MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis KZN 605 chromosome

Total Repeats: 384

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018078	ACCCG	2	10	11380	11389	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
2	NC_018078	CGACC	2	10	13773	13782	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
3	NC_018078	CGAGC	2	10	27069	27078	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4	NC_018078	CCGCC	2	10	33909	33918	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
5	NC_018078	GCGTC	2	10	42046	42055	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
6	NC_018078	ATCGG	2	10	47453	47462	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
7	NC_018078	TCAGG	2	10	62551	62560	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
8	NC_018078	TGCCG	2	10	65582	65591	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
9	NC_018078	GCACC	2	10	80421	80430	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
10	NC_018078	CCACC	2	10	80614	80623	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
11	NC_018078	CGGCG	2	10	99456	99465	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
12	NC_018078	GGTGA	2	10	100623	100632	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018078	GCACG	2	10	124445	124454	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
14	NC_018078	GGGTC	2	10	147994	148003	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
15	NC_018078	ATTGG	2	10	152560	152569	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018078	AGCGA	2	10	154463	154472	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
17	NC_018078	GTCGC	2	10	161812	161821	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
18	NC_018078	GCATG	2	10	171462	171471	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
19	NC_018078	GGAAG	2	10	194910	194919	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018078	GCCGA	2	10	214865	214874	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
21	NC_018078	GGTGC	2	10	222138	222147	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
22	NC_018078	GGCCG	2	10	231499	231508	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
23	NC_018078	GCAGT	2	10	275943	275952	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
24	NC_018078	CGGCC	2	10	302082	302091	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
25	NC_018078	AGCGG	2	10	314237	314246	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
26	NC_018078	TCGGC	2	10	316400	316409	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
27	NC_018078	CTTGA	2	10	380776	380785	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_018078	TCGCA	2	10	388946	388955	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
29	NC_018078	CAACG	2	10	417173	417182	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
30	NC_018078	CCTAC	2	10	439691	439700	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
31	NC_018078	GTCCG	2	10	468348	468357	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
32	NC_018078	TCGGA	2	10	473023	473032	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
33	NC_018078	CCCGG	2	10	480027	480036	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
34	NC_018078	AGCGC	2	10	510594	510603	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
35	NC_018078	GTCGC	2	10	518791	518800	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
36	NC_018078	AGGCC	2	10	528723	528732	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
37	NC_018078	TCGCT	2	10	534071	534080	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
38	NC_018078	AGCCT	2	10	542271	542280	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
39	NC_018078	TAGGG	2	10	552861	552870	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018078	CCGAC	2	10	565899	565908	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
41	NC_018078	GGCCG	2	10	630116	630125	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
42	NC_018078	GCAGG	2	10	635830	635839	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
43	NC_018078	CAGAT	2	10	641373	641382	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
44	NC_018078	CGGCC	2	10	646579	646588	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
45	NC_018078	CAGGT	2	10	676237	676246	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
46	NC_018078	CACGG	2	10	701616	701625	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
47	NC_018078	ATCAG	2	10	729602	729611	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
48	NC_018078	CTGGT	2	10	733807	733816	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
49	NC_018078	GCGAC	2	10	748807	748816	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
50	NC_018078	GACCG	2	10	748873	748882	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
51	NC_018078	GGGGA	2	10	759361	759370	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018078	CGCCA	2	10	771247	771256	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
53	NC_018078	AGCGA	2	10	796334	796343	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
54	NC_018078	AGGAC	2	10	799479	799488	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
55	NC_018078	AGCGA	2	10	803295	803304	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
56	NC_018078	AGCGA	2	10	803349	803358	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
57	NC_018078	AGCGA	2	10	803403	803412	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
58	NC_018078	AGCGA	2	10	803457	803466	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
59	NC_018078	GTGTA	2	10	807289	807298	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018078	ACGAT	2	10	811973	811982	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
61	NC_018078	ACTCG	2	10	828514	828523	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
62	NC_018078	GGCCG	2	10	837494	837503	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
63	NC_018078	CGGCG	2	10	838221	838230	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
64	NC_018078	GCCGG	2	10	838639	838648	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
65	NC_018078	CGGCA	2	10	839064	839073	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
66	NC_018078	GCGCT	2	10	847314	847323	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
67	NC_018078	ATCGG	2	10	853569	853578	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
68	NC_018078	CGCGA	2	10	861988	861997	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
69	NC_018078	GCCGA	2	10	879721	879730	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
70	NC_018078	AGTTC	2	10	901380	901389	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
