MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis H37Rv chromosome

Total Repeats: 991

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018143	CCGA	2	8	1725	1732	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_018143	GCCC	2	8	12453	12460	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3	NC_018143	ATTC	2	8	13691	13698	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_018143	TCAA	2	8	25514	25521	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_018143	GAGC	2	8	25542	25549	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_018143	GGCC	2	8	25556	25563	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_018143	ACCA	2	8	31124	31131	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_018143	GCTA	2	8	33855	33862	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_018143	CTAC	2	8	47219	47226	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_018143	CTGG	2	8	52716	52723	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_018143	GCCG	2	8	53570	53577	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_018143	CGGT	2	8	79167	79174	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_018143	CGGT	2	8	79352	79359	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_018143	CTGG	2	8	87197	87204	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_018143	CGCA	2	8	89498	89505	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_018143	CGCT	2	8	97628	97635	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_018143	CCTG	2	8	97675	97682	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_018143	GCGA	2	8	97719	97726	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_018143	ATCC	2	8	125577	125584	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_018143	GCGA	2	8	130664	130671	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_018143	CGGG	2	8	130707	130714	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
22	NC_018143	GCTC	2	8	131219	131226	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_018143	CGGG	2	8	133931	133938	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
24	NC_018143	TTCT	2	8	139847	139854	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_018143	ACGC	2	8	139919	139926	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_018143	AGCA	2	8	141091	141098	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_018143	GCCG	2	8	143897	143904	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_018143	GCGT	2	8	148441	148448	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_018143	GCGG	2	8	149507	149514	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
30	NC_018143	GCCG	2	8	152234	152241	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_018143	CCGG	2	8	155600	155607	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_018143	GCGT	3	12	155628	155639	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_018143	GGCT	2	8	157774	157781	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_018143	CGCA	2	8	157800	157807	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_018143	TCGT	2	8	161491	161498	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_018143	CCGG	2	8	161499	161506	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_018143	CCCG	2	8	161711	161718	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
38	NC_018143	ACTT	2	8	171188	171195	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_018143	GCCG	2	8	180896	180903	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_018143	TTGA	2	8	186720	186727	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018143	CTGG	2	8	196705	196712	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_018143	CTGT	2	8	212257	212264	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_018143	GGCC	2	8	218345	218352	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_018143	CGGT	2	8	218681	218688	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_018143	GATG	2	8	219428	219435	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018143	AACT	2	8	230623	230630	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_018143	GGAA	2	8	230798	230805	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018143	ACGT	2	8	231550	231557	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_018143	ACAT	2	8	231617	231624	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_018143	GTGC	2	8	241330	241337	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_018143	GAAC	2	8	249016	249023	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_018143	CGCA	2	8	253625	253632	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
53	NC_018143	GACG	2	8	256034	256041	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_018143	GCGG	2	8	272915	272922	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
55	NC_018143	CGGC	2	8	274281	274288	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_018143	TAGA	2	8	288390	288397	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018143	ACTT	2	8	292095	292102	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_018143	TCGT	2	8	293722	293729	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_018143	AACT	2	8	295772	295779	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_018143	AACC	2	8	295780	295787	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_018143	ATGC	2	8	296770	296777	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_018143	GACG	2	8	302088	302095	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
63	NC_018143	TCGG	2	8	310125	310132	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
64	NC_018143	GCCG	2	8	336511	336518	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_018143	TGGC	2	8	336523	336530	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_018143	CTGT	2	8	364517	364524	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_018143	AATC	2	8	375758	375765	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_018143	GGCC	2	8	386118	386125	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_018143	AAGG	2	8	387134	387141	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018143	TGAC	2	8	396103	396110	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_018143	GTCA	2	8	396114	396121	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_018143	ATCG	2	8	417084	417091	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_018143	GCCA	2	8	417175	417182	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
74	NC_018143	GTCC	2	8	417201	417208	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
75	NC_018143	ACGG	2	8	417287	417294	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
76	NC_018143	GAGC	2	8	424069	424076	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
77	NC_018143	GAGC	2	8	424120	424127	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
78	NC_018143	CACG	2	8	454391	454398	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
79	NC_018143	TGCG	2	8	455503	455510	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
80	NC_018143	GCTC	2	8	455883	455890	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
81	NC_018143	GGAT	2	8	468176	468183	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018143	CGAG	2	8	468319	468326	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
83	NC_018143	CAAC	2	8	480268	480275	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_018143	AGAA	2	8	490775	490782	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018143	GCGG	2	8	503151	503158	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
86	NC_018143	ACCG	2	8	505031	505038	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
87	NC_018143	CGGG	2	8	505068	505075	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
88	NC_018143	GAGG	2	8	507024	507031	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018143	GCGT	2	8	507110	507117	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
90	NC_018143	ACGG	2	8	510360	510367	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
91	NC_018143	GATG	2	8	515334	515341	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018143	CTGA	2	8	515958	515965	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_018143	GCAA	2	8	518594	518601	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_018143	GCTG	2	8	521467	521474	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
95	NC_018143	CCGT	2	8	528512	528519	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
96	NC_018143	CGGC	2	8	533824	533831	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_018143	CGGC	2	8	538567	538574	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_018143	GACG	2	8	538577	538584	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
99	NC_018143	CCGA	2	8	544829	544836	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
100	NC_018143	GTCT	2	8	545882	545889	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_018143	CGGC	2	8	559883	559890	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_018143	CCGG	2	8	560818	560825	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_018143	AGCA	2	8	564962	564969	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_018143	CGAC	2	8	565632	565639	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
105	NC_018143	CGCC	2	8	577522	577529	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
106	NC_018143	GCAT	2	8	577605	577612	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_018143	GTTT	2	8	586339	586346	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018143	GCCG	2	8	591353	591360	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
