MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycobacterium chubuense NBB4 chromosome

Total Repeats: 9945

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018027	TCG	2	6	74	79	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_018027	CAC	2	6	253	258	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_018027	GA	3	6	346	351	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018027	GCG	2	6	390	395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_018027	CCG	2	6	424	429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_018027	ACA	2	6	484	489	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_018027	ACG	3	9	492	500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_018027	CT	3	6	507	512	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_018027	CAC	2	6	2095	2100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_018027	GC	3	6	2258	2263	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_018027	CCG	2	6	2269	2274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_018027	CGC	2	6	2291	2296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_018027	CAT	2	6	2308	2313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_018027	CCG	2	6	2356	2361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_018027	CTA	2	6	2405	2410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_018027	AGA	2	6	2443	2448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018027	GGT	2	6	2552	2557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018027	GGT	2	6	2576	2581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018027	CG	3	6	2598	2603	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_018027	GCC	2	6	6557	6562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_018027	CGC	2	6	6648	6653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_018027	GGT	2	6	6672	6677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018027	GCCT	2	8	6719	6726	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
24	NC_018027	TCG	2	6	12949	12954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_018027	TCC	2	6	13035	13040	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_018027	CGG	2	6	15726	15731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_018027	CGC	2	6	15745	15750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_018027	ACC	2	6	15752	15757	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_018027	CCT	2	6	16204	16209	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_018027	GCG	2	6	16291	16296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_018027	GAAT	2	8	16317	16324	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018027	CCG	2	6	16330	16335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_018027	CGC	2	6	16337	16342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_018027	GCA	2	6	16710	16715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_018027	GGA	2	6	16721	16726	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018027	CGG	2	6	17519	17524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_018027	GGC	2	6	21366	21371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_018027	GGC	2	6	21392	21397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_018027	GCCT	2	8	21405	21412	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
40	NC_018027	CTC	2	6	25870	25875	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_018027	GCG	2	6	25882	25887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_018027	CCGTCC	2	12	26368	26379	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_018027	CCA	2	6	26391	26396	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_018027	CGAC	2	8	26409	26416	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
45	NC_018027	CCG	2	6	26432	26437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_018027	CCTC	2	8	27900	27907	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
47	NC_018027	GGT	2	6	27908	27913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018027	GGT	2	6	27935	27940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018027	GCC	2	6	27941	27946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_018027	GC	3	6	27988	27993	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_018027	CAC	2	6	28218	28223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_018027	GCG	2	6	28296	28301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_018027	CCG	2	6	28333	28338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_018027	GCC	2	6	28357	28362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_018027	GCG	2	6	29180	29185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_018027	GTCA	2	8	29190	29197	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_018027	GCCG	2	8	31766	31773	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_018027	GC	3	6	31780	31785	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_018027	GTG	2	6	37227	37232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018027	GGT	2	6	37242	37247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018027	CTC	2	6	38604	38609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_018027	ATC	2	6	40525	40530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_018027	GC	3	6	40591	40596	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_018027	AGG	2	6	40622	40627	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018027	CGT	2	6	40676	40681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_018027	CGG	2	6	40787	40792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_018027	GCC	2	6	40838	40843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_018027	CGG	2	6	40844	40849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_018027	CGG	2	6	41985	41990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_018027	CGG	2	6	42078	42083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_018027	GCC	2	6	42101	42106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_018027	AAC	2	6	42121	42126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_018027	GCA	2	6	42292	42297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_018027	CG	3	6	42343	42348	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75	NC_018027	GAA	2	6	42357	42362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018027	GAT	2	6	42369	42374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018027	AAG	2	6	42392	42397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018027	GTA	2	6	44477	44482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018027	ACGA	2	8	44494	44501	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_018027	GCC	2	6	50277	50282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_018027	CAG	2	6	50291	50296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_018027	GA	3	6	54003	54008	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018027	CGG	2	6	54018	54023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_018027	GT	3	6	55182	55187	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018027	CGA	2	6	56552	56557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_018027	GCGG	2	8	56560	56567	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
87	NC_018027	CGC	2	6	56928	56933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_018027	CGA	2	6	58680	58685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_018027	AGG	2	6	60583	60588	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018027	GCC	2	6	60598	60603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_018027	CGA	2	6	60635	60640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_018027	GCCC	2	8	60713	60720	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
93	NC_018027	GCC	2	6	60721	60726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_018027	C	6	6	60729	60734	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
95	NC_018027	CGG	3	9	60740	60748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_018027	CTC	2	6	61065	61070	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_018027	TCG	2	6	61086	61091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_018027	GCG	2	6	61157	61162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_018027	GGA	2	6	61171	61176	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018027	CGGA	2	8	61198	61205	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
101	NC_018027	ATC	2	6	61242	61247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_018027	A	6	6	61272	61277	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018027	CCGAT	2	10	61391	61400	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
104	NC_018027	GTCT	2	8	63353	63360	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_018027	CTAC	2	8	63370	63377	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_018027	CGA	2	6	63469	63474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_018027	CGC	3	9	63614	63622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_018027	CAGG	2	8	64951	64958	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
109	NC_018027	CCG	2	6	66229	66234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_018027	CAA	2	6	66264	66269	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_018027	GAT	2	6	66273	66278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018027	GC	3	6	66279	66284	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_018027	GC	3	6	66310	66315	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_018027	GCA	2	6	66378	66383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_018027	CGC	2	6	66406	66411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_018027	GTG	2	6	66415	66420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018027	GCG	2	6	70017	70022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_018027	TCT	2	6	70040	70045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_018027	TCA	2	6	70062	70067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_018027	TCGGG	2	10	70083	70092	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
121	NC_018027	AG	3	6	70120	70125	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018027	CG	3	6	70126	70131	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_018027	AGG	2	6	71088	71093	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018027	CGG	2	6	71106	71111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_018027	GCCG	2	8	71160	71167	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_018027	CGC	2	6	71171	71176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_018027	ACC	2	6	71184	71189	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_018027	GCC	2	6	71202	71207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_018027	GCCG	2	8	71217	71224	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130	NC_018027	GCT	2	6	71236	71241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_018027	CGGC	2	8	71279	71286	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_018027	GGA	2	6	71302	71307	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018027	GGCT	2	8	71308	71315	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
134	NC_018027	TGG	2	6	71351	71356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018027	GCC	2	6	71397	71402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_018027	GGA	2	6	71460	71465	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018027	TG	3	6	71472	71477	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018027	CGGT	2	8	71480	71487	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
139	NC_018027	AGT	2	6	71526	71531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018027	GGA	2	6	71589	71594	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018027	GGC	2	6	71629	71634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_018027	GA	3	6	71636	71641	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018027	GGAC	2	8	71737	71744	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
144	NC_018027	GGC	2	6	71758	71763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_018027	TGC	2	6	71775	71780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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147	NC_018027	GTT	2	6	71823	71828	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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286	NC_018027	CG	3	6	156523	156528	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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441	NC_018027	GCC	2	6	275072	275077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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445	NC_018027	CGGC	2	8	275986	275993	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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459	NC_018027	TCC	2	6	281485	281490	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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463	NC_018027	CCG	2	6	281550	281555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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482	NC_018027	CGG	2	6	303996	304001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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493	NC_018027	CCGGA	2	10	311996	312005	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
494	NC_018027	ACT	2	6	312036	312041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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500	NC_018027	GTG	2	6	312271	312276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

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