10	187088	187097	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018265	TTTAT	2	10	190877	190886	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018265	TAATT	2	10	196932	196941	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018265	TGAAA	2	10	197324	197333	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.