71	NC_018078	ACGCC	2	10	904698	904707	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
72	NC_018078	TTGCT	2	10	923577	923586	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
73	NC_018078	TGGCG	2	10	924641	924650	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
74	NC_018078	GCGCA	2	10	936246	936255	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
75	NC_018078	TGGGC	2	10	939822	939831	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
76	NC_018078	CGTGT	2	10	1018835	1018844	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
77	NC_018078	CGGGG	2	10	1032554	1032563	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
78	NC_018078	CGCAC	2	10	1035482	1035491	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
79	NC_018078	GCGCA	2	10	1037329	1037338	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
80	NC_018078	CCGCG	2	10	1056372	1056381	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
81	NC_018078	GCATT	2	10	1101531	1101540	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
82	NC_018078	TTCGA	2	10	1103003	1103012	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
83	NC_018078	GGCCA	2	10	1103031	1103040	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
84	NC_018078	TCGCG	2	10	1111043	1111052	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
85	NC_018078	GCAGC	2	10	1111105	1111114	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
86	NC_018078	GATGT	2	10	1130414	1130423	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018078	CGTGC	2	10	1170262	1170271	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
88	NC_018078	CGATT	2	10	1184068	1184077	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
89	NC_018078	CGCGG	2	10	1184159	1184168	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
90	NC_018078	CGGGT	2	10	1208682	1208691	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
91	NC_018078	CAGAA	2	10	1220589	1220598	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
92	NC_018078	CCACG	2	10	1235616	1235625	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
93	NC_018078	GCCGG	2	10	1257806	1257815	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
94	NC_018078	ATAGT	2	10	1278424	1278433	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018078	TCGGT	2	10	1281108	1281117	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
96	NC_018078	GTCGT	2	10	1290518	1290527	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
97	NC_018078	TCAGA	2	10	1293282	1293291	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
98	NC_018078	CTCAG	2	10	1293436	1293445	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
99	NC_018078	CACGA	2	10	1293648	1293657	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
100	NC_018078	GGTGT	2	10	1294723	1294732	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018078	GTCTG	2	10	1368379	1368388	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
102	NC_018078	CCCGG	2	10	1380281	1380290	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
103	NC_018078	AGGGG	2	10	1430612	1430621	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018078	CGTTT	2	10	1444723	1444732	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
105	NC_018078	TCGAA	2	10	1444998	1445007	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
106	NC_018078	GGCAG	2	10	1448537	1448546	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
107	NC_018078	GCAAG	2	10	1448964	1448973	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
108	NC_018078	ATGAC	2	10	1449616	1449625	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
109	NC_018078	TCACT	2	10	1458900	1458909	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
110	NC_018078	TCGTA	2	10	1479826	1479835	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
111	NC_018078	CGGCG	2	10	1496095	1496104	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
112	NC_018078	GTGAT	2	10	1519492	1519501	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018078	TGCGT	2	10	1544268	1544277	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
114	NC_018078	TCCGA	2	10	1578248	1578257	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
115	NC_018078	GCACA	2	10	1580388	1580397	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
116	NC_018078	GCCGC	2	10	1583060	1583069	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
117	NC_018078	GTTTC	2	10	1583233	1583242	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
118	NC_018078	CAGCG	2	10	1585444	1585453	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
119	NC_018078	GTCGC	2	10	1600246	1600255	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
120	NC_018078	CCGGC	2	10	1600334	1600343	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
121	NC_018078	TGGGC	2	10	1600422	1600431	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
122	NC_018078	CCGGC	2	10	1600635	1600644	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
123	NC_018078	CAAGG	2	10	1607553	1607562	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
124	NC_018078	GCCAC	2	10	1620872	1620881	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
125	NC_018078	AGGAA	2	10	1629151	1629160	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018078	CGTGG	2	10	1651285	1651294	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
127	NC_018078	GAAAT	2	10	1656962	1656971	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018078	TGGGC	2	10	1680968	1680977	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
129	NC_018078	GGAGT	2	10	1685514	1685523	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018078	AGCGA	2	10	1697428	1697437	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
131	NC_018078	ACGCG	2	10	1721300	1721309	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
132	NC_018078	CCGCG	2	10	1736104	1736113	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
133	NC_018078	TCAGA	2	10	1782550	1782559	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
134	NC_018078	CTGAG	2	10	1784580	1784589	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
135	NC_018078	ACACG	2	10	1786271	1786280	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
136	NC_018078	CCTGG	2	10	1789706	1789715	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
137	NC_018078	CCGGC	2	10	1797449	1797458	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
138	NC_018078	CGGCG	2	10	1816203	1816212	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
139	NC_018078	GGCTG	2	10	1833756	1833765	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
