MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycoplasma bovis HB0801 chromosome

Total Repeats: 182

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018077	ATATT	2	10	15853	15862	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018077	AAAAT	2	10	51074	51083	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018077	TATAA	2	10	52707	52716	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018077	TTGTC	2	10	60242	60251	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_018077	ACATT	2	10	65803	65812	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_018077	TAATA	2	10	81130	81139	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018077	TATAA	2	10	113923	113932	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018077	TTAAA	2	10	116700	116709	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018077	AAAGA	2	10	116794	116803	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018077	TAAAT	2	10	131002	131011	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018077	AAATA	2	10	147471	147480	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018077	TAAAA	2	10	150808	150817	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018077	TAGTT	2	10	164646	164655	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018077	TTATG	2	10	178612	178621	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018077	AATTA	2	10	183557	183566	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018077	ATTTG	2	10	183858	183867	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018077	AGTTA	2	10	184516	184525	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018077	TTTTG	2	10	185689	185698	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018077	ATTTG	2	10	188377	188386	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018077	TTAAA	2	10	194522	194531	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018077	AAAGA	2	10	194616	194625	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018077	TAACT	2	10	206771	206780	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_018077	GTTGT	2	10	211235	211244	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018077	AAAGA	2	10	213298	213307	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018077	ATTTT	2	10	230919	230928	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018077	AAAGA	2	10	244838	244847	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018077	AAAAT	2	10	254946	254955	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018077	AATGG	2	10	276353	276362	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018077	TAATG	2	10	285298	285307	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018077	AATGT	2	10	295809	295818	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018077	TAAAT	2	10	310405	310414	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018077	TAATT	2	10	310508	310517	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018077	AATTT	2	10	311222	311231	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018077	AAATA	2	10	322081	322090	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018077	TTATT	2	10	325751	325760	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018077	ATAAA	2	10	341251	341260	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018077	TTGTT	2	10	341471	341480	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018077	AAAGC	2	10	341496	341505	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
39	NC_018077	ATTTT	2	10	342686	342695	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018077	GCAAG	2	10	347184	347193	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
41	NC_018077	AATGT	2	10	347323	347332	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018077	TAAAA	2	10	350783	350792	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018077	ACATT	2	10	352742	352751	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_018077	TAAAA	2	10	352858	352867	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018077	TAGCG	2	10	360829	360838	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
46	NC_018077	ATTAA	2	10	371163	371172	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018077	TTAAA	2	10	374272	374281	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018077	AAAGA	2	10	374366	374375	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018077	ATAAA	2	10	376282	376291	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018077	AATTA	2	10	385184	385193	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018077	ATACT	2	10	389735	389744	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_018077	GTCTC	2	10	401041	401050	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
53	NC_018077	TTAAT	2	10	405353	405362	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018077	ACATT	2	10	414806	414815	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_018077	TAACA	2	10	414819	414828	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_018077	TTAAA	2	10	415965	415974	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018077	AAAGA	2	10	416059	416068	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018077	AGAAT	2	10	417534	417543	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018077	TAATG	2	10	419982	419991	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018077	AAGGA	2	10	423616	423625	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018077	AATAG	2	10	425119	425128	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018077	ATTTA	2	10	425429	425438	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018077	TTAAA	2	10	426513	426522	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018077	AAAGA	2	10	426607	426616	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018077	TAAAA	2	10	434454	434463	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018077	AATAA	2	10	443892	443901	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018077	AAACT	2	10	449584	449593	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_018077	CAAAA	2	10	449753	449762	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_018077	AAAGT	2	10	451914	451923	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018077	GGCAA	2	10	452297	452306	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
71	NC_018077	ATATA	2	10	456587	456596	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018077	AAAAG	2	10	458318	458327	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018077	TGGTT	2	10	459004	459013	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018077	TTCAA	2	10	469373	469382	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_018077	TACTT	2	10	471952	471961	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_018077	CAATT	2	10	481998	482007	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_018077	TATAA	2	10	485315	485324	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018077	TAAAA	2	10	495120	495129	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018077	ATATA	2	10	499135	499144	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018077	ATTAT	2	10	502878	502887	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018077	AAATT	2	10	515829	515838	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018077	TTTTA	2	10	515895	515904	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018077	TCTTT	2	10	520226	520235	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_018077	TTTAA	2	10	520320	520329	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018077	TAATG	2	10	527821	527830	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018077	TCTTT	2	10	530983	530992	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_018077	TTTAA	2	10	531077	531086	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018077	ATCAA	2	10	532132	532141	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_018077	CTTTT	2	10	534497	534506	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_018077	ACATT	2	10	536310	536319	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_018077	CTTTT	2	10	536429	536438	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_018077	TTTAA	2	10	540776	540785	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018077	AGAAA	2	10	542763	542772	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018077	TTAAT	2	10	543121	543130	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018077	TAATT	2	10	550278	550287	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018077	ATATA	2	10	550744	550753	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018077	TTAAT	2	10	550777	550786	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018077	ATTTA	2	10	550867	550876	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018077	TAAAA	2	10	554330	554339	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018077	GATAA	2	10	556652	556661	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018077	AATTA	2	10	556897	556906	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018077	AAATT	2	10	561327	561336	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018077	AAAAT	2	10	569505	569514	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018077	ATTTA	2	10	571538	571547	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018077	TTAAT	2	10	579977	579986	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018077	ATGCA	2	10	581114	581123	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
107	NC_018077	CATAA	2	10	613566	613575	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_018077	TTCCA	2	10	613707	613716	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
109	NC_018077	ATTAA	2	10	615766	615775	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018077	ATTAA	2	10	619367	619376	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018077	TTGAT	2	10	620448	620457	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018077	TTTCT	2	10	620570	620579	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_018077	ATAAA	2	10	620865	620874	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018077	ATTTA	2	10	640419	640428	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018077	TAAAA	2	10	647104	647113	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018077	CTATC	2	10	648579	648588	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
117	NC_018077	TTTTG	2	10	652127	652136	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018077	AAAAC	2	10	652205	652214	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_018077	TAAAT	2	10	652256	652265	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018077	ACTAT	2	10	653743	653752	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_018077	TAATG	2	10	659226	659235	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018077	ATTTT	2	10	668147	668156	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018077	TTATA	2	10	668590	668599	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018077	TAATT	2	10	679293	679302	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018077	AAAAT	2	10	695501	695510	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018077	TTATA	2	10	708752	708761	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018077	TTTTC	2	10	711680	711689	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_018077	CGTAG	2	10	712379	712388	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
129	NC_018077	CACGA	2	10	712669	712678	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
130	NC_018077	TTTTC	2	10	718330	718339	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_018077	CGTAG	2	10	719028	719037	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
132	NC_018077	CACGA	2	10	719318	719327	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
133	NC_018077	TTTAA	2	10	723750	723759	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018077	TTCTT	2	10	724019	724028	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_018077	TAAAA	2	10	735747	735756	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018077	AATAA	2	10	736927	736936	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018077	TAAAC	2	10	742611	742620	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_018077	AAATT	2	10	745864	745873	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018077	TAAAA	2	10	750563	750572	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018077	TTGAT	2	10	767975	767984	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018077	CTTTT	2	10	771500	771509	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_018077	AAAAT	2	10	781999	782008	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018077	TGTGT	2	10	783450	783459	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018077	AATTA	2	10	783589	783598	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018077	AATTA	2	10	794179	794188	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018077	TTTAT	2	10	797747	797756	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018077	TAACA	2	10	798892	798901	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
148	NC_018077	TTTTA	2	10	827085	827094	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.