MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Melissococcus plutonius DAT561 plasmid 1

Total Repeats: 314

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018265	TAGA	2	8	7	14	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018265	TTTA	2	8	303	310	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018265	AGAA	2	8	364	371	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018265	AATA	2	8	527	534	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018265	AATA	2	8	1909	1916	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018265	TAGA	2	8	1963	1970	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018265	AATT	2	8	2212	2219	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018265	AATT	2	8	2320	2327	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018265	TAAT	2	8	2462	2469	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018265	ATTG	2	8	2754	2761	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018265	GACT	2	8	2826	2833	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_018265	TAGT	2	8	2959	2966	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018265	TTTG	2	8	3140	3147	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018265	ATAA	2	8	5309	5316	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018265	GTTT	2	8	5383	5390	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018265	ATTT	2	8	5391	5398	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018265	ATGG	2	8	7897	7904	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018265	ATTA	2	8	7984	7991	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018265	ACTT	2	8	9525	9532	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_018265	TGTA	2	8	12718	12725	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018265	TCTA	2	8	13223	13230	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_018265	ATCA	2	8	13338	13345	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_018265	ACTA	2	8	13568	13575	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_018265	TCTA	2	8	14472	14479	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_018265	TTCT	2	8	17041	17048	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_018265	AAAC	2	8	17120	17127	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_018265	TTTA	2	8	17177	17184	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018265	AGAT	2	8	17594	17601	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018265	ATAA	2	8	17689	17696	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018265	TTAT	2	8	18196	18203	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018265	TTTG	2	8	18312	18319	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018265	ATAG	2	8	18510	18517	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018265	TGAT	2	8	18691	18698	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018265	TTTC	2	8	18885	18892	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_018265	GTTT	2	8	18956	18963	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018265	AAAG	2	8	19380	19387	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018265	TTAT	2	8	19738	19745	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018265	ATTT	3	12	20176	20187	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018265	AGGG	2	8	20238	20245	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018265	ATAA	2	8	20249	20256	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018265	TTAA	2	8	20327	20334	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018265	TAAT	2	8	20438	20445	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018265	AATT	2	8	20486	20493	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018265	TTTA	2	8	20505	20512	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018265	AAAT	2	8	20523	20530	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018265	TTAA	2	8	21551	21558	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018265	ATTT	2	8	21774	21781	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018265	ATAA	2	8	21959	21966	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018265	GTAT	2	8	22051	22058	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018265	TTAC	2	8	22160	22167	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_018265	AATA	2	8	22331	22338	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018265	TAAT	2	8	23395	23402	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018265	TGCT	2	8	23475	23482	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_018265	TAAT	2	8	23679	23686	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018265	AATT	2	8	23692	23699	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018265	AATT	3	12	23787	23798	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018265	AATA	2	8	23849	23856	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018265	AATT	2	8	23857	23864	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018265	ATCT	2	8	23958	23965	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_018265	TAGA	2	8	25775	25782	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018265	AGAT	2	8	26696	26703	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018265	AAAT	2	8	26930	26937	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018265	ATTA	2	8	27097	27104	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018265	TTTA	2	8	29344	29351	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018265	GAAA	2	8	29376	29383	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018265	TATT	2	8	30370	30377	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018265	ATTG	2	8	31974	31981	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018265	TAAC	2	8	32868	32875	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_018265	TAAG	2	8	33127	33134	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018265	GTAA	2	8	33844	33851	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018265	CATA	2	8	34394	34401	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_018265	TAAA	2	8	34463	34470	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018265	AATT	2	8	34661	34668	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018265	TGCA	2	8	34843	34850	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_018265	AAGA	2	8	35070	35077	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018265	TCCT	2	8	35416	35423	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_018265	TCTT	2	8	35796	35803	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_018265	AATA	2	8	36268	36275	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018265	TAAA	2	8	36511	36518	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018265	GAAA	2	8	36871	36878	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018265	AATT	2	8	37188	37195	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018265	ATGA	2	8	38918	38925	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018265	ATCT	2	8	39359	39366	