MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Methanoculleus bourgensis MS2

Total Repeats: 10020

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018227	TTCC	2	8	48	55	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_018227	TCT	2	6	70	75	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_018227	CTT	2	6	97	102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_018227	AT	3	6	122	127	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018227	TAT	2	6	161	166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018227	TGCA	2	8	176	183	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_018227	ATC	3	9	198	206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_018227	CCA	2	6	265	270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_018227	TCA	3	9	273	281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_018227	TCT	2	6	300	305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_018227	TCCTG	2	10	397	406	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
12	NC_018227	T	6	6	3416	3421	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018227	CT	3	6	3429	3434	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_018227	CGG	2	6	3532	3537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_018227	GCC	2	6	3542	3547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_018227	GGA	2	6	3747	3752	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018227	TCT	2	6	3753	3758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_018227	TTGC	2	8	3790	3797	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_018227	CGG	2	6	3823	3828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_018227	CGGT	2	8	3839	3846	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_018227	TCG	2	6	3920	3925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_018227	GTG	2	6	3966	3971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018227	GGC	2	6	3974	3979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_018227	GTT	2	6	4048	4053	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018227	GGT	2	6	4187	4192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018227	ACT	2	6	4239	4244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_018227	C	6	6	4287	4292	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
28	NC_018227	TCC	2	6	4340	4345	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_018227	CTA	2	6	4348	4353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_018227	CTGTT	2	10	4395	4404	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
31	NC_018227	CAC	2	6	4429	4434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_018227	ACC	2	6	4483	4488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_018227	TTTG	2	8	4527	4534	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018227	GAA	2	6	4567	4572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018227	GTCCGG	2	12	4579	4590	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_018227	CG	3	6	4617	4622	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_018227	CG	3	6	4732	4737	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_018227	GGCC	2	8	4787	4794	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_018227	GGT	2	6	4844	4849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018227	TCC	2	6	4879	4884	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_018227	GA	3	6	4920	4925	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018227	CCG	2	6	6330	6335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_018227	GC	3	6	8686	8691	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_018227	GGC	2	6	8702	8707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_018227	GCCC	2	8	8749	8756	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
46	NC_018227	GTG	2	6	8774	8779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018227	CGG	2	6	8824	8829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_018227	GCCT	2	8	9424	9431	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
49	NC_018227	CGTC	2	8	9456	9463	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
50	NC_018227	C	7	7	9468	9474	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
51	NC_018227	GGA	2	6	9481	9486	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018227	CGG	2	6	9493	9498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_018227	CAC	2	6	9534	9539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_018227	CCT	2	6	12532	12537	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_018227	GAAG	2	8	12548	12555	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018227	CCA	2	6	12560	12565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_018227	CGA	2	6	12599	12604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_018227	CGGGA	2	10	12633	12642	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
59	NC_018227	GGA	2	6	12669	12674	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018227	GTC	2	6	12696	12701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_018227	GGC	2	6	12751	12756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_018227	TCGG	2	8	12757	12764	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
63	NC_018227	CAT	2	6	12771	12776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_018227	TGA	2	6	12837	12842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018227	CTTT	2	8	12853	12860	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_018227	GTAT	2	8	12933	12940	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018227	AAT	2	6	12950	12955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018227	TC	3	6	14347	14352	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_018227	CAC	2	6	14429	14434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_018227	TTG	2	6	14443	14448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018227	CAC	2	6	14472	14477	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_018227	GA	3	6	14709	14714	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018227	GAAC	2	8	15648	15655	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_018227	GCC	2	6	15696	15701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_018227	GTG	2	6	15731	15736	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018227	TCA	2	6	17265	17270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_018227	CGGG	2	8	17311	17318	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
78	NC_018227	CAC	2	6	17646	17651	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_018227	CCA	2	6	17655	17660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_018227	TCGGA	2	10	17746	17755	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
81	NC_018227	GA	3	6	17754	17759	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018227	TGCTCC	2	12	17785	17796	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
83	NC_018227	GCCGG	2	10	17809	17818	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
84	NC_018227	GGC	2	6	17819	17824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_018227	CAT	2	6	17848	17853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_018227	TCC	2	6	17910	17915	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_018227	ATT	2	6	17965	17970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018227	GAC	2	6	20794	20799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_018227	GCC	2	6	20879	20884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_018227	GGC	2	6	20889	20894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_018227	CCT	2	6	20906	20911	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_018227	TCG	2	6	20938	20943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_018227	GCC	2	6	20957	20962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_018227	CTA	2	6	20973	20978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_018227	GGC	2	6	21039	21044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_018227	CGG	2	6	21045	21050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_018227	GGA	2	6	21194	21199	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018227	CCG	2	6	21209	21214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_018227	GCC	2	6	21246	21251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_018227	TGC	2	6	21339	21344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_018227	A	6	6	25523	25528	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018227	TGT	2	6	25553	25558	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018227	TGC	2	6	26526	26531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_018227	GAG	2	6	26535	26540	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018227	CT	3	6	26638	26643	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_018227	GAGC	2	8	26803	26810	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
