MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium chubuense NBB4 chromosome

Total Repeats: 409

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018027	CCGAT	2	10	61391	61400	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2	NC_018027	TCGGG	2	10	70083	70092	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
3	NC_018027	CGCGC	2	10	99800	99809	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
4	NC_018027	CGATC	2	10	105824	105833	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5	NC_018027	TCGGT	2	10	149178	149187	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
6	NC_018027	CAACG	2	10	183360	183369	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
7	NC_018027	GGCCG	2	10	183501	183510	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
8	NC_018027	CGGCG	2	10	202994	203003	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
9	NC_018027	ATGTC	2	10	203086	203095	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_018027	GGCGG	2	10	206503	206512	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
11	NC_018027	TGTCG	2	10	226921	226930	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
12	NC_018027	GCATC	2	10	229711	229720	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
13	NC_018027	TCTGC	2	10	244526	244535	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
14	NC_018027	TCCGT	2	10	246100	246109	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
15	NC_018027	GTGCT	2	10	261314	261323	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
16	NC_018027	CCGGA	2	10	311996	312005	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
17	NC_018027	GCGAC	2	10	312413	312422	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
18	NC_018027	GAGAG	2	10	337129	337138	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018027	CGGCC	2	10	356056	356065	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
20	NC_018027	CCGCG	2	10	361347	361356	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
21	NC_018027	AATCG	2	10	379135	379144	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
22	NC_018027	CGGGG	2	10	387076	387085	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
23	NC_018027	CGCCC	2	10	392762	392771	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
24	NC_018027	CCGGC	2	10	392973	392982	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
25	NC_018027	CGGAT	2	10	398542	398551	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
26	NC_018027	CGGGT	2	10	399106	399115	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
27	NC_018027	CGACC	2	10	400063	400072	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
28	NC_018027	CTTCC	2	10	423008	423017	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
29	NC_018027	TGCCG	2	10	436331	436340	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
30	NC_018027	GTTCG	2	10	481147	481156	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
31	NC_018027	CACCC	2	10	537345	537354	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
32	NC_018027	CGTAT	2	10	544632	544641	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NC_018027	GCCCG	2	10	545415	545424	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
34	NC_018027	GCCGG	2	10	545746	545755	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
35	NC_018027	CGCTG	2	10	563844	563853	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
36	NC_018027	TCCCG	2	10	613647	613656	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
37	NC_018027	CGGCC	2	10	629393	629402	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
38	NC_018027	CAGGA	2	10	715187	715196	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
39	NC_018027	GCCCC	2	10	735731	735740	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
40	NC_018027	GCGGT	2	10	737283	737292	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
41	NC_018027	CCGGT	2	10	738684	738693	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
42	NC_018027	GTCAC	2	10	740418	740427	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
43	NC_018027	TTGCA	2	10	754927	754936	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
44	NC_018027	CACCG	2	10	784891	784900	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
45	NC_018027	TCGCT	2	10	795991	796000	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
46	NC_018027	CGTAG	2	10	801066	801075	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
47	NC_018027	GGCGC	2	10	819349	819358	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
48	NC_018027	GAAGA	2	10	825902	825911	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018027	GGCGT	2	10	827060	827069	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
50	NC_018027	AGGGG	2	10	829200	829209	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018027	GACGG	2	10	831942	831951	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
52	NC_018027	CTGCG	2	10	834622	834631	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
53	NC_018027	GGAGC	2	10	865471	865480	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
54	NC_018027	CCGCA	2	10	892184	892193	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
55	NC_018027	CCGTG	2	10	912878	912887	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
56	NC_018027	AGCGA	2	10	937030	937039	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
57	NC_018027	GGAAA	2	10	963285	963294	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018027	GACGG	2	10	965996	966005	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
59	NC_018027	GCCGG	2	10	1022627	1022636	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
60	NC_018027	CACAC	2	10	1058971	1058980	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
61	NC_018027	TGCGC	2	10	1064373	1064382	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
62	NC_018027	CAGAA	2	10	1064484	1064493	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
63	NC_018027	GCCCA	2	10	1094731	1094740	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
64	NC_018027	CCGGC	2	10	1148373	1148382	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