109	NC_018143	GCTA	2	8	596655	596662	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_018143	GCGT	2	8	604541	604548	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
111	NC_018143	CCGA	2	8	604566	604573	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
112	NC_018143	CCGA	2	8	608569	608576	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
113	NC_018143	GTCC	2	8	611124	611131	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
114	NC_018143	GCCC	2	8	625540	625547	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
115	NC_018143	AGCC	2	8	630021	630028	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
116	NC_018143	CCGG	2	8	635545	635552	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
117	NC_018143	TGCC	2	8	639982	639989	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
118	NC_018143	CGCC	2	8	640927	640934	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
119	NC_018143	GCCG	2	8	651524	651531	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_018143	TGGC	2	8	654814	654821	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
121	NC_018143	CCAG	2	8	657524	657531	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
122	NC_018143	CGGT	2	8	658268	658275	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
123	NC_018143	GTGC	2	8	660968	660975	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NC_018143	AAGG	2	8	660991	660998	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018143	CGGC	2	8	663475	663482	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_018143	TTGC	2	8	665569	665576	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_018143	GTCG	2	8	665640	665647	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
128	NC_018143	CGGC	2	8	668469	668476	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_018143	GTGG	2	8	668486	668493	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018143	GCCG	2	8	671975	671982	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_018143	CGAA	2	8	676078	676085	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_018143	CGGC	2	8	677103	677110	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133	NC_018143	CCGG	2	8	679109	679116	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
134	NC_018143	TTCA	2	8	684395	684402	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_018143	CGGA	2	8	695625	695632	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
136	NC_018143	TCCG	2	8	696997	697004	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
137	NC_018143	CCCA	2	8	704224	704231	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
138	NC_018143	ACCG	2	8	704321	704328	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
139	NC_018143	CCGC	2	8	706936	706943	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
140	NC_018143	GGTC	2	8	713973	713980	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
141	NC_018143	CGGC	2	8	728330	728337	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_018143	CATG	2	8	728344	728351	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_018143	CACC	2	8	728576	728583	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
144	NC_018143	GCTG	2	8	730241	730248	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
145	NC_018143	GACT	2	8	731908	731915	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
146	NC_018143	AGGT	2	8	731916	731923	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018143	TGCC	2	8	733511	733518	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
148	NC_018143	AAGG	2	8	735004	735011	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_018143	CGCA	2	8	736257	736264	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
150	NC_018143	ACCC	2	8	742665	742672	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
151	NC_018143	AGGA	2	8	748835	748842	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_018143	CGGC	2	8	754468	754475	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
153	NC_018143	TCGA	2	8	754516	754523	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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155	NC_018143	TGCG	2	8	759682	759689	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
156	NC_018143	GCCG	2	8	759711	759718	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
157	NC_018143	ACGG	2	8	769709	769716	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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159	NC_018143	GGCA	2	8	780530	780537	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
160	NC_018143	GCGG	2	8	780685	780692	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
161	NC_018143	CCGC	2	8	780693	780700	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
162	NC_018143	AGCC	2	8	782420	782427	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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165	NC_018143	GGCG	2	8	794635	794642	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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189	NC_018143	GCCC	2	8	895662	895669	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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287	NC_018143	GCTT	2	8	1306105	1306112	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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292	NC_018143	GCCG	2	8	1357206	1357213	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
293	NC_018143	CAGC	2	8	1357742	1357749	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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432	NC_018143	GAAT	2	8	2025091	2025098	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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434	NC_018143	CGGT	2	8	2029541	2029548	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
435	NC_018143	CGGT	2	8	2029648	2029655	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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438	NC_018143	AGGA	2	8	2039444	2039451	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
439	NC_018143	GTTG	2	8	2044858	2044865	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
440	NC_018143	GGGT	2	8	2049614	2049621	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
441	NC_018143	TGGC	2	8	2051242	2051249	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
442	NC_018143	GCCA	2	8	2051251	2051258	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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454	NC_018143	GCTG	2	8	2087109	2087116	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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468	NC_018143	ACGG	2	8	2153018	2153025	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
469	NC_018143	TTCC	2	8	2156123	2156130	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
470	NC_018143	AACG	2	8	2167517	2167524	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
471	NC_018143	TCGT	2	8	2170683	2170690	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
472	NC_018143	CCGT	2	8	2171598	2171605	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
473	NC_018143	GCCG	2	8	2171606	2171613	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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476	NC_018143	CTGC	2	8	2197467	2197474	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
477	NC_018143	CTGC	2	8	2198021	2198028	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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481	NC_018143	GGCC	2	8	2204825	2204832	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
482	NC_018143	GGAG	2	8	2216586	2216593	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
483	NC_018143	CGCT	2	8	2219524	2219531	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
484	NC_018143	CCAA	2	8	2219700	2219707	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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487	NC_018143	CGCT	2	8	2232573	2232580	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
488	NC_018143	CCGT	2	8	2242889	2242896	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
489	NC_018143	GTGC	2	8	2242906	2242913	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
490	NC_018143	GGCA	2	8	2248460	2248467	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
491	NC_018143	CGGC	2	8	2256037	2256044	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
492	NC_018143	TGAG	2	8	2258783	2258790	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
493	NC_018143	TGGA	2	8	2260297	2260304	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
494	NC_018143	GCTC	2	8	2260343	2260350	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
495	NC_018143	ACGA	2	8	2261745	2261752	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
496	NC_018143	ATAG	2	8	2263300	2263307	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
497	NC_018143	CAGC	2	8	2263318	2263325	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
498	NC_018143	CCGA	2	8	2263416	2263423	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
499	NC_018143	CCAG	2	8	2268215	2268222	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
500	NC_018143	AAGC	2	8	2271808	2271815	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding

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