MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium chubuense NBB4 plasmid pMYCCH.02

Total Repeats: 54

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018023	CG	3	6	121	126	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_018023	CA	3	6	971	976	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_018023	CA	3	6	6388	6393	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_018023	AC	3	6	7031	7036	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_018023	AC	3	6	15675	15680	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_018023	AG	3	6	24133	24138	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018023	TA	3	6	25311	25316	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018023	GA	3	6	38216	38221	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018023	CG	3	6	38568	38573	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_018023	GC	3	6	42213	42218	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_018023	CA	3	6	42383	42388	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_018023	GC	3	6	42740	42745	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_018023	AG	3	6	44133	44138	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018023	GT	3	6	46168	46173	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018023	GA	4	8	47516	47523	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018023	GC	3	6	47828	47833	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_018023	GC	3	6	48261	48266	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_018023	AG	3	6	50197	50202	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018023	TC	3	6	55391	55396	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_018023	GT	3	6	55397	55402	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018023	CA	3	6	58564	58569	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_018023	GC	3	6	61682	61687	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_018023	CG	3	6	62736	62741	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_018023	GT	3	6	63546	63551	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018023	TC	3	6	65367	65372	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_018023	CA	3	6	66189	66194	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_018023	CG	3	6	66219	66224	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_018023	GC	3	6	66426	66431	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_018023	CA	3	6	67211	67216	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_018023	AC	3	6	67879	67884	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_018023	CA	3	6	67885	67890	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_018023	GC	3	6	74102	74107	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_018023	GC	3	6	74727	74732	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_018023	GC	3	6	76750	76755	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_018023	AC	3	6	79647	79652	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_018023	TG	3	6	89346	89351	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018023	AT	3	6	90962	90967	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018023	GC	4	8	95053	95060	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_018023	GA	3	6	97779	97784	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018023	GC	3	6	97874	97879	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_018023	GC	3	6	98295	98300	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_018023	GT	4	8	100200	100207	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018023	TG	3	6	110494	110499	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018023	CT	3	6	116842	116847	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_018023	GC	3	6	117284	117289	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_018023	GC	3	6	117937	117942	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_018023	TC	3	6	121360	121365	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_018023	CG	3	6	121750	121755	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_018023	GC	3	6	122521	122526	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_018023	GT	3	6	122634	122639	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018023	CG	3	6	122852	122857	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_018023	TG	3	6	132276	132281	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018023	TG	3	6	133485	133490	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018023	CG	4	8	135512	135519	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.