65	NC_018027	GTGAC	2	10	1155515	1155524	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
66	NC_018027	CGATC	2	10	1178125	1178134	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
67	NC_018027	GAAGC	2	10	1182443	1182452	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
68	NC_018027	CCGGC	2	10	1184776	1184785	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
69	NC_018027	CTCTT	2	10	1216955	1216964	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
70	NC_018027	GAGTG	2	10	1228480	1228489	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018027	GGGCC	2	10	1277342	1277351	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
72	NC_018027	GAGCC	2	10	1288595	1288604	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
73	NC_018027	GTCCG	2	10	1304307	1304316	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
74	NC_018027	TGGTT	2	10	1315382	1315391	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018027	GCCGC	2	10	1328080	1328089	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
76	NC_018027	AGGCT	2	10	1330752	1330761	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
77	NC_018027	GGAAC	2	10	1333785	1333794	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
78	NC_018027	GAAAC	2	10	1335272	1335281	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
79	NC_018027	TCAGG	2	10	1344641	1344650	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
80	NC_018027	CTCGG	2	10	1346854	1346863	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
81	NC_018027	GGGGC	2	10	1351005	1351014	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
82	NC_018027	CCGCA	2	10	1369019	1369028	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
83	NC_018027	TCGTT	2	10	1381565	1381574	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
84	NC_018027	CGGCA	2	10	1405969	1405978	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
85	NC_018027	ACCGC	2	10	1424839	1424848	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
86	NC_018027	GAATT	2	10	1426422	1426431	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018027	ACGGC	2	10	1427983	1427992	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
88	NC_018027	ACCTG	2	10	1434881	1434890	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
89	NC_018027	TCGGT	2	10	1436661	1436670	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
90	NC_018027	CACCC	2	10	1455482	1455491	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
91	NC_018027	GCCGG	2	10	1467746	1467755	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
92	NC_018027	GGCCC	2	10	1470194	1470203	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
93	NC_018027	GCCGG	2	10	1481661	1481670	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
94	NC_018027	AGCCT	2	10	1492575	1492584	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
95	NC_018027	CAGGA	2	10	1495826	1495835	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
96	NC_018027	CCCGC	2	10	1501988	1501997	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
97	NC_018027	CGCCA	2	10	1502155	1502164	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
98	NC_018027	GGTGT	2	10	1513846	1513855	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018027	CCCGG	2	10	1518359	1518368	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
100	NC_018027	AACAG	2	10	1518515	1518524	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
101	NC_018027	CGGCG	2	10	1526226	1526235	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
102	NC_018027	CTGCG	2	10	1542441	1542450	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
103	NC_018027	ACGGA	2	10	1547114	1547123	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
104	NC_018027	ATACG	2	10	1567596	1567605	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
105	NC_018027	ACTTT	2	10	1593900	1593909	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_018027	GCGCA	2	10	1651196	1651205	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
107	NC_018027	CAAGC	2	10	1666560	1666569	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
108	NC_018027	CGACA	2	10	1666854	1666863	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
109	NC_018027	GGCAG	2	10	1666965	1666974	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
110	NC_018027	CTGAA	2	10	1669822	1669831	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
111	NC_018027	GAACG	2	10	1674349	1674358	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
112	NC_018027	GCAGC	2	10	1681831	1681840	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
113	NC_018027	AGCGC	2	10	1696552	1696561	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
114	NC_018027	CGTCG	2	10	1697175	1697184	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
115	NC_018027	TCCGG	2	10	1697593	1697602	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
116	NC_018027	CGCGG	2	10	1709534	1709543	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
117	NC_018027	CAGGC	2	10	1709764	1709773	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
118	NC_018027	CGCGG	2	10	1723203	1723212	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
119	NC_018027	GTGAG	2	10	1725356	1725365	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018027	TCGGT	2	10	1725601	1725610	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
121	NC_018027	CATGC	2	10	1737237	1737246	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
122	NC_018027	GGCAA	2	10	1772002	1772011	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
123	NC_018027	CGCGG	2	10	1772149	1772158	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
124	NC_018027	GGCGG	2	10	1793174	1793183	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
125	NC_018027	ACCGT	2	10	1793259	1793268	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
126	NC_018027	GACAA	2	10	1804162	1804171	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
127	NC_018027	TCTCG	2	10	1855546	1855555	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
128	NC_018027	CGGGT	2	10	1857391	1857400	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