140	NC_018078	CGGGC	2	10	1841349	1841358	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
141	NC_018078	CGGCG	2	10	1847650	1847659	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
142	NC_018078	TCAGA	2	10	1862097	1862106	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
143	NC_018078	CGCTG	2	10	1866526	1866535	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
144	NC_018078	AGCGA	2	10	1884517	1884526	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
145	NC_018078	AGCGA	2	10	1884570	1884579	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
146	NC_018078	AGCGA	2	10	1884623	1884632	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
147	NC_018078	AGCGA	2	10	1884676	1884685	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
148	NC_018078	AGCGA	2	10	1884729	1884738	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
149	NC_018078	AGCGA	2	10	1884782	1884791	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
150	NC_018078	GCGAC	2	10	1906395	1906404	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
151	NC_018078	GTCGA	2	10	1915953	1915962	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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153	NC_018078	GGTGA	2	10	1941754	1941763	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
154	NC_018078	TCGGT	2	10	1945316	1945325	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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159	NC_018078	CCGAC	2	10	2021485	2021494	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
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191	NC_018078	CCCCG	2	10	2255316	2255325	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
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277	NC_018078	TGGGT	2	10	3201739	3201748	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
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280	NC_018078	CGATG	2	10	3211740	3211749	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
281	NC_018078	TGCGC	2	10	3212140	3212149	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
282	NC_018078	GAGGC	2	10	3215620	3215629	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
283	NC_018078	TTCCG	2	10	3219490	3219499	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
284	NC_018078	ACAGC	2	10	3232423	3232432	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
285	NC_018078	TCAAA	2	10	3232731	3232740	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
286	NC_018078	TGCGC	2	10	3233167	3233176	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
287	NC_018078	GGTTG	2	10	3234179	3234188	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
288	NC_018078	GCGTG	2	10	3244895	3244904	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
289	NC_018078	GGCAA	2	10	3246091	3246100	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
290	NC_018078	TGCCC	2	10	3263512	3263521	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
291	NC_018078	CGCGG	2	10	3271775	3271784	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
292	NC_018078	TCCGG	2	10	3273460	3273469	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
293	NC_018078	TAGCC	2	10	3277013	3277022	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
294	NC_018078	TCGGT	2	10	3280208	3280217	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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298	NC_018078	CGCTG	2	10	3354125	3354134	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
299	NC_018078	CGTGG	2	10	3387651	3387660	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
300	NC_018078	GGGGT	2	10	3412349	3412358	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
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302	NC_018078	AGTCC	2	10	3424581	3424590	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
303	NC_018078	CGTGG	2	10	3424671	3424680	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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310	NC_018078	GAGAT	2	10	3491077	3491086	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
311	NC_018078	GGAGT	2	10	3491407	3491416	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
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320	NC_018078	CGATG	2	10	3558773	3558782	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
321	NC_018078	CTGGT	2	10	3567919	3567928	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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323	NC_018078	GTAGT	2	10	3594725	3594734	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
324	NC_018078	GAACC	2	10	3598977	3598986	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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326	NC_018078	GCGCT	2	10	3711376	3711385	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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333	NC_018078	CGGAC	2	10	3841206	3841215	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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342	NC_018078	TCGGC	2	10	3936972	3936981	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
343	NC_018078	GCCCG	2	10	3950666	3950675	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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356	NC_018078	GGTGC	2	10	4076143	4076152	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
357	NC_018078	CTGAA	2	10	4080617	4080626	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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362	NC_018078	CGCTC	2	10	4106305	4106314	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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372	NC_018078	TGGTT	2	10	4193259	4193268	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
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375	NC_018078	GCCGC	2	10	4223147	4223156	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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378	NC_018078	CATGC	2	10	4261482	4261491	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
379	NC_018078	TGCCA	2	10	4265933	4265942	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
380	NC_018078	GCCGG	2	10	4287603	4287612	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
381	NC_018078	CGTCG	2	10	4326602	4326611	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
382	NC_018078	GACCA	2	10	4370701	4370710	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
383	NC_018078	TATCT	2	10	4375121	4375130	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
384	NC_018078	CCGGG	2	10	4387972	4387981	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.