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_018265	TCAT	2	8	40780	40787	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_018265	TTCA	2	8	40830	40837	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_018265	ACTA	2	8	40922	40929	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_018265	GTAA	2	8	41731	41738	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018265	AGGG	2	8	41747	41754	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018265	ATTA	2	8	43792	43799	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018265	TATT	2	8	44009	44016	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018265	AATT	2	8	44238	44245	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018265	GATA	2	8	45009	45016	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018265	TAAA	2	8	45335	45342	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018265	CTTT	2	8	45387	45394	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_018265	TTTG	2	8	45676	45683	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018265	TTAT	3	12	45711	45722	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018265	TTCT	2	8	45734	45741	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_018265	AGTT	2	8	45933	45940	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018265	ATAA	2	8	46084	46091	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018265	ATAA	2	8	48988	48995	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018265	AGAA	2	8	49176	49183	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018265	TAAT	2	8	49358	49365	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018265	GGGA	2	8	49376	49383	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018265	TAGT	2	8	51885	51892	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018265	AAAT	2	8	51934	51941	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018265	TTTA	2	8	51961	51968	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018265	TGTA	2	8	54412	54419	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018265	TATT	2	8	54447	54454	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018265	ATTT	2	8	54477	54484	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018265	ATAA	2	8	54490	54497	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018265	TAAT	2	8	54572	54579	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018265	ATCA	2	8	58575	58582	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_018265	TTAT	2	8	58805	58812	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018265	TCTA	2	8	58955	58962	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_018265	AAGA	2	8	59016	59023	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018265	ATTT	2	8	59045	59052	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018265	TTCC	2	8	60629	60636	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_018265	TTAA	2	8	60688	60695	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018265	TTTA	2	8	60806	60813	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018265	ATAG	2	8	67317	67324	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018265	AAGC	2	8	67367	67374	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
122	NC_018265	TTTA	2	8	67382	67389	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018265	TGCT	2	8	67397	67404	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_018265	ATAG	2	8	67488	67495	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018265	TTTA	2	8	67587	67594	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018265	ATTT	2	8	67606	67613	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018265	TTAA	2	8	67625	67632	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018265	AAAT	2	8	67637	67644	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018265	TAAT	2	8	67650	67657	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018265	ATTT	2	8	67764	67771	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018265	ATGA	2	8	68891	68898	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018265	TATT	2	8	68917	68924	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018265	TGAG	2	8	69037	69044	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018265	TACA	2	8	69074	69081	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_018265	TGTA	2	8	69103	69110	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018265	AATT	2	8	69111	69118	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018265	AATG	2	8	69157	69164	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018265	TGAA	2	8	72289	72296	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018265	ATTA	2	8	75038	75045	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018265	TAAC	2	8	75059	75066	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_018265	AAAT	2	8	75079	75086	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018265	ATAA	2	8	75251	75258	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018265	ATAA	2	8	75391	75398	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018265	AAAT	2	8	75639	75646	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018265	TAAA	2	8	78259	78266	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018265	TGTT	2	8	81397	81404	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018265	AATT	2	8	81425	81432	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_018265	ATTT	3	12	81522	81533	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_018265	TTTA	2	8	81753	81760	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_018265	ATTT	2	8	81825	81832	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_018265	AGAT	2	8	81856	81863	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
152	NC_018265	AACT	2	8	82052	82059	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
153	NC_018265	CAAA	2	8	86369	86376	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
154	NC_018265	AATT	2	8	86820	86827	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_018265	TTAA	2	8	86855	86862	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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157	NC_018265	TTAT	2	8	91723	91730	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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307	NC_018265	ATTA	2	8	196961	196968	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
308	NC_018265	AGGA	2	8	196990	196997	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
309	NC_018265	AATT	2	8	197001	197008	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
310	NC_018265	TTAT	2	8	197050	197057	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
311	NC_018265	TAAA	2	8	197194	197201	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
312	NC_018265	TCTT	2	8	197299	197306	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
313	NC_018265	TAAA	3	12	197390	197401	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
314	NC_018265	ATAA	2	8	197417	197424	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.