129	NC_018027	AACGC	2	10	1864161	1864170	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
130	NC_018027	CACCG	2	10	1864854	1864863	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
131	NC_018027	CGATT	2	10	1885289	1885298	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
132	NC_018027	CGGGC	2	10	1901726	1901735	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
133	NC_018027	GGCGA	2	10	1908771	1908780	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
134	NC_018027	AGCCG	2	10	1935123	1935132	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
135	NC_018027	CCGAT	2	10	1941891	1941900	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
136	NC_018027	GCAGT	2	10	1951604	1951613	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
137	NC_018027	CGTCC	2	10	1958357	1958366	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
138	NC_018027	TACGA	2	10	1967160	1967169	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
139	NC_018027	GTTAG	2	10	2000063	2000072	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018027	GGGAA	3	15	2011577	2011591	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018027	TGCCG	2	10	2023596	2023605	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
142	NC_018027	GCGCC	2	10	2042006	2042015	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
143	NC_018027	CGCGC	2	10	2046785	2046794	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
144	NC_018027	CCCGG	2	10	2078546	2078555	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
145	NC_018027	GGCGC	2	10	2125617	2125626	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
146	NC_018027	GGCCC	2	10	2126224	2126233	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
147	NC_018027	CCCCG	2	10	2126247	2126256	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
148	NC_018027	CCGGG	2	10	2141276	2141285	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
149	NC_018027	GGCGC	2	10	2150548	2150557	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
150	NC_018027	TCTCT	2	10	2184411	2184420	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
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158	NC_018027	TGCGT	2	10	2308220	2308229	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
159	NC_018027	GCCGG	2	10	2330227	2330236	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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162	NC_018027	TTCAG	2	10	2398570	2398579	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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181	NC_018027	TCGTG	2	10	2723570	2723579	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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192	NC_018027	GCCGA	2	10	2764034	2764043	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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198	NC_018027	GGGCT	2	10	2781112	2781121	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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261	NC_018027	GGTCG	2	10	3598127	3598136	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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265	NC_018027	GTCAG	2	10	3629588	3629597	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
266	NC_018027	CGGAC	2	10	3629630	3629639	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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271	NC_018027	CTGAC	2	10	3662849	3662858	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
272	NC_018027	TGCGG	2	10	3670501	3670510	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
273	NC_018027	GCCCG	2	10	3734399	3734408	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
274	NC_018027	CCCGG	2	10	3775514	3775523	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
275	NC_018027	CTGCG	2	10	3866398	3866407	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
276	NC_018027	TCGCG	2	10	3911882	3911891	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
277	NC_018027	CGTCT	2	10	3919121	3919130	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
278	NC_018027	GGTCT	2	10	3963991	3964000	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
279	NC_018027	CTGGC	2	10	3965615	3965624	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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281	NC_018027	ACACC	2	10	3967210	3967219	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
282	NC_018027	TGACG	2	10	3967648	3967657	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
283	NC_018027	CACGA	2	10	3967985	3967994	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
284	NC_018027	CGTCG	2	10	4001354	4001363	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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392	NC_018027	CCGTG	2	10	5421759	5421768	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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396	NC_018027	CCGGC	2	10	5469936	5469945	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
397	NC_018027	GTCGG	2	10	5470703	5470712	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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401	NC_018027	GTTGC	2	10	5496304	5496313	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
402	NC_018027	CGGTG	2	10	5501153	5501162	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
403	NC_018027	GACTC	2	10	5522597	5522606	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
404	NC_018027	GCGTC	2	10	5523364	5523373	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
405	NC_018027	GGACT	2	10	5526698	5526707	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
406	NC_018027	GTGTT	2	10	5526971	5526980	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
407	NC_018027	GTCCT	2	10	5527643	5527652	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
408	NC_018027	GCCTG	2	10	5534533	5534542	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
409	NC_018027	GCGGA	2	10	5583116	5583125	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.