MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis H37Rv chromosome

Total Repeats: 5553

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018143	TTC	2	6	1534	1539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_018143	CGG	2	6	1643	1648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_018143	TCG	2	6	1801	1806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_018143	ACC	2	6	1848	1853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_018143	TCG	2	6	1866	1871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_018143	ATG	2	6	1889	1894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018143	GTT	3	9	1925	1933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018143	CTG	2	6	1937	1942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_018143	CGT	2	6	1950	1955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_018143	TCG	2	6	1979	1984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_018143	GAA	2	6	5091	5096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018143	CGA	3	9	9830	9838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_018143	GAG	2	6	9859	9864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018143	TCG	2	6	10862	10867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_018143	TCC	2	6	10947	10952	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_018143	ACG	2	6	10977	10982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_018143	GGC	2	6	11022	11027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_018143	TCG	2	6	11030	11035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_018143	CCT	2	6	11083	11088	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_018143	CGG	2	6	11320	11325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_018143	ACG	2	6	11382	11387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_018143	GCC	2	6	11532	11537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_018143	CGA	2	6	11694	11699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_018143	ACT	2	6	11741	11746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_018143	CAT	2	6	11802	11807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_018143	GAC	2	6	11863	11868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_018143	GCC	2	6	12315	12320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_018143	CGG	2	6	12395	12400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_018143	TCG	2	6	13034	13039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_018143	CAC	2	6	13577	13582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_018143	CGG	2	6	13702	13707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_018143	GAC	2	6	14032	14037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_018143	TCG	2	6	23254	23259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_018143	GGT	2	6	23816	23821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018143	TCG	2	6	25476	25481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_018143	CCG	2	6	25577	25582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_018143	CTA	2	6	25612	25617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_018143	TCC	2	6	25629	25634	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_018143	GTT	2	6	25636	25641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018143	TCG	3	9	25756	25764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_018143	GCC	2	6	25770	25775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_018143	AAC	2	6	26882	26887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_018143	CGT	2	6	26900	26905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_018143	CTT	2	6	26951	26956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_018143	CCT	2	6	27450	27455	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_018143	GTA	2	6	27565	27570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018143	GCG	2	6	31083	31088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_018143	CGG	2	6	31135	31140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_018143	CAA	2	6	31170	31175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_018143	GAG	2	6	31176	31181	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018143	GGC	2	6	31873	31878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_018143	TCG	2	6	31933	31938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_018143	TGC	3	9	31942	31950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_018143	CAC	2	6	32005	32010	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_018143	GAT	2	6	32034	32039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018143	TGG	2	6	33199	33204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018143	CGG	2	6	33914	33919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_018143	GCG	2	6	33935	33940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_018143	TGG	2	6	33996	34001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018143	CGG	2	6	34067	34072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_018143	GGT	2	6	34129	34134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018143	CCA	2	6	34151	34156	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_018143	TCA	2	6	38963	38968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_018143	CAC	2	6	39830	39835	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_018143	TCG	2	6	39852	39857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_018143	GCC	2	6	41226	41231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_018143	GGT	2	6	41287	41292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018143	GAT	2	6	41295	41300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018143	CCG	3	9	41919	41927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_018143	AGC	2	6	41938	41943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_018143	GCC	2	6	42368	42373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_018143	CGT	2	6	43403	43408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_018143	GTG	2	6	43480	43485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018143	CGG	2	6	46479	46484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_018143	CGC	2	6	46534	46539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_018143	CGG	2	6	46546	46551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_018143	GCT	2	6	47336	47341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_018143	GTG	2	6	50000	50005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018143	CCT	2	6	51735	51740	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_018143	ACG	2	6	51766	51771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_018143	ACA	2	6	51814	51819	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_018143	TAG	2	6	52706	52711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018143	CCG	2	6	52740	52745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_018143	CAA	2	6	52754	52759	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_018143	GGT	2	6	52778	52783	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018143	CGT	2	6	52792	52797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_018143	GTC	2	6	53263	53268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_018143	GCG	2	6	53271	53276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_018143	CGA	2	6	53323	53328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_018143	TCC	2	6	53343	53348	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_018143	CGC	2	6	53436	53441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_018143	GAG	2	6	53453	53458	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018143	GCC	2	6	53474	53479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_018143	CCG	2	6	53492	53497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_018143	TGG	2	6	53512	53517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018143	GCC	2	6	53536	53541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_018143	CGC	2	6	58023	58028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_018143	TCG	2	6	58032	58037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_018143	GGT	2	6	58060	58065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018143	CCT	2	6	58132	58137	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_018143	AGG	2	6	58170	58175	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018143	TGA	2	6	58176	58181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018143	GAA	3	9	58533	58541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018143	GCC	2	6	58550	58555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_018143	AGG	2	6	58572	58577	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018143	ATG	2	6	63063	63068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018143	CGG	2	6	63101	63106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_018143	CGT	2	6	63130	63135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_018143	AGG	3	9	63893	63901	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018143	TCG	2	6	64976	64981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_018143	CGG	2	6	65377	65382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_018143	GCC	2	6	65530	65535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_018143	GGT	2	6	66818	66823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018143	TGC	2	6	66856	66861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_018143	CTG	2	6	68463	68468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_018143	CTG	2	6	68482	68487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_018143	GCC	3	9	68506	68514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_018143	GCC	2	6	68529	68534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_018143	TCG	2	6	68582	68587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_018143	AGG	2	6	68606	68611	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018143	CGT	2	6	72247	72252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_018143	GCG	2	6	74561	74566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_018143	CGA	3	9	74617	74625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_018143	GAG	2	6	75287	75292	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018143	CGG	2	6	78977	78982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_018143	CGA	2	6	79059	79064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_018143	GCG	2	6	79124	79129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_018143	CAT	2	6	79133	79138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_018143	CGG	2	6	79203	79208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_018143	GAG	2	6	79239	79244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018143	CGG	2	6	79445	79450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_018143	GGC	2	6	79463	79468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_018143	ACC	2	6	80191	80196	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_018143	GGC	2	6	80255	80260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_018143	GCA	2	6	80277	80282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_018143	CCA	2	6	80343	80348	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_018143	CGG	2	6	80367	80372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_018143	ACC	3	9	80519	80527	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_018143	CTT	2	6	85608	85613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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