MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium chubuense NBB4 plasmid pMYCCH.02

Total Repeats: 349

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018023	GCG	2	6	33	38	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_018023	CGG	2	6	59	64	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_018023	CGG	2	6	948	953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_018023	CGC	2	6	954	959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_018023	CAG	2	6	963	968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_018023	GCA	2	6	984	989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_018023	GGC	2	6	994	999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_018023	ACG	2	6	1012	1017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_018023	CGG	2	6	1140	1145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_018023	TGG	2	6	3528	3533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018023	GTT	2	6	3540	3545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018023	GGC	3	9	3564	3572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_018023	ACC	3	9	3624	3632	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_018023	CGG	2	6	3674	3679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_018023	CGA	2	6	3693	3698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_018023	CGG	2	6	3772	3777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_018023	GTC	2	6	3787	3792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_018023	CTA	2	6	5461	5466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_018023	GCG	2	6	5572	5577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_018023	CGC	2	6	5624	5629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_018023	GGC	2	6	5690	5695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_018023	GCT	2	6	5703	5708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_018023	CGA	2	6	5777	5782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_018023	CGG	2	6	6019	6024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_018023	GAT	2	6	6087	6092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018023	CCG	2	6	6204	6209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_018023	CCA	2	6	6384	6389	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_018023	CGA	2	6	6712	6717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_018023	CAG	2	6	6853	6858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_018023	GCG	2	6	7000	7005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_018023	ATG	2	6	7050	7055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018023	GGC	2	6	7078	7083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_018023	ACA	2	6	7104	7109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_018023	GGT	2	6	7147	7152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018023	GAA	2	6	8710	8715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018023	CTC	2	6	10177	10182	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_018023	CGA	2	6	10217	10222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_018023	CCT	2	6	10240	10245	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_018023	CAA	2	6	10272	10277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_018023	ACG	2	6	10345	10350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_018023	ATC	2	6	10401	10406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_018023	TCG	2	6	10501	10506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_018023	TCA	2	6	10525	10530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_018023	GGA	2	6	10599	10604	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018023	AGC	2	6	12146	12151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_018023	GCA	2	6	13243	13248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_018023	TAA	2	6	21477	21482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018023	AGG	2	6	21550	21555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018023	GCC	2	6	24064	24069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_018023	GTT	2	6	24155	24160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018023	CAT	2	6	24177	24182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_018023	AGG	2	6	24194	24199	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018023	GCC	2	6	25938	25943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_018023	TGA	2	6	27788	27793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018023	GAC	2	6	31572	31577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_018023	GCG	2	6	31578	31583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_018023	TGC	2	6	32806	32811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_018023	CGA	2	6	32936	32941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_018023	GAA	2	6	33060	33065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018023	GAA	2	6	34523	34528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018023	TGG	2	6	36038	36043	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018023	GGA	2	6	36050	36055	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018023	TCC	2	6	36060	36065	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_018023	CGC	2	6	36068	36073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_018023	CGC	2	6	37894	37899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_018023	GGC	2	6	37914	37919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_018023	CGC	2	6	38027	38032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_018023	GAC	2	6	38043	38048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_018023	CGT	2	6	38180	38185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_018023	GAC	2	6	38597	38602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_018023	CGC	2	6	38653	38658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_018023	CGG	2	6	42159	42164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_018023	CGT	2	6	42200	42205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_018023	GCG	2	6	42272	42277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_018023	GGA	2	6	42399	42404	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018023	GTG	2	6	42446	42451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018023	GCC	2	6	42499	42504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_018023	GAT	2	6	42697	42702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018023	CGT	2	6	44203	44208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_018023	GTC	2	6	45940	45945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_018023	GAA	2	6	45967	45972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018023	GTG	2	6	46099	46104	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018023	AAT	2	6	46159	46164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018023	TGC	2	6	46302	46307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_018023	ATC	2	6	46360	46365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_018023	GGC	2	6	46421	46426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_018023	GAC	2	6	46430	46435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_018023	CGA	2	6	46484	46489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_018023	CGC	2	6	47318	47323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_018023	ACG	2	6	47347	47352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_018023	CCA	2	6	47415	47420	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_018023	CGG	2	6	47475	47480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_018023	AGT	2	6	47535	47540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018023	GCA	2	6	47576	47581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_018023	GGA	2	6	47597	47602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018023	GGA	2	6	47660	47665	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018023	CGA	3	9	47813	47821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_018023	ACA	2	6	47835	47840	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_018023	GCA	2	6	47847	47852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_018023	CGG	2	6	47907	47912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_018023	ACG	2	6	47963	47968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_018023	CGC	2	6	47976	47981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_018023	CGG	2	6	48182	48187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_018023	ACA	2	6	48240	48245	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_018023	CCG	2	6	48275	48280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_018023	GGA	2	6	48352	48357	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018023	CGT	2	6	50102	50107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_018023	CGA	2	6	50132	50137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_018023	GAA	3	9	50177	50185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018023	GCT	2	6	52374	52379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_018023	CGT	2	6	52429	52434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_018023	CAT	2	6	54152	54157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_018023	GCC	2	6	54271	54276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_018023	CGA	2	6	54300	54305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_018023	CGA	2	6	58266	58271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_018023	CGG	2	6	58545	58550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_018023	CGC	3	9	58669	58677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_018023	GGC	2	6	58678	58683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_018023	AGC	2	6	59886	59891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_018023	GGT	2	6	61257	61262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018023	CCG	2	6	61443	61448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_018023	CGG	2	6	61474	61479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_018023	AAG	2	6	61489	61494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018023	CGG	2	6	61551	61556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_018023	CAA	2	6	61583	61588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_018023	TGC	2	6	61703	61708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_018023	CCA	2	6	61794	61799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_018023	AGA	2	6	61978	61983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018023	CAG	2	6	62039	62044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_018023	GAG	2	6	62775	62780	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018023	GCC	2	6	62784	62789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_018023	CCT	2	6	63413	63418	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_018023	TCG	2	6	63427	63432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_018023	CGA	2	6	63456	63461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_018023	ACG	3	9	63473	63481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_018023	GGC	2	6	63501	63506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_018023	CGG	2	6	63556	63561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_018023	CGC	2	6	63572	63577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_018023	TCC	2	6	65380	65385	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_018023	GCG	2	6	65391	65396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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276	NC_018023	GAC	2	6	117814	117819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
277	NC_018023	TTC	2	6	117948	117953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
278	NC_018023	CGC	2	6	117984	117989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
279	NC_018023	CGG	2	6	118019	118024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
280	NC_018023	CAC	2	6	118036	118041	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
281	NC_018023	CGT	2	6	118054	118059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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297	NC_018023	GCC	2	6	122294	122299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.