107	NC_018227	TGGC	2	8	26876	26883	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
108	NC_018227	T	6	6	26937	26942	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018227	GGT	2	6	26965	26970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018227	CCT	2	6	26988	26993	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_018227	GAA	2	6	27068	27073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018227	CGC	2	6	27078	27083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_018227	ATT	2	6	27175	27180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018227	TC	3	6	28168	28173	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_018227	CA	3	6	28186	28191	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_018227	TCG	2	6	28210	28215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_018227	TTC	2	6	28284	28289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_018227	CCGA	2	8	31694	31701	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
119	NC_018227	TGC	2	6	31716	31721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_018227	GCC	2	6	31754	31759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_018227	CCG	2	6	31878	31883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_018227	TAG	2	6	31963	31968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018227	GCA	3	9	32047	32055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_018227	GAT	2	6	32128	32133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018227	CGG	2	6	32189	32194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_018227	GGC	2	6	32196	32201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_018227	CTC	2	6	32290	32295	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_018227	CGG	3	9	32333	32341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_018227	CTC	2	6	32350	32355	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_018227	ACGC	2	8	32371	32378	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
131	NC_018227	AT	3	6	33602	33607	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018227	ATG	2	6	33667	33672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018227	TCA	2	6	33695	33700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_018227	ATC	2	6	33714	33719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_018227	GAT	2	6	33731	33736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018227	AGA	2	6	33863	33868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018227	CGGGG	2	10	33892	33901	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
138	NC_018227	TCC	2	6	33906	33911	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_018227	CGG	2	6	33925	33930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_018227	CG	3	6	36550	36555	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
141	NC_018227	GGA	2	6	36593	36598	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018227	ACG	2	6	36623	36628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_018227	GAA	2	6	36636	36641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018227	TC	3	6	37437	37442	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_018227	TC	3	6	37446	37451	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_018227	TCT	2	6	37465	37470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_018227	CCGG	2	8	37526	37533	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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151	NC_018227	GCA	2	6	37750	37755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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153	NC_018227	CT	3	6	37846	37851	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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184	NC_018227	GAT	2	6	43042	43047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
185	NC_018227	TGA	2	6	43107	43112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
186	NC_018227	CT	4	8	43122	43129	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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291	NC_018227	A	6	6	83182	83187	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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431	NC_018227	CCCCT	2	10	122913	122922	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
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433	NC_018227	GAT	2	6	122938	122943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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438	NC_018227	CTA	2	6	123244	123249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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440	NC_018227	TGA	2	6	127823	127828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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445	NC_018227	CAT	2	6	128077	128082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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447	NC_018227	TTG	2	6	130739	130744	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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450	NC_018227	GAG	2	6	131141	131146	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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452	NC_018227	AGGGG	2	10	131200	131209	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
453	NC_018227	G	6	6	131206	131211	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
454	NC_018227	GAA	2	6	131222	131227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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461	NC_018227	TCT	2	6	131416	131421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
462	NC_018227	CA	3	6	131438	131443	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
463	NC_018227	CCA	2	6	131598	131603	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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465	NC_018227	GT	4	8	131650	131657	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
466	NC_018227	CAC	2	6	131691	131696	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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472	NC_018227	ATT	2	6	134288	134293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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474	NC_018227	GGAC	2	8	134365	134372	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
475	NC_018227	TGC	2	6	135278	135283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
476	NC_018227	CCT	2	6	137407	137412	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
477	NC_018227	CAG	2	6	137416	137421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
478	NC_018227	ACA	2	6	137431	137436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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481	NC_018227	GACTA	2	10	137698	137707	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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489	NC_018227	GCA	2	6	142725	142730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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491	NC_018227	GAT	2	6	144717	144722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
492	NC_018227	GAG	2	6	144723	144728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
493	NC_018227	CGC	3	9	144731	144739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
494	NC_018227	TACA	2	8	144808	144815	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
495	NC_018227	G	6	6	147732	147737	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
496	NC_018227	TTC	2	6	147741	147746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
497	NC_018227	TCCCCC	2	12	147753	147